More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0848 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0848  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 351 aa  698    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000008182  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0512  rod shape-determining protein MreB  92.69 
 
 		 342 aa  637    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.370229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1290  rod shape-determining protein MreB  93.86 
 
 		 342 aa  641    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69839  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0800  rod shape-determining protein MreB  91.81 
 
 		 342 aa  634    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0553  rod shape-determining protein MreB  90.94 
 
 		 345 aa  628  1e-179  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.212626 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0691  rod shape-determining protein MreB  88.3 
 
 		 342 aa  611  9.999999999999999e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.444485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1820  rod shape-determining protein MreB  88.01 
 
 		 342 aa  609  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1921  rod shape-determining protein MreB  69.44 
 
 		 340 aa  480  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00289876  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1970  rod shape-determining protein MreB  60.81 
 
 		 372 aa  424  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000114357  normal  0.892505 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1874  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  59.64 
 
 		 336 aa  418  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1111  rod shape-determining protein MreB  60.06 
 
 		 344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  54.97 
 
 		 343 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0249  rod shape-determining protein MreB  55.81 
 
 		 343 aa  369  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  52.19 
 
 		 343 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  54.14 
 
 		 343 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  52.6 
 
 		 358 aa  362  4e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3832  rod shape-determining protein MreB  56.14 
 
 		 341 aa  362  6e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.11388 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  53.12 
 
 		 343 aa  360  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  52.31 
 
 		 358 aa  358  6e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  54.47 
 
 		 344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  51.91 
 
 		 340 aa  355  7.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  50.58 
 
 		 346 aa  354  1e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5925  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  53.8 
 
 		 341 aa  353  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  50.29 
 
 		 342 aa  353  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  52.2 
 
 		 340 aa  352  5e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3308  rod shape-determining protein MreB  53.22 
 
 		 342 aa  352  5e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0785141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  53.98 
 
 		 344 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  53.69 
 
 		 344 aa  352  8e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2238  rod shape-determining protein MreB  50.72 
 
 		 351 aa  351  8.999999999999999e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  53.98 
 
 		 344 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  54.28 
 
 		 344 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  54.28 
 
 		 344 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  53.29 
 
 		 340 aa  350  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  53.98 
 
 		 344 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0194  rod shape-determining protein MreB  56.3 
 
 		 340 aa  350  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4777  rod shape-determining protein MreB  51.2 
 
 		 353 aa  349  5e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529713  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  53.39 
 
 		 344 aa  349  5e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  54.1 
 
 		 336 aa  348  6e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00565  putative rod-shape determining protein  54.39 
 
 		 342 aa  348  9e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.444637  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  49.41 
 
 		 343 aa  348  9e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0808  rod shape-determining protein MreB  53.37 
 
 		 340 aa  347  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  49.57 
 
 		 368 aa  347  1e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  49.41 
 
 		 343 aa  347  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 359 aa  346  4e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  51.02 
 
 		 342 aa  345  5e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 346 aa  345  6e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  49.42 
 
 		 343 aa  345  8.999999999999999e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  50.59 
 
 		 343 aa  342  5e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  51.91 
 
 		 347 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0082  rod shape-determining protein MreB  52.4 
 
 		 366 aa  342  8e-93  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  50.73 
 
 		 347 aa  342  8e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  52.35 
 
 		 346 aa  342  8e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1388  rod shape-determining protein MreB  51.61 
 
 		 343 aa  341  1e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  51.03 
 
 		 343 aa  339  4e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  49.71 
 
 		 349 aa  339  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  49.71 
 
 		 344 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  51.06 
 
 		 342 aa  338  5.9999999999999996e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  50.3 
 
 		 350 aa  338  7e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  51.32 
 
 		 339 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0300  rod shape-determining protein MreB  50.89 
 
 		 345 aa  337  9.999999999999999e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  50.76 
 
 		 342 aa  337  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  53.37 
 
 		 345 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1461  rod shape-determining protein MreB  50.73 
 
 		 347 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000397491  unclonable  0.000000242005 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  49.57 
 
 		 354 aa  336  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1734  rod shape-determining protein MreB  49.7 
 
 		 344 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000550029  normal  0.180064 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1407  rod shape-determining protein MreB  52.19 
 
 		 342 aa  336  3.9999999999999995e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.321094  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1458  rod shape-determining protein MreB  53.12 
 
 		 336 aa  336  3.9999999999999995e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  51.47 
 
 		 347 aa  335  5e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1917  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 		 340 aa  335  5.999999999999999e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.695972  hitchhiker  0.000105138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  47.8 
 
 		 343 aa  335  7e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  50.74 
 
 		 348 aa  334  1e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  47.81 
 
 		 344 aa  334  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1529  rod shape-determining protein MreB  48.68 
 
 		 342 aa  333  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0844761  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  50.44 
 
 		 338 aa  333  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  50.44 
 
 		 347 aa  332  8e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  50 
 
 		 344 aa  331  9e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0866  MreB/Mrl family cell shape determining protein  50.91 
 
 		 335 aa  331  9e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  49.56 
 
 		 347 aa  331  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0149  rod shape-determining protein MreB  50.45 
 
 		 350 aa  331  1e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.126698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  49.56 
 
 		 347 aa  331  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  51.18 
 
 		 348 aa  331  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  49.4 
 
 		 343 aa  330  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  48.53 
 
 		 346 aa  330  2e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  48.22 
 
 		 346 aa  329  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4170  rod shape-determining protein MreB  51.02 
 
 		 349 aa  328  6e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000201977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 		 347 aa  328  8e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  51.78 
 
 		 344 aa  328  8e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01791  rod shape-determining protein MreB  50.29 
 
 		 350 aa  327  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1150  rod shape-determining protein MreB  50.6 
 
 		 345 aa  328  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564796 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  50.58 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0105  rod shape-determining protein MreB  49.71 
 
 		 350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  48.24 
 
 		 346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1149  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  50 
 
 		 344 aa  326  3e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000405935  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0242  rod shape-determining protein MreB  53.73 
 
 		 329 aa  325  5e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  48.21 
 
 		 339 aa  325  6e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  48.21 
 
 		 339 aa  325  6e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0109  rod shape-determining protein Mbl  50 
 
 		 343 aa  324  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18321  rod shape-determining protein MreB  51.2 
 
 		 350 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18141  rod shape-determining protein MreB  51.51 
 
 		 424 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.208246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  47.92 
 
 		 339 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>