More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1207 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1207  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 336 aa  655    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000344928  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1248  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 336 aa  655    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0105666  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0464  rod shape-determining protein MreB  65.37 
 
 		 335 aa  426  1e-118  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0920  rod shape-determining protein MreB  61.72 
 
 		 336 aa  412  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  52.35 
 
 		 342 aa  351  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  52.5 
 
 		 344 aa  350  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  52.41 
 
 		 342 aa  350  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0335  rod shape-determining protein MreB  51.06 
 
 		 334 aa  349  3e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  52.41 
 
 		 339 aa  347  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  53.8 
 
 		 344 aa  347  2e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1149  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  51.79 
 
 		 344 aa  345  7e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000405935  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2374  rod shape-determining protein Mbl  52.62 
 
 		 342 aa  345  8e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0449993  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  52.28 
 
 		 346 aa  345  8.999999999999999e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  55.17 
 
 		 344 aa  345  8.999999999999999e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  53.68 
 
 		 340 aa  345  8.999999999999999e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  51.69 
 
 		 345 aa  343  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  52.47 
 
 		 339 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0109  rod shape-determining protein Mbl  51.35 
 
 		 343 aa  342  4e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  51.52 
 
 		 343 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  50.9 
 
 		 346 aa  340  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2133  rod shape-determining protein Mbl  51.43 
 
 		 343 aa  339  2.9999999999999998e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 343 aa  340  2.9999999999999998e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 347 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 347 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2749  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  51.23 
 
 		 339 aa  339  4e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2835  rod shape-determining protein Mbl  50.31 
 
 		 345 aa  339  4e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  50.9 
 
 		 347 aa  339  5e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  52.91 
 
 		 344 aa  339  5e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  50.61 
 
 		 343 aa  339  5e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  51.21 
 
 		 347 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  52.38 
 
 		 348 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0348  rod shape-determining protein MreB  52.42 
 
 		 336 aa  338  7e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0865019  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0330  rod shape-determining protein MreB  52.42 
 
 		 336 aa  338  7e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000934452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 		 354 aa  337  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  52.91 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5404  rod shape-determining protein Mbl  51.72 
 
 		 333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000385561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5128  rod shape-determining protein Mbl  51.72 
 
 		 333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000379199  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4962  rod shape-determining protein Mbl  51.69 
 
 		 333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.96321e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4974  rod shape-determining protein Mbl  51.69 
 
 		 333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000021016  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  52.45 
 
 		 343 aa  336  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  52.35 
 
 		 348 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3798  rod shape-determining protein Mbl  51.69 
 
 		 333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000087539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5520  rod shape-determining protein Mbl  51.72 
 
 		 333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5455  rod shape-determining protein Mbl  51.72 
 
 		 333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5369  rod shape-determining protein Mbl  51.72 
 
 		 333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.813722 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  52.15 
 
 		 343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  52.35 
 
 		 347 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  50.9 
 
 		 346 aa  335  5e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 343 aa  335  7e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5400  rod shape-determining protein Mbl  51.41 
 
 		 333 aa  335  7e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000418455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5550  rod shape-determining protein Mbl  51.41 
 
 		 333 aa  335  7e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000581144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  50.93 
 
 		 345 aa  334  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  51.5 
 
 		 343 aa  334  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3394  rod shape-determining protein Mbl  50.78 
 
 		 333 aa  334  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0242  rod shape-determining protein MreB  54.09 
 
 		 329 aa  333  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5077  rod shape-determining protein Mbl  51.1 
 
 		 333 aa  333  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000326742  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 346 aa  334  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3282  rod shape-determining protein Mbl  49.84 
 
 		 333 aa  332  4e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000125947  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 347 aa  332  5e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 347 aa  332  5e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  52.15 
 
 		 343 aa  332  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0061  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  52.62 
 
 		 337 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  51.66 
 
 		 339 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  53.35 
 
 		 340 aa  331  9e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  51.82 
 
 		 344 aa  331  9e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  51.82 
 
 		 344 aa  331  9e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  50.74 
 
 		 346 aa  331  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  51.52 
 
 		 344 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  50.6 
 
 		 344 aa  331  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 348 aa  331  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  50.31 
 
 		 343 aa  330  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  52.12 
 
 		 344 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  50.78 
 
 		 350 aa  329  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  51.82 
 
 		 344 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  51.52 
 
 		 344 aa  329  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  52.38 
 
 		 342 aa  329  4e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  51.8 
 
 		 347 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  50.61 
 
 		 343 aa  328  6e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  49.7 
 
 		 340 aa  328  6e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1465  rod shape-determining protein MreB  52.1 
 
 		 345 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28948  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2155  rod shape-determining protein Mbl  52.32 
 
 		 345 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  49.1 
 
 		 347 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  51.52 
 
 		 344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12650  rod shape-determining protein MreB  51.84 
 
 		 345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  49.55 
 
 		 346 aa  327  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  50.78 
 
 		 344 aa  325  5e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2445  rod shape-determining protein Mbl  51.7 
 
 		 345 aa  325  5e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0330  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  49.85 
 
 		 348 aa  325  8.000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  50.75 
 
 		 346 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 		 336 aa  325  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1461  rod shape-determining protein MreB  49.1 
 
 		 347 aa  324  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000397491  unclonable  0.000000242005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0940  rod shape-determining protein MreB  51.53 
 
 		 345 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0933  rod shape-determining protein MreB  51.53 
 
 		 345 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.283099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1005  rod shape-determining protein MreB  49.7 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4763  rod shape-determining protein Mbl  50.62 
 
 		 328 aa  323  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000280779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  51.53 
 
 		 345 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1917  rod shape-determining protein MreB  47.85 
 
 		 340 aa  323  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.695972  hitchhiker  0.000105138 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  50.91 
 
 		 343 aa  323  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>