More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3339 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
343 aa  684    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  85.13 
 
 
343 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  78.65 
 
 
343 aa  560  1e-158  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  78.43 
 
 
344 aa  546  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  72.7 
 
 
340 aa  510  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  69.53 
 
 
346 aa  485  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  68.44 
 
 
340 aa  482  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  71.51 
 
 
346 aa  480  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  69.23 
 
 
343 aa  471  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  68.28 
 
 
338 aa  471  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  67.27 
 
 
343 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  66.18 
 
 
340 aa  461  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  68.58 
 
 
339 aa  462  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0445  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  66.57 
 
 
337 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0596021 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  66.37 
 
 
347 aa  457  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  68.07 
 
 
344 aa  455  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  65.49 
 
 
347 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  62.94 
 
 
343 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  65.58 
 
 
342 aa  448  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  63.91 
 
 
368 aa  447  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  66.27 
 
 
339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  66.27 
 
 
339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  62.54 
 
 
346 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  66.87 
 
 
340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  66.27 
 
 
339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  66.27 
 
 
339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  66.27 
 
 
339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  64.5 
 
 
347 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  66.27 
 
 
339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  62.35 
 
 
343 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  66.27 
 
 
339 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  65.66 
 
 
338 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  65.28 
 
 
342 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  64.6 
 
 
347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  66.27 
 
 
339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  66.27 
 
 
339 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  66.27 
 
 
339 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  65.26 
 
 
339 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  62.76 
 
 
344 aa  441  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  64.01 
 
 
347 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  64.01 
 
 
347 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  59.71 
 
 
343 aa  438  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  63.61 
 
 
344 aa  438  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  61.54 
 
 
346 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  63.33 
 
 
345 aa  441  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  62.13 
 
 
346 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  60.83 
 
 
342 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  61.68 
 
 
344 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  61.42 
 
 
344 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  61.72 
 
 
344 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  62.31 
 
 
343 aa  437  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  61.42 
 
 
344 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  61.72 
 
 
344 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  61.72 
 
 
344 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  61.24 
 
 
346 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  63.66 
 
 
343 aa  433  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  61.42 
 
 
344 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  62.43 
 
 
346 aa  431  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  60.29 
 
 
344 aa  428  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  62.54 
 
 
350 aa  428  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  61.09 
 
 
345 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  61.36 
 
 
347 aa  426  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2133  rod shape-determining protein Mbl  59.94 
 
 
343 aa  426  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  63.31 
 
 
342 aa  427  1e-118  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  63.33 
 
 
336 aa  427  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  61.38 
 
 
349 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  61.42 
 
 
343 aa  427  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  62.72 
 
 
347 aa  423  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  61.26 
 
 
339 aa  421  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1529  rod shape-determining protein MreB  62.61 
 
 
342 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0844761  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1388  rod shape-determining protein MreB  59.94 
 
 
343 aa  424  1e-117  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  61.06 
 
 
348 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0109  rod shape-determining protein Mbl  60.18 
 
 
343 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  58.93 
 
 
354 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1461  rod shape-determining protein MreB  61.29 
 
 
347 aa  413  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000397491  unclonable  0.000000242005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  61.24 
 
 
346 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  60.48 
 
 
348 aa  413  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  62.12 
 
 
358 aa  411  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1694  rod shape-determining protein MreB  59.64 
 
 
346 aa  410  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0187  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  59.23 
 
 
344 aa  409  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00128251  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0325  rod shape-determining protein MreB  59.35 
 
 
346 aa  409  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208455  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  59.44 
 
 
344 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2125  rod shape-determining protein MreB  59.52 
 
 
345 aa  408  1e-113  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.55936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  59.88 
 
 
342 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0303  rod shape-determining protein MreB  59.35 
 
 
346 aa  409  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0866  MreB/Mrl family cell shape determining protein  62.12 
 
 
335 aa  409  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0300  rod shape-determining protein MreB  61.56 
 
 
345 aa  410  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0868  rod shape-determining protein MreB  59.52 
 
 
345 aa  409  1e-113  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  59.09 
 
 
344 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1150  rod shape-determining protein MreB  60.18 
 
 
345 aa  411  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564796 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  61.7 
 
 
358 aa  409  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  60.12 
 
 
359 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  59 
 
 
344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4777  rod shape-determining protein MreB  60.55 
 
 
353 aa  405  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529713  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  61.13 
 
 
342 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1397  rod shape-determining protein MreB  59.82 
 
 
345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2374  rod shape-determining protein Mbl  58.01 
 
 
342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0449993  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2820  rod shape-determining protein MreB  61.83 
 
 
346 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0317  rod shape-determining protein MreB  58.75 
 
 
345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.594365  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  61.24 
 
 
345 aa  404  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>