More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3832 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3832  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 341 aa  685    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.11388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5925  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  87.68 
 
 		 341 aa  617  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3308  rod shape-determining protein MreB  75.95 
 
 		 342 aa  536  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0785141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0249  rod shape-determining protein MreB  69.68 
 
 		 343 aa  496  1e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0808  rod shape-determining protein MreB  68.45 
 
 		 340 aa  492  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0194  rod shape-determining protein MreB  65.98 
 
 		 340 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00565  putative rod-shape determining protein  65.2 
 
 		 342 aa  459  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.444637  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1458  rod shape-determining protein MreB  65.07 
 
 		 336 aa  444  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1407  rod shape-determining protein MreB  61 
 
 		 342 aa  442  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.321094  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1396  rod shape-determining protein MreB  57.44 
 
 		 339 aa  395  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0333198 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1874  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  56.98 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0553  rod shape-determining protein MreB  56.23 
 
 		 345 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.212626 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0848  rod shape-determining protein MreB  56.14 
 
 		 351 aa  362  6e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000008182  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0512  rod shape-determining protein MreB  56.43 
 
 		 342 aa  361  1e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.370229  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0800  rod shape-determining protein MreB  56.43 
 
 		 342 aa  360  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1290  rod shape-determining protein MreB  55.72 
 
 		 342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69839  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0691  rod shape-determining protein MreB  54.55 
 
 		 342 aa  351  1e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.444485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1820  rod shape-determining protein MreB  53.96 
 
 		 342 aa  345  7e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  49.55 
 
 		 342 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  50.44 
 
 		 343 aa  334  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  50.74 
 
 		 340 aa  333  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  51.03 
 
 		 340 aa  329  4e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  49.13 
 
 		 346 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  49.56 
 
 		 343 aa  326  3e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 346 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  49.26 
 
 		 343 aa  325  9e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 348 aa  323  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  51.02 
 
 		 347 aa  323  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  48.1 
 
 		 344 aa  322  6e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  50.88 
 
 		 345 aa  322  8e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 342 aa  321  9.000000000000001e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 346 aa  321  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  48.07 
 
 		 343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  48.97 
 
 		 347 aa  320  3e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  48.97 
 
 		 347 aa  320  3e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  49.71 
 
 		 342 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  48.52 
 
 		 343 aa  319  3.9999999999999996e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  49.28 
 
 		 347 aa  319  5e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  48.69 
 
 		 343 aa  319  5e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  49.86 
 
 		 346 aa  319  5e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  48.97 
 
 		 348 aa  318  7.999999999999999e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  49.42 
 
 		 358 aa  318  9e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 		 347 aa  318  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 		 342 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  51.05 
 
 		 336 aa  317  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  48.65 
 
 		 368 aa  318  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  47.97 
 
 		 346 aa  317  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  48.25 
 
 		 344 aa  316  3e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  49.71 
 
 		 358 aa  317  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  50.74 
 
 		 354 aa  317  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  50.58 
 
 		 347 aa  315  5e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 		 347 aa  315  8e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 		 347 aa  315  8e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  47.76 
 
 		 339 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  48.8 
 
 		 340 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  47.76 
 
 		 339 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  48.1 
 
 		 346 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  49.12 
 
 		 347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  48.95 
 
 		 349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 		 344 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1734  rod shape-determining protein MreB  46.76 
 
 		 344 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000550029  normal  0.180064 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 		 344 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  47.34 
 
 		 350 aa  313  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  51.02 
 
 		 347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  50.73 
 
 		 347 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  51.03 
 
 		 344 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  46.75 
 
 		 344 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  49.56 
 
 		 344 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  49.85 
 
 		 344 aa  312  3.9999999999999997e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  47.46 
 
 		 339 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  48.55 
 
 		 346 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  47.46 
 
 		 338 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  47.95 
 
 		 343 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1149  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  47.56 
 
 		 344 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000405935  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 		 348 aa  312  4.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  47.46 
 
 		 339 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  47.46 
 
 		 339 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  47.46 
 
 		 339 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  47.46 
 
 		 339 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  47.46 
 
 		 339 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  47.46 
 
 		 339 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  47.73 
 
 		 345 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  47.46 
 
 		 339 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  47.76 
 
 		 345 aa  311  6.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  47.66 
 
 		 346 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  49.56 
 
 		 344 aa  311  9e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  47.45 
 
 		 339 aa  311  9e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  49.27 
 
 		 344 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  49.85 
 
 		 342 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 		 344 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  48.55 
 
 		 346 aa  310  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  47.09 
 
 		 347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000533641  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  46.43 
 
 		 344 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  47.09 
 
 		 347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  48.08 
 
 		 348 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2374  rod shape-determining protein Mbl  46.06 
 
 		 342 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0449993  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  48.96 
 
 		 343 aa  309  5e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  49.57 
 
 		 344 aa  308  5.9999999999999995e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  48.84 
 
 		 359 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  47.25 
 
 		 349 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>