35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_41017 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009360  OSTLU_41017  predicted protein  100 
 
 		 358 aa  732    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000637788  normal  0.733987 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04650  actin  24.35 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.479636  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51157  actin/actin like protein  25.45 
 
 		 377 aa  105  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289764  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29812  predicted protein  25.45 
 
 		 377 aa  105  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.550808  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29136  actin/actin like protein  25.71 
 
 		 377 aa  105  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_51545  predicted protein  24.68 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06542  Actin, gamma [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P20359]  23.9 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69529  Actin  23.14 
 
 		 376 aa  97.4  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44089  actin related protein  25.35 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.549451  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01330  actin ii (centractin-like protein), putative  24.92 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1671  actin/actin family protein  25.49 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188498  normal  0.0238434 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36282  centractin- actin-related protein of the dynactin complex  23.4 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.574061 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00673  arp2 homolog (Eurofung)  24.65 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913852  normal  0.363518 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36825  endocytosis and membrane growth and polarity  25.86 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.240853  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01953  Actin-related protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y772]  23.43 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108777  normal  0.0547316 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29609  predicted protein  23.96 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00127301  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03340  actin binding protein, putative  25.45 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  26.79 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  27.67 
 
 		 344 aa  49.3  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2835  rod shape-determining protein Mbl  23.59 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  26.16 
 
 		 349 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  28.48 
 
 		 343 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45153  predicted protein  23.73 
 
 		 523 aa  46.6  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.978768  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84432  actin-related protein  21.99 
 
 		 419 aa  46.6  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1207  rod shape-determining protein MreB  23.93 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000344928  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1248  rod shape-determining protein MreB  23.93 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0105666  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  26.92 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31192  predicted protein  18.91 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0140439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  21.99 
 
 		 347 aa  44.3  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01210  hypothetical protein  26.45 
 
 		 613 aa  43.9  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  28.57 
 
 		 347 aa  43.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  28.57 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  30.77 
 
 		 1196 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48682  general RNA polymerase II transcription factor  18.86 
 
 		 429 aa  42.7  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0296051  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  25.43 
 
 		 344 aa  42.7  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>