More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0492 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0492  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 346 aa  693    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152747  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1627  rod shape-determining protein MreB  84.97 
 
 		 348 aa  592  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2128  rod shape-determining protein MreB  82.9 
 
 		 348 aa  587  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4023  rod shape-determining protein MreB  72.67 
 
 		 350 aa  497  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  73.37 
 
 		 342 aa  495  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  73.05 
 
 		 346 aa  491  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  69.73 
 
 		 348 aa  463  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  66.18 
 
 		 346 aa  463  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0595  rod shape-determining protein MreB  69.3 
 
 		 345 aa  461  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  68.41 
 
 		 346 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3645  rod shape-determining protein MreB  67.58 
 
 		 353 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  64.06 
 
 		 347 aa  453  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2010  rod shape-determining protein MreB  68.5 
 
 		 346 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0860436  normal  0.0126369 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4032  rod shape-determining protein MreB  64.83 
 
 		 366 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467853 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0473  rod shape-determining protein MreB  67.58 
 
 		 348 aa  430  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.836992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2329  rod shape-determining protein MreB  64.97 
 
 		 345 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1003  rod shape-determining protein MreB  64.97 
 
 		 345 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1600  rod shape-determining protein MreB  65.27 
 
 		 345 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  62.24 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  61.93 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  61.54 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  61.72 
 
 		 343 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  61.01 
 
 		 346 aa  414  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  62.54 
 
 		 347 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  62.65 
 
 		 345 aa  408  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  62.65 
 
 		 345 aa  408  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  61.7 
 
 		 347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  60.29 
 
 		 347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  59.29 
 
 		 346 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  60.29 
 
 		 347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  61.42 
 
 		 347 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  59.23 
 
 		 346 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1005  rod shape-determining protein MreB  61.09 
 
 		 347 aa  404  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  60.24 
 
 		 348 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2728  rod shape-determining protein MreB  59.4 
 
 		 347 aa  398  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000992624  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  60 
 
 		 347 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  58.33 
 
 		 346 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  60 
 
 		 348 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  59.94 
 
 		 348 aa  400  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0169  rod shape-determining protein MreB  60.49 
 
 		 347 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  60.24 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  60.24 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  60.91 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3126  rod shape-determining protein MreB  61.42 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  60.24 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  59.64 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0162  rod shape-determining protein MreB  61.42 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0525916  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  60.24 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  59.35 
 
 		 344 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  60.24 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0366  rod shape-determining protein MreB  61.42 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6461  rod shape-determining protein MreB  61.42 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0181  rod shape-determining protein MreB  61.42 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306812  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  60.24 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2294  rod shape-determining protein MreB  61.42 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.691991  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3048  rod shape-determining protein MreB  61.42 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0146  rod shape-determining protein MreB  61.42 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.949868  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  59.23 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  60.24 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  60.91 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  60.24 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4398  rod shape-determining protein MreB  61.42 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3107  rod shape-determining protein MreB  61.42 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0052  rod shape-determining protein MreB  61.42 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.618949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  60.24 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2496  rod shape-determining protein MreB  61.42 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485441  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  60.24 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0183  rod shape-determining protein MreB  59.94 
 
 		 347 aa  396  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000147765  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0326  rod shape-determining protein MreB  61.42 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  60.24 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  60.24 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2374  rod shape-determining protein MreB  61.42 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3165  rod shape-determining protein MreB  61.42 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3367  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  59.23 
 
 		 346 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  60.24 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3110  rod shape-determining protein MreB  61.42 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0170  rod shape-determining protein MreB  61.42 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.695664  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  60.24 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  60.24 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2785  rod shape-determining protein MreB  61.13 
 
 		 347 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0933  rod shape-determining protein MreB  59.4 
 
 		 345 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.283099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0100  rod shape-determining protein MreB  57.86 
 
 		 347 aa  393  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  59.64 
 
 		 347 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  59.4 
 
 		 345 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  59.4 
 
 		 345 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0973  rod shape-determining protein MreB  59.4 
 
 		 345 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118066  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  58.75 
 
 		 349 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  59.4 
 
 		 345 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0260  rod shape-determining protein MreB  61.83 
 
 		 347 aa  394  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.516664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0940  rod shape-determining protein MreB  59.4 
 
 		 345 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0838  rod shape-determining protein MreB  59.4 
 
 		 345 aa  391  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00330287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  59.05 
 
 		 349 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0320  rod shape-determining protein MreB  62.31 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  59.64 
 
 		 347 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  59.35 
 
 		 347 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2240  rod shape-determining protein MreB  58.51 
 
 		 345 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1248  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  58.98 
 
 		 345 aa  392  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0506008  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  59.35 
 
 		 347 aa  393  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  58.93 
 
 		 344 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  59.94 
 
 		 347 aa  394  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>