More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00565 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00565  putative rod-shape determining protein  100 
 
 		 342 aa  689    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.444637  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1458  rod shape-determining protein MreB  88.1 
 
 		 336 aa  610  9.999999999999999e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1407  rod shape-determining protein MreB  82.16 
 
 		 342 aa  596  1e-169  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.321094  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0808  rod shape-determining protein MreB  68.84 
 
 		 340 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0194  rod shape-determining protein MreB  65.48 
 
 		 340 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3832  rod shape-determining protein MreB  65.2 
 
 		 341 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.11388 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3308  rod shape-determining protein MreB  64.04 
 
 		 342 aa  458  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0785141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5925  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  63.64 
 
 		 341 aa  455  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0249  rod shape-determining protein MreB  61.99 
 
 		 343 aa  443  1e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1396  rod shape-determining protein MreB  57.27 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0333198 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1874  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  55.98 
 
 		 336 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0848  rod shape-determining protein MreB  54.39 
 
 		 351 aa  348  9e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000008182  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1290  rod shape-determining protein MreB  53.06 
 
 		 342 aa  346  4e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69839  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0553  rod shape-determining protein MreB  53.35 
 
 		 345 aa  345  5e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.212626 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0512  rod shape-determining protein MreB  53.06 
 
 		 342 aa  343  2e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.370229  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0691  rod shape-determining protein MreB  51.9 
 
 		 342 aa  342  4e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.444485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0800  rod shape-determining protein MreB  53.51 
 
 		 342 aa  342  5e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  50.89 
 
 		 342 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  51.6 
 
 		 343 aa  338  7e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1820  rod shape-determining protein MreB  51.02 
 
 		 342 aa  335  7.999999999999999e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  52.05 
 
 		 343 aa  333  3e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  51.6 
 
 		 344 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  48.26 
 
 		 346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  51.31 
 
 		 343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  53.08 
 
 		 347 aa  326  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  53.67 
 
 		 347 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  52.02 
 
 		 345 aa  325  8.000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  49.4 
 
 		 345 aa  323  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  52.54 
 
 		 347 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  49.7 
 
 		 343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  52.49 
 
 		 347 aa  318  6e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  51.91 
 
 		 347 aa  318  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  51.91 
 
 		 347 aa  318  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 340 aa  318  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  47.38 
 
 		 344 aa  317  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  47.51 
 
 		 343 aa  316  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  49.41 
 
 		 340 aa  316  4e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  46.76 
 
 		 343 aa  316  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  50.58 
 
 		 346 aa  314  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 		 342 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 336 aa  314  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  52.49 
 
 		 347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1694  rod shape-determining protein MreB  48.82 
 
 		 346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  48.21 
 
 		 339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  47.49 
 
 		 344 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 348 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 		 342 aa  312  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  48.28 
 
 		 348 aa  313  3.9999999999999997e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  51.33 
 
 		 343 aa  312  5.999999999999999e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  50.3 
 
 		 344 aa  312  5.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0325  rod shape-determining protein MreB  48.52 
 
 		 346 aa  311  9e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208455  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  48.38 
 
 		 340 aa  311  9e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0303  rod shape-determining protein MreB  48.52 
 
 		 346 aa  311  9e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  47.87 
 
 		 345 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  50.89 
 
 		 344 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  50.89 
 
 		 344 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  47.2 
 
 		 350 aa  310  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  51.78 
 
 		 344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  47.8 
 
 		 346 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  50.44 
 
 		 348 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  50.72 
 
 		 347 aa  309  4e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  50.59 
 
 		 344 aa  309  4e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  48.49 
 
 		 349 aa  308  5.9999999999999995e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  47.76 
 
 		 368 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1397  rod shape-determining protein MreB  48.37 
 
 		 345 aa  308  9e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  48.2 
 
 		 339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3282  rod shape-determining protein Mbl  48.94 
 
 		 333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000125947  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  50.59 
 
 		 344 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  47.66 
 
 		 346 aa  306  3e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 344 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2374  rod shape-determining protein Mbl  46.67 
 
 		 342 aa  306  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0449993  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  50.59 
 
 		 344 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  47.94 
 
 		 340 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  47.2 
 
 		 343 aa  306  4.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2835  rod shape-determining protein Mbl  48.35 
 
 		 345 aa  306  5.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0109  rod shape-determining protein Mbl  48.94 
 
 		 343 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3394  rod shape-determining protein Mbl  48.94 
 
 		 333 aa  305  6e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  45.72 
 
 		 344 aa  305  6e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0739  rod shape-determining protein MreB  48.22 
 
 		 349 aa  305  6e-82  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.766157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  49.25 
 
 		 338 aa  305  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  45.45 
 
 		 343 aa  305  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  48.06 
 
 		 348 aa  305  8.000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  48.98 
 
 		 342 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  46.79 
 
 		 344 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  49.7 
 
 		 354 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  47.42 
 
 		 344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  47.76 
 
 		 347 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1352  rod shape-determining protein MreB  48.97 
 
 		 343 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.261173  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  47.76 
 
 		 347 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3798  rod shape-determining protein Mbl  46.45 
 
 		 333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000087539  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18111  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.165952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  46.87 
 
 		 339 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5404  rod shape-determining protein Mbl  46.83 
 
 		 333 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000385561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5455  rod shape-determining protein Mbl  46.83 
 
 		 333 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  46.87 
 
 		 339 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  46.87 
 
 		 339 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  48.37 
 
 		 342 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  46.87 
 
 		 339 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  46.87 
 
 		 339 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  47.97 
 
 		 359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>