More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1412 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1412  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
344 aa  682    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000497097  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  66.47 
 
 
347 aa  471  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  65.59 
 
 
346 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  65.88 
 
 
344 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  65.88 
 
 
344 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  64.9 
 
 
346 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  65.59 
 
 
344 aa  464  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  65.59 
 
 
344 aa  464  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  65.69 
 
 
343 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  65.58 
 
 
347 aa  461  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  64.14 
 
 
346 aa  461  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  65.28 
 
 
347 aa  462  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  64.41 
 
 
347 aa  461  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  64.41 
 
 
347 aa  461  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  68.5 
 
 
348 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  64.14 
 
 
346 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  68.5 
 
 
347 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  65 
 
 
344 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  65.29 
 
 
344 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  66.76 
 
 
348 aa  458  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  64.72 
 
 
346 aa  457  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  67.25 
 
 
346 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  64.12 
 
 
347 aa  454  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  67.83 
 
 
346 aa  456  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  66.57 
 
 
347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  64.71 
 
 
344 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  65.29 
 
 
344 aa  453  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  66.57 
 
 
347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  66.86 
 
 
347 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  66.86 
 
 
347 aa  451  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  66.86 
 
 
347 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  66.86 
 
 
347 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  66.86 
 
 
347 aa  451  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  66.57 
 
 
347 aa  449  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  66.86 
 
 
347 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  66.86 
 
 
347 aa  451  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  65.88 
 
 
342 aa  451  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  66.86 
 
 
347 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  66.86 
 
 
347 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  66.86 
 
 
347 aa  450  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  66.86 
 
 
347 aa  451  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  66.17 
 
 
347 aa  449  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  66.86 
 
 
347 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  66.86 
 
 
347 aa  451  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  66.86 
 
 
347 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  64.12 
 
 
347 aa  451  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  66.86 
 
 
347 aa  451  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  66.86 
 
 
347 aa  451  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  66.86 
 
 
347 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  65.68 
 
 
348 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0100  rod shape-determining protein MreB  64.69 
 
 
347 aa  441  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  63.69 
 
 
347 aa  441  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  65.48 
 
 
345 aa  443  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  65.48 
 
 
345 aa  443  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  65.98 
 
 
348 aa  443  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  65.68 
 
 
347 aa  442  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  62.65 
 
 
347 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2240  rod shape-determining protein MreB  66.07 
 
 
345 aa  443  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  65.68 
 
 
347 aa  442  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0169  rod shape-determining protein MreB  65.28 
 
 
347 aa  444  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2728  rod shape-determining protein MreB  66.67 
 
 
347 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000992624  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1005  rod shape-determining protein MreB  64.39 
 
 
347 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0260  rod shape-determining protein MreB  65.42 
 
 
347 aa  437  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.516664  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0049  rod shape-determining protein MreB  65.29 
 
 
347 aa  441  9.999999999999999e-123  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.483131  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0183  rod shape-determining protein MreB  64.99 
 
 
347 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000147765  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  65.98 
 
 
349 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  65.68 
 
 
349 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0933  rod shape-determining protein MreB  63.22 
 
 
345 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.283099  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  63.22 
 
 
345 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0330  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  63.31 
 
 
348 aa  434  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111648  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  63.22 
 
 
345 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0838  rod shape-determining protein MreB  63.22 
 
 
345 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00330287  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0973  rod shape-determining protein MreB  63.22 
 
 
345 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118066  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0515  rod shape-determining protein MreB  64.45 
 
 
352 aa  436  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1648  rod shape-determining protein MreB  64.45 
 
 
352 aa  436  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.03031e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0940  rod shape-determining protein MreB  63.22 
 
 
345 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  63.22 
 
 
345 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  65.98 
 
 
349 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0483  rod shape-determining protein MreB  64.37 
 
 
347 aa  435  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  61.42 
 
 
348 aa  434  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  60.88 
 
 
343 aa  431  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5095  rod shape-determining protein MreB  62.64 
 
 
345 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00264  rod shape-determining protein MreB  64.69 
 
 
347 aa  434  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000119217  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0856  rod shape-determining protein MreB  63.22 
 
 
345 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58150  rod shape-determining protein MreB  62.64 
 
 
345 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.138961  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12650  rod shape-determining protein MreB  62.83 
 
 
345 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0497  rod shape-determining protein MreB  66.86 
 
 
349 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0518  rod shape-determining protein MreB  66.86 
 
 
349 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000418886  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2834  rod shape-determining protein MreB  63.5 
 
 
347 aa  430  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000019673  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0320  rod shape-determining protein MreB  64.04 
 
 
352 aa  428  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0514  rod shape-determining protein MreB  65.38 
 
 
348 aa  428  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  63.91 
 
 
347 aa  430  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3822  rod shape-determining protein MreB  66.86 
 
 
349 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000619946  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  63.91 
 
 
347 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000533641  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0522  rod shape-determining protein MreB  66.86 
 
 
349 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000845532  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0574  rod shape-determining protein MreB  66.57 
 
 
349 aa  427  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000161982  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4098  rod shape-determining protein MreB  66.57 
 
 
349 aa  427  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0467  rod shape-determining protein MreB  66.86 
 
 
349 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000395514  normal  0.671219 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  61.14 
 
 
343 aa  425  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3648  rod shape-determining protein MreB  66.57 
 
 
349 aa  427  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000380554  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>