More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0595 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0595  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 345 aa  689    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3645  rod shape-determining protein MreB  89.88 
 
 		 353 aa  622  1e-177  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4032  rod shape-determining protein MreB  87.91 
 
 		 366 aa  614  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467853 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0473  rod shape-determining protein MreB  92.04 
 
 		 348 aa  605  9.999999999999999e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.836992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2329  rod shape-determining protein MreB  90.56 
 
 		 345 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1600  rod shape-determining protein MreB  91.15 
 
 		 345 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1003  rod shape-determining protein MreB  90.56 
 
 		 345 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  71.93 
 
 		 346 aa  505  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  70.75 
 
 		 342 aa  476  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  68.6 
 
 		 346 aa  468  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  68.34 
 
 		 347 aa  467  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  67.55 
 
 		 348 aa  464  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0492  rod shape-determining protein MreB  69.3 
 
 		 346 aa  461  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152747  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  67.95 
 
 		 346 aa  450  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1627  rod shape-determining protein MreB  66.36 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2128  rod shape-determining protein MreB  65.58 
 
 		 348 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  60.83 
 
 		 347 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  59.82 
 
 		 347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  59.52 
 
 		 347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  59.23 
 
 		 347 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4023  rod shape-determining protein MreB  58.86 
 
 		 350 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  57.74 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  57.74 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  61.82 
 
 		 343 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1412  rod shape-determining protein MreB  62.73 
 
 		 344 aa  393  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000497097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  58.58 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  58.63 
 
 		 346 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  58.08 
 
 		 346 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  61.09 
 
 		 347 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  60.49 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  60.49 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  54.63 
 
 		 340 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  60.49 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  57.78 
 
 		 339 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  58.48 
 
 		 349 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  57.61 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0856  rod shape-determining protein MreB  57.65 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  60.49 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  60.49 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  60.49 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  60.18 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  58.79 
 
 		 349 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  60.49 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  60.49 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  57.77 
 
 		 346 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  60.49 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  60.49 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  60.49 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  57.91 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  60.49 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  60.49 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5095  rod shape-determining protein MreB  57.35 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  60.49 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  58.48 
 
 		 349 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  60.49 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  60.49 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  60.49 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  55.79 
 
 		 340 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2834  rod shape-determining protein MreB  59.88 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000019673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  58.97 
 
 		 344 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58150  rod shape-determining protein MreB  57.35 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.138961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  60.18 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  58.79 
 
 		 346 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0933  rod shape-determining protein MreB  56.76 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.283099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1258  rod shape-determining protein MreB  58.81 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  57.14 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  56.76 
 
 		 345 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1005  rod shape-determining protein MreB  58.36 
 
 		 347 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0497  rod shape-determining protein MreB  59.39 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000391443  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  56.89 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  56.76 
 
 		 345 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  57.31 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0518  rod shape-determining protein MreB  59.39 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000418886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  56.55 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  56.48 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0838  rod shape-determining protein MreB  56.76 
 
 		 345 aa  378  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00330287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0940  rod shape-determining protein MreB  56.76 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3822  rod shape-determining protein MreB  59.39 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000619946  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  57.74 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0973  rod shape-determining protein MreB  56.76 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118066  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  57.44 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0183  rod shape-determining protein MreB  59.57 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000147765  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  59.88 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1248  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  57.61 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0506008  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  56.76 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  58.79 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0522  rod shape-determining protein MreB  59.39 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000845532  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  57.44 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  56.8 
 
 		 343 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4098  rod shape-determining protein MreB  59.09 
 
 		 349 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  58.66 
 
 		 343 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  59.02 
 
 		 345 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  59.02 
 
 		 345 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0467  rod shape-determining protein MreB  59.09 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000395514  normal  0.671219 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12650  rod shape-determining protein MreB  57.19 
 
 		 345 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  57.45 
 
 		 348 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0169  rod shape-determining protein MreB  58.36 
 
 		 347 aa  375  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3738  rod shape-determining protein MreB  59.09 
 
 		 349 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000049309  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3648  rod shape-determining protein MreB  59.09 
 
 		 349 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000380554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  55.06 
 
 		 348 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>