12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB02210 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB02210  nucleus protein, putative  100 
 
 		 779 aa  1599    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0446179  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05911  nuclear actin-related protein (Eurofung)  33.42 
 
 		 619 aa  215  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80286  actin-related protein  32.08 
 
 		 835 aa  210  7e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0163475 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36825  endocytosis and membrane growth and polarity  25.37 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.240853  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00673  arp2 homolog (Eurofung)  37.14 
 
 		 388 aa  54.3  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913852  normal  0.363518 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29812  predicted protein  23.08 
 
 		 377 aa  51.2  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.550808  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51157  actin/actin like protein  23.08 
 
 		 377 aa  51.2  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289764  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29136  actin/actin like protein  23.08 
 
 		 377 aa  51.2  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06542  Actin, gamma [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P20359]  22.22 
 
 		 375 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271372  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03340  actin binding protein, putative  22.3 
 
 		 390 aa  48.9  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69529  Actin  21.64 
 
 		 376 aa  48.1  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04650  actin  21.89 
 
 		 377 aa  47.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.479636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>