More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0194 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0194  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 340 aa  687    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0808  rod shape-determining protein MreB  73.53 
 
 		 340 aa  518  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5925  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  70.45 
 
 		 341 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3308  rod shape-determining protein MreB  69.05 
 
 		 342 aa  489  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0785141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3832  rod shape-determining protein MreB  65.98 
 
 		 341 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.11388 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0249  rod shape-determining protein MreB  64.81 
 
 		 343 aa  462  1e-129  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00565  putative rod-shape determining protein  65.48 
 
 		 342 aa  463  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.444637  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1458  rod shape-determining protein MreB  64.97 
 
 		 336 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1407  rod shape-determining protein MreB  63.39 
 
 		 342 aa  454  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.321094  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1396  rod shape-determining protein MreB  60.88 
 
 		 339 aa  412  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0333198 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1874  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  59.23 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1290  rod shape-determining protein MreB  56.51 
 
 		 342 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69839  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0848  rod shape-determining protein MreB  56.3 
 
 		 351 aa  350  3e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000008182  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0553  rod shape-determining protein MreB  56.51 
 
 		 345 aa  347  1e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.212626 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0800  rod shape-determining protein MreB  55.59 
 
 		 342 aa  346  3e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0512  rod shape-determining protein MreB  55.49 
 
 		 342 aa  345  8e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.370229  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0691  rod shape-determining protein MreB  54.01 
 
 		 342 aa  342  5e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.444485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1820  rod shape-determining protein MreB  54.01 
 
 		 342 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  49.26 
 
 		 342 aa  323  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  50.6 
 
 		 343 aa  322  7e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  48.2 
 
 		 346 aa  321  9.000000000000001e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  48.52 
 
 		 343 aa  318  7.999999999999999e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  50.6 
 
 		 343 aa  318  7.999999999999999e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  48.52 
 
 		 343 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  50.45 
 
 		 344 aa  317  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  48.49 
 
 		 342 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 346 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  50.6 
 
 		 347 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  48.33 
 
 		 343 aa  313  2.9999999999999996e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  50.45 
 
 		 340 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1734  rod shape-determining protein MreB  49.7 
 
 		 344 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000550029  normal  0.180064 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  48.5 
 
 		 346 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  48.19 
 
 		 342 aa  312  6.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  51.53 
 
 		 340 aa  311  9e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  51.38 
 
 		 354 aa  311  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  48.95 
 
 		 340 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  49.55 
 
 		 344 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  48.77 
 
 		 344 aa  310  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2128  rod shape-determining protein MreB  50.45 
 
 		 348 aa  310  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  48.95 
 
 		 346 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  51.18 
 
 		 343 aa  309  4e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  49.1 
 
 		 346 aa  309  5e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 347 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 347 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  49.1 
 
 		 347 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  50.29 
 
 		 336 aa  308  6.999999999999999e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  47.01 
 
 		 346 aa  308  8e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2374  rod shape-determining protein Mbl  46.65 
 
 		 342 aa  307  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0449993  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  48.54 
 
 		 348 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  46.99 
 
 		 345 aa  307  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  49.7 
 
 		 348 aa  306  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  48.34 
 
 		 344 aa  305  7e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  47.88 
 
 		 340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  48.97 
 
 		 347 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  48.33 
 
 		 343 aa  304  1.0000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  50.45 
 
 		 346 aa  304  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0492  rod shape-determining protein MreB  47.59 
 
 		 346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152747  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 347 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 		 359 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_002620  TC0082  rod shape-determining protein MreB  50.61 
 
 		 366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  49.7 
 
 		 344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  49.7 
 
 		 344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  46.15 
 
 		 350 aa  303  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  50.15 
 
 		 344 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  46.97 
 
 		 343 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  47.46 
 
 		 346 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  46.99 
 
 		 347 aa  303  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0325  rod shape-determining protein MreB  47.34 
 
 		 346 aa  302  4.0000000000000003e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208455  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0303  rod shape-determining protein MreB  47.34 
 
 		 346 aa  302  4.0000000000000003e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  49.25 
 
 		 348 aa  303  4.0000000000000003e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  49.4 
 
 		 344 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1694  rod shape-determining protein MreB  47.63 
 
 		 346 aa  302  5.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  48.34 
 
 		 343 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1397  rod shape-determining protein MreB  48.66 
 
 		 345 aa  302  7.000000000000001e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  47.71 
 
 		 349 aa  301  8.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  48.95 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  48.95 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  47.43 
 
 		 346 aa  301  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  48.3 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  48.77 
 
 		 339 aa  301  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  49.4 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  49.4 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0670  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  47.34 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  47.89 
 
 		 342 aa  300  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  48.04 
 
 		 339 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  46.79 
 
 		 344 aa  300  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2133  rod shape-determining protein Mbl  46.87 
 
 		 343 aa  300  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  47.01 
 
 		 346 aa  299  4e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  48.51 
 
 		 349 aa  299  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  49.41 
 
 		 348 aa  299  4e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  49.69 
 
 		 339 aa  299  5e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  48.63 
 
 		 358 aa  299  5e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0169  rod shape-determining protein MreB  48.2 
 
 		 347 aa  299  6e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2125  rod shape-determining protein MreB  47.77 
 
 		 345 aa  298  7e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.55936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  48.96 
 
 		 348 aa  298  7e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>