More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3137 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3137  actin/actin family protein  100 
 
 		 386 aa  780    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340047  normal  0.74971 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2259  actin-like ATPase  29.54 
 
 		 346 aa  157  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000332471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  30.62 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  26.09 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  28 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  26.98 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0330  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  27.8 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  26.02 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  25.16 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1874  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  28.48 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0348  rod shape-determining protein MreB  26.54 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0865019  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0330  rod shape-determining protein MreB  26.54 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000934452  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  25.4 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0187  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  29.08 
 
 		 344 aa  67  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00128251  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  25.38 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2125  rod shape-determining protein MreB  27.73 
 
 		 345 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.55936  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0868  rod shape-determining protein MreB  27.73 
 
 		 345 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4763  rod shape-determining protein Mbl  24.82 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000280779  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  26.32 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1210  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  24.69 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00104336  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  24.53 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  26.09 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  24.61 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  25.53 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  25.23 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20741  rod shape-determining protein MreB  26.58 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.637014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  27.21 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1199  rod shape-determining protein MreB  26.58 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1465  rod shape-determining protein MreB  31.52 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28948  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  26.09 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  25.1 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  26.17 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  26.17 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0670  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  27.71 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  26.03 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  24.51 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0920  rod shape-determining protein MreB  25.4 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  27.08 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  25.08 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12650  rod shape-determining protein MreB  26.29 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1397  rod shape-determining protein MreB  26.71 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1780  rod shape-determining protein MreB  27.13 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2728  rod shape-determining protein MreB  26.95 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000992624  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0317  rod shape-determining protein MreB  27.73 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.594365  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3394  rod shape-determining protein Mbl  26.42 
 
 		 333 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  26.6 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  25.87 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  25.28 
 
 		 347 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  25.93 
 
 		 343 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0194  rod shape-determining protein MreB  26.15 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  25.53 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00565  putative rod-shape determining protein  25.86 
 
 		 342 aa  62  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.444637  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2194  rod shape-determining protein MreB  26.36 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00417366  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0320  rod shape-determining protein MreB  25.1 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  25.53 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  25.53 
 
 		 344 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0942  rod shape-determining protein MreB  26.36 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258331  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  25.68 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0169  rod shape-determining protein MreB  26.17 
 
 		 347 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  26.79 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2749  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  25.97 
 
 		 339 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0035  rod shape-determining protein MreB  26.36 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0180616  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0335  rod shape-determining protein MreB  23.41 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0082  rod shape-determining protein MreB  26.4 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0933  rod shape-determining protein MreB  26.89 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.283099  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0819  rod shape-determining protein MreB  26.36 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17481  rod shape-determining protein MreB  25.98 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0856  rod shape-determining protein MreB  26.44 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18321  rod shape-determining protein MreB  24.07 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1715  rod shape-determining protein MreB  24.07 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0849  rod shape-determining protein MreB  26.36 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156686  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1586  rod shape-determining protein MreB  26.36 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0940  rod shape-determining protein MreB  26.89 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0973  rod shape-determining protein MreB  26.89 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118066  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  26.89 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  26.71 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  25 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  26.79 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  26.89 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  25.87 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  26.89 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0838  rod shape-determining protein MreB  26.89 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00330287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  25.87 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1694  rod shape-determining protein MreB  26.09 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0325  rod shape-determining protein MreB  26.09 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208455  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18141  rod shape-determining protein MreB  24.25 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.208246  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0303  rod shape-determining protein MreB  26.09 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1127  rod shape-determining protein MreB  27.06 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000227657  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  25.48 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  25.48 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  25.48 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5095  rod shape-determining protein MreB  25.77 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0808  rod shape-determining protein MreB  26.4 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58150  rod shape-determining protein MreB  25.77 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.138961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1248  rod shape-determining protein MreB  25.59 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0105666  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  25.39 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1207  rod shape-determining protein MreB  25.59 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000344928  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1352  rod shape-determining protein MreB  27.73 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.261173  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1263  rod shape-determining protein MreB  26.88 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18111  rod shape-determining protein MreB  23.81 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.165952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>