33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_07441 on replicon BN001304
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_07441  Actin-related protein 4 (Actin-like protein arp4)(Actin-like protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW89]  100 
 
 
472 aa  970    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05320  53 kda brg1-associated factor b (actin-related protein baf53b), putative  32.57 
 
 
476 aa  251  2e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0277221  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31192  predicted protein  30.66 
 
 
425 aa  241  1e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0140439  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65353  actin-related protein  30.19 
 
 
494 aa  221  1.9999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_51545  predicted protein  29.12 
 
 
377 aa  181  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04650  actin  28.45 
 
 
377 aa  178  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.479636  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69529  Actin  28.36 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51157  actin/actin like protein  28.94 
 
 
377 aa  176  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289764  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29812  predicted protein  28.94 
 
 
377 aa  176  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.550808  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29136  actin/actin like protein  28.72 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01953  Actin-related protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y772]  27.13 
 
 
380 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108777  normal  0.0547316 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44089  actin related protein  27.04 
 
 
391 aa  157  6e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.549451  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36282  centractin- actin-related protein of the dynactin complex  25.87 
 
 
411 aa  155  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.574061 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01330  actin ii (centractin-like protein), putative  25.76 
 
 
377 aa  149  9e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20837  actin related protein  27.18 
 
 
463 aa  143  7e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36825  endocytosis and membrane growth and polarity  25.89 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.240853  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00673  arp2 homolog (Eurofung)  24.63 
 
 
388 aa  113  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913852  normal  0.363518 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06542  Actin, gamma [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P20359]  40.26 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271372  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39896  predicted protein  25.67 
 
 
416 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213761  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29609  predicted protein  21.67 
 
 
407 aa  98.6  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00127301  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03340  actin binding protein, putative  23.37 
 
 
390 aa  99  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48682  general RNA polymerase II transcription factor  21.71 
 
 
429 aa  97.4  5e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0296051  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84432  actin-related protein  23.78 
 
 
419 aa  87.8  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05140  actin binding protein, putative  22.46 
 
 
438 aa  84.7  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45153  predicted protein  29.37 
 
 
523 aa  84.3  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.978768  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1671  actin/actin family protein  22 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188498  normal  0.0238434 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00140  putative arp3 homolog (Eurofung)  22.55 
 
 
434 aa  77.4  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07009  Actin-like protein arp6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXH1]  27.3 
 
 
479 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56314  actin-related protein  22.65 
 
 
402 aa  60.1  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0289584  normal  0.219633 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09359  chromatin remodeling complex subunit (Arp9), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02330)  32.26 
 
 
667 aa  57  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.42377  normal  0.0103389 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01210  hypothetical protein  22.58 
 
 
613 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01830  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  22.71 
 
 
724 aa  55.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0158802  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02210  nucleus protein, putative  32.47 
 
 
779 aa  43.9  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0446179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>