More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2509 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  94.24 
 
 		 347 aa  651    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 347 aa  691    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  92.8 
 
 		 347 aa  635    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 347 aa  691    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  91.35 
 
 		 347 aa  630  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  87.9 
 
 		 347 aa  609  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  85.59 
 
 		 347 aa  588  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  81.74 
 
 		 348 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  75.51 
 
 		 344 aa  525  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  73.33 
 
 		 346 aa  509  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  71.76 
 
 		 344 aa  501  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  72.06 
 
 		 344 aa  502  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  72.35 
 
 		 344 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  71.76 
 
 		 344 aa  501  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  71.89 
 
 		 343 aa  499  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  70.88 
 
 		 344 aa  494  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  71.3 
 
 		 346 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  70.59 
 
 		 344 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  70.72 
 
 		 346 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  70.59 
 
 		 344 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  70.72 
 
 		 346 aa  488  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  70.43 
 
 		 346 aa  486  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  68.6 
 
 		 347 aa  477  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2820  rod shape-determining protein MreB  71.01 
 
 		 346 aa  461  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  67.64 
 
 		 343 aa  459  9.999999999999999e-129  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  65.89 
 
 		 346 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  66.67 
 
 		 354 aa  457  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  64.93 
 
 		 346 aa  451  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  64.55 
 
 		 348 aa  451  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  64.9 
 
 		 343 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  64.6 
 
 		 342 aa  442  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  63.88 
 
 		 347 aa  441  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  64.04 
 
 		 346 aa  442  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0100  rod shape-determining protein MreB  63.1 
 
 		 347 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  64.35 
 
 		 347 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  63.2 
 
 		 345 aa  439  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  63.2 
 
 		 345 aa  439  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  63.74 
 
 		 346 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  63.77 
 
 		 347 aa  438  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  65.59 
 
 		 344 aa  438  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  64.35 
 
 		 348 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  63.77 
 
 		 347 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  63.77 
 
 		 347 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  64.71 
 
 		 343 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  64.07 
 
 		 347 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  64.01 
 
 		 343 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  62.8 
 
 		 343 aa  439  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1412  rod shape-determining protein MreB  64.41 
 
 		 344 aa  438  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000497097  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  63.8 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  63.8 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  63.55 
 
 		 339 aa  434  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  63.8 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  63.77 
 
 		 347 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  63.8 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  62.72 
 
 		 340 aa  437  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  63.8 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  63.8 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  63.8 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  63.8 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  63.8 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  63.8 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  63.8 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  63.8 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  63.8 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  63.8 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  63.8 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  64.12 
 
 		 343 aa  437  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  62.84 
 
 		 347 aa  431  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1005  rod shape-determining protein MreB  61.08 
 
 		 347 aa  432  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  61.79 
 
 		 349 aa  432  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00264  rod shape-determining protein MreB  63.02 
 
 		 347 aa  431  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000119217  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  62.84 
 
 		 347 aa  431  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  63.28 
 
 		 348 aa  434  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  62.69 
 
 		 348 aa  433  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0933  rod shape-determining protein MreB  62.16 
 
 		 345 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.283099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  62.16 
 
 		 345 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0940  rod shape-determining protein MreB  62.16 
 
 		 345 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0483  rod shape-determining protein MreB  64.37 
 
 		 347 aa  428  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0515  rod shape-determining protein MreB  62.13 
 
 		 352 aa  430  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  66.37 
 
 		 336 aa  430  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0260  rod shape-determining protein MreB  63.27 
 
 		 347 aa  428  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.516664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  61.56 
 
 		 347 aa  430  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1648  rod shape-determining protein MreB  62.13 
 
 		 352 aa  430  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.03031e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  61.27 
 
 		 347 aa  431  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12650  rod shape-determining protein MreB  61.56 
 
 		 345 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  61.79 
 
 		 349 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  61.98 
 
 		 350 aa  428  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0973  rod shape-determining protein MreB  62.16 
 
 		 345 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118066  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0183  rod shape-determining protein MreB  62.72 
 
 		 347 aa  430  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000147765  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  61.79 
 
 		 349 aa  430  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0169  rod shape-determining protein MreB  61.08 
 
 		 347 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0856  rod shape-determining protein MreB  62.16 
 
 		 345 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  61.86 
 
 		 345 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  61.86 
 
 		 345 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2491  rod shape-determining protein MreB  64.43 
 
 		 347 aa  427  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00448666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  62.95 
 
 		 349 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  60.6 
 
 		 342 aa  425  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2728  rod shape-determining protein MreB  63.53 
 
 		 347 aa  425  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000992624  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  60.9 
 
 		 342 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  62.57 
 
 		 347 aa  427  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>