More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0470 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 342 aa  679    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  84.21 
 
 		 346 aa  577  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  82.37 
 
 		 348 aa  572  1.0000000000000001e-162  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  80.7 
 
 		 346 aa  551  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  74.04 
 
 		 346 aa  505  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0492  rod shape-determining protein MreB  73.37 
 
 		 346 aa  495  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152747  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  72.35 
 
 		 347 aa  492  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0595  rod shape-determining protein MreB  70.75 
 
 		 345 aa  476  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4032  rod shape-determining protein MreB  68.45 
 
 		 366 aa  474  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467853 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2128  rod shape-determining protein MreB  70.54 
 
 		 348 aa  470  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1627  rod shape-determining protein MreB  69.55 
 
 		 348 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  66.96 
 
 		 347 aa  461  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3645  rod shape-determining protein MreB  67.46 
 
 		 353 aa  462  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2329  rod shape-determining protein MreB  67.75 
 
 		 345 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1003  rod shape-determining protein MreB  67.75 
 
 		 345 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1600  rod shape-determining protein MreB  68.34 
 
 		 345 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0473  rod shape-determining protein MreB  69.64 
 
 		 348 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.836992  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  65.68 
 
 		 347 aa  450  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  65.09 
 
 		 347 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  65.67 
 
 		 344 aa  444  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  64.5 
 
 		 347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  65.78 
 
 		 347 aa  443  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  64.2 
 
 		 344 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  65.37 
 
 		 344 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  64.6 
 
 		 347 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  64.6 
 
 		 347 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  64.99 
 
 		 343 aa  443  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  64.78 
 
 		 344 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  63.02 
 
 		 346 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  62.06 
 
 		 346 aa  435  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  63.61 
 
 		 344 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  63.31 
 
 		 344 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  63.31 
 
 		 344 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  62.13 
 
 		 346 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  62.43 
 
 		 346 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  63.99 
 
 		 344 aa  431  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1412  rod shape-determining protein MreB  65.88 
 
 		 344 aa  429  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000497097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0260  rod shape-determining protein MreB  65.12 
 
 		 347 aa  427  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.516664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0169  rod shape-determining protein MreB  64.16 
 
 		 347 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  63.55 
 
 		 345 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  63.55 
 
 		 345 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  60.71 
 
 		 346 aa  422  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  63.66 
 
 		 348 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  63.96 
 
 		 348 aa  422  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  61.7 
 
 		 347 aa  423  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  62.17 
 
 		 347 aa  421  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  64.95 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  64.95 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  63.66 
 
 		 347 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  64.95 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0856  rod shape-determining protein MreB  63.28 
 
 		 345 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  64.95 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  64.95 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  64.95 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  64.95 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0320  rod shape-determining protein MreB  64.06 
 
 		 352 aa  420  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  62.8 
 
 		 348 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  64.95 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  63.66 
 
 		 347 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  65.26 
 
 		 347 aa  420  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  65.26 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0183  rod shape-determining protein MreB  63.86 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000147765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  62.5 
 
 		 342 aa  418  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  64.95 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  64.95 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  64.95 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  64.95 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  64.95 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  62.8 
 
 		 347 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  64.95 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  64.95 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  61.36 
 
 		 348 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0933  rod shape-determining protein MreB  62.69 
 
 		 345 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.283099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1258  rod shape-determining protein MreB  64.79 
 
 		 358 aa  414  9.999999999999999e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  62.99 
 
 		 345 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5095  rod shape-determining protein MreB  62.69 
 
 		 345 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00264  rod shape-determining protein MreB  63.55 
 
 		 347 aa  414  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000119217  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  62.99 
 
 		 345 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1005  rod shape-determining protein MreB  62.65 
 
 		 347 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0838  rod shape-determining protein MreB  62.99 
 
 		 345 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00330287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  62.69 
 
 		 345 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0973  rod shape-determining protein MreB  62.69 
 
 		 345 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118066  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2834  rod shape-determining protein MreB  63.25 
 
 		 347 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000019673  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  63.36 
 
 		 349 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  61.01 
 
 		 346 aa  415  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0940  rod shape-determining protein MreB  62.69 
 
 		 345 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2240  rod shape-determining protein MreB  61.82 
 
 		 345 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  62.76 
 
 		 349 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  62.5 
 
 		 342 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  63.06 
 
 		 349 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58150  rod shape-determining protein MreB  62.69 
 
 		 345 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.138961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  64.35 
 
 		 347 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  62.61 
 
 		 343 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  64.65 
 
 		 347 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12650  rod shape-determining protein MreB  61.34 
 
 		 345 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  58.28 
 
 		 340 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2491  rod shape-determining protein MreB  64.55 
 
 		 347 aa  413  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00448666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0049  rod shape-determining protein MreB  64.65 
 
 		 347 aa  412  1e-114  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.483131  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  64.35 
 
 		 347 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2728  rod shape-determining protein MreB  62.99 
 
 		 347 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000992624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>