More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3308 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3308  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 342 aa  680    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0785141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5925  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  81.23 
 
 		 341 aa  568  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3832  rod shape-determining protein MreB  75.95 
 
 		 341 aa  536  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.11388 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0249  rod shape-determining protein MreB  73.98 
 
 		 343 aa  527  1e-148  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0808  rod shape-determining protein MreB  71.76 
 
 		 340 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0194  rod shape-determining protein MreB  69.05 
 
 		 340 aa  489  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00565  putative rod-shape determining protein  64.04 
 
 		 342 aa  458  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.444637  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1458  rod shape-determining protein MreB  62.69 
 
 		 336 aa  448  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1407  rod shape-determining protein MreB  60.23 
 
 		 342 aa  444  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.321094  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1396  rod shape-determining protein MreB  59.41 
 
 		 339 aa  400  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0333198 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1874  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  59.36 
 
 		 336 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1290  rod shape-determining protein MreB  53.8 
 
 		 342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69839  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0553  rod shape-determining protein MreB  54.68 
 
 		 345 aa  354  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.212626 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0691  rod shape-determining protein MreB  53.51 
 
 		 342 aa  353  2e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.444485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0512  rod shape-determining protein MreB  54.09 
 
 		 342 aa  353  2e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.370229  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0848  rod shape-determining protein MreB  53.22 
 
 		 351 aa  352  5e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000008182  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0800  rod shape-determining protein MreB  54.68 
 
 		 342 aa  352  8e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1820  rod shape-determining protein MreB  53.51 
 
 		 342 aa  348  7e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  51.74 
 
 		 346 aa  344  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  52.63 
 
 		 343 aa  340  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  53.08 
 
 		 342 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 		 342 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  52.3 
 
 		 348 aa  336  3.9999999999999995e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  54.76 
 
 		 336 aa  333  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2128  rod shape-determining protein MreB  51.75 
 
 		 348 aa  332  4e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  50.73 
 
 		 346 aa  332  6e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  51.03 
 
 		 346 aa  331  9e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  51.75 
 
 		 346 aa  331  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  50.75 
 
 		 342 aa  331  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  50.74 
 
 		 343 aa  330  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  49.56 
 
 		 344 aa  329  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  52.23 
 
 		 344 aa  329  4e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  50.45 
 
 		 342 aa  329  4e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  48.97 
 
 		 343 aa  328  6e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  50.73 
 
 		 347 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  48.97 
 
 		 343 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  51.32 
 
 		 347 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  52.07 
 
 		 354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  52.49 
 
 		 347 aa  326  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  48.97 
 
 		 344 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  52.05 
 
 		 345 aa  324  1e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  50.45 
 
 		 340 aa  324  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  51.91 
 
 		 347 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  51.91 
 
 		 347 aa  323  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  52.55 
 
 		 344 aa  322  8e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  49.56 
 
 		 343 aa  321  9.000000000000001e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  50.29 
 
 		 339 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  50.29 
 
 		 339 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 		 343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  51.91 
 
 		 347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  51.9 
 
 		 347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  51.9 
 
 		 347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  49.26 
 
 		 368 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 339 aa  320  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 339 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 339 aa  320  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 339 aa  320  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 339 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 339 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 339 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  50.46 
 
 		 345 aa  320  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 338 aa  320  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  50.59 
 
 		 340 aa  319  5e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  48.97 
 
 		 344 aa  318  6e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  50.87 
 
 		 358 aa  318  7e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 		 340 aa  318  7e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0492  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 346 aa  318  7.999999999999999e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152747  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 339 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  48.08 
 
 		 350 aa  318  1e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  51.79 
 
 		 343 aa  318  1e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  49.55 
 
 		 346 aa  317  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2374  rod shape-determining protein Mbl  47.72 
 
 		 342 aa  318  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0449993  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  51.14 
 
 		 359 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  48.51 
 
 		 343 aa  317  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  50.9 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  50.29 
 
 		 358 aa  317  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  50.9 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  53.47 
 
 		 347 aa  317  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  49.56 
 
 		 340 aa  316  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  51.49 
 
 		 339 aa  316  4e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1734  rod shape-determining protein MreB  46.92 
 
 		 344 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000550029  normal  0.180064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  52.54 
 
 		 344 aa  315  8e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  49.25 
 
 		 343 aa  315  8e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  49.85 
 
 		 345 aa  315  9e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  49.27 
 
 		 346 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  51.22 
 
 		 345 aa  314  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  51.22 
 
 		 345 aa  314  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  49.57 
 
 		 346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 		 349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18111  rod shape-determining protein MreB  49.25 
 
 		 350 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.165952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  48.09 
 
 		 343 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 348 aa  312  4.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18321  rod shape-determining protein MreB  49.25 
 
 		 350 aa  312  6.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1397  rod shape-determining protein MreB  49.7 
 
 		 345 aa  311  7.999999999999999e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 		 348 aa  311  7.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1715  rod shape-determining protein MreB  49.25 
 
 		 350 aa  311  9e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18141  rod shape-determining protein MreB  49.25 
 
 		 424 aa  311  9e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.208246  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1461  rod shape-determining protein MreB  47.81 
 
 		 347 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000397491  unclonable  0.000000242005 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  49.7 
 
 		 344 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  48.21 
 
 		 339 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>