More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1687 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  100 
 
 
344 aa  680    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  73.55 
 
 
344 aa  518  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  72.09 
 
 
343 aa  515  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  72.38 
 
 
343 aa  511  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  71.8 
 
 
343 aa  514  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  71.8 
 
 
344 aa  505  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  73.37 
 
 
368 aa  496  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  68.93 
 
 
342 aa  486  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  69.01 
 
 
343 aa  474  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  69.82 
 
 
349 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  66.27 
 
 
342 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  63.31 
 
 
350 aa  428  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  59.71 
 
 
343 aa  425  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  60.29 
 
 
340 aa  421  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  60.84 
 
 
346 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  58.53 
 
 
340 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  60.23 
 
 
339 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  59.88 
 
 
344 aa  409  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  58.68 
 
 
342 aa  408  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  58.19 
 
 
343 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  59 
 
 
343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  57.43 
 
 
343 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  58.02 
 
 
343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1529  rod shape-determining protein MreB  61.13 
 
 
342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0844761  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  58.68 
 
 
342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  59.23 
 
 
346 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  57.35 
 
 
346 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  58.81 
 
 
342 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  58.75 
 
 
343 aa  398  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  57.31 
 
 
346 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  57.14 
 
 
347 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  55.59 
 
 
344 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  57.4 
 
 
347 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  56.73 
 
 
346 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  55 
 
 
344 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  58.11 
 
 
348 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  57.36 
 
 
344 aa  393  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  56.55 
 
 
347 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  54.71 
 
 
344 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  56.55 
 
 
347 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  55 
 
 
344 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  54.71 
 
 
344 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  58.31 
 
 
343 aa  392  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  55 
 
 
344 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  54.71 
 
 
344 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  59.15 
 
 
344 aa  391  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  56.25 
 
 
347 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  58.02 
 
 
346 aa  388  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  56.25 
 
 
347 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  56.38 
 
 
346 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  56.25 
 
 
347 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  55.69 
 
 
348 aa  391  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  58.18 
 
 
359 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  55.95 
 
 
347 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  56.76 
 
 
358 aa  385  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  54.76 
 
 
339 aa  386  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0187  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  54.95 
 
 
344 aa  385  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00128251  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  57.1 
 
 
346 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  53.41 
 
 
354 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2133  rod shape-determining protein Mbl  54.79 
 
 
343 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  55.22 
 
 
336 aa  383  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  55.82 
 
 
338 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  57.32 
 
 
358 aa  381  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  54.44 
 
 
340 aa  381  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 
339 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 
339 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 
339 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 
339 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 
339 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 
339 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  57.45 
 
 
340 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 
339 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 
339 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 
339 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  57.1 
 
 
339 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 
339 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  54.38 
 
 
345 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_002620  TC0082  rod shape-determining protein MreB  53.78 
 
 
366 aa  375  1e-103  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  53.03 
 
 
347 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  56.3 
 
 
347 aa  376  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  57.91 
 
 
346 aa  376  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  52.65 
 
 
345 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1397  rod shape-determining protein MreB  53.92 
 
 
345 aa  372  1e-102  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1734  rod shape-determining protein MreB  55.16 
 
 
344 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000550029  normal  0.180064 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0303  rod shape-determining protein MreB  53.15 
 
 
346 aa  372  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0325  rod shape-determining protein MreB  53.15 
 
 
346 aa  372  1e-102  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208455  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1461  rod shape-determining protein MreB  54.41 
 
 
347 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000397491  unclonable  0.000000242005 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1694  rod shape-determining protein MreB  53.45 
 
 
346 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1874  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  57.45 
 
 
336 aa  372  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1388  rod shape-determining protein MreB  55.29 
 
 
343 aa  374  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  51.33 
 
 
348 aa  371  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4777  rod shape-determining protein MreB  55.79 
 
 
353 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529713  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1150  rod shape-determining protein MreB  54.3 
 
 
345 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564796 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0492  rod shape-determining protein MreB  54.14 
 
 
346 aa  371  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152747  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0260  rod shape-determining protein MreB  55.36 
 
 
347 aa  371  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.516664  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  54.12 
 
 
347 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000533641  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0866  MreB/Mrl family cell shape determining protein  55.18 
 
 
335 aa  369  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0300  rod shape-determining protein MreB  54.9 
 
 
345 aa  369  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  54.12 
 
 
347 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  51.6 
 
 
342 aa  371  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>