More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1921 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1921  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 340 aa  681    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00289876  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0848  rod shape-determining protein MreB  69.44 
 
 		 351 aa  480  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000008182  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0553  rod shape-determining protein MreB  68.55 
 
 		 345 aa  472  1e-132  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.212626 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0512  rod shape-determining protein MreB  68.55 
 
 		 342 aa  473  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.370229  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0800  rod shape-determining protein MreB  67.76 
 
 		 342 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0691  rod shape-determining protein MreB  66.47 
 
 		 342 aa  459  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.444485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1290  rod shape-determining protein MreB  66.57 
 
 		 342 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69839  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1820  rod shape-determining protein MreB  65.97 
 
 		 342 aa  455  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1111  rod shape-determining protein MreB  56.38 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1970  rod shape-determining protein MreB  56.5 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000114357  normal  0.892505 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1874  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  48.2 
 
 		 336 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2238  rod shape-determining protein MreB  46.4 
 
 		 351 aa  315  5e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  46.92 
 
 		 343 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  46.67 
 
 		 349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  46.09 
 
 		 358 aa  299  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  44.64 
 
 		 343 aa  299  5e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  44.88 
 
 		 343 aa  298  8e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  46.27 
 
 		 340 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0249  rod shape-determining protein MreB  45.64 
 
 		 343 aa  295  1e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  46.09 
 
 		 358 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  45.45 
 
 		 343 aa  295  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  45.45 
 
 		 343 aa  294  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3308  rod shape-determining protein MreB  45.03 
 
 		 342 aa  295  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0785141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  44.01 
 
 		 346 aa  292  5e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1529  rod shape-determining protein MreB  44.31 
 
 		 342 aa  291  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0844761  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  45.73 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  47.16 
 
 		 339 aa  290  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  44.48 
 
 		 350 aa  290  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  45.54 
 
 		 344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  46.25 
 
 		 368 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  45.54 
 
 		 344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  46.08 
 
 		 344 aa  289  6e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  42.81 
 
 		 342 aa  289  6e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  45.83 
 
 		 344 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  45.78 
 
 		 344 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  45.24 
 
 		 344 aa  288  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  46.08 
 
 		 344 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1734  rod shape-determining protein MreB  43.24 
 
 		 344 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000550029  normal  0.180064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3832  rod shape-determining protein MreB  45.72 
 
 		 341 aa  285  5.999999999999999e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.11388 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  43.62 
 
 		 347 aa  285  7e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  45.43 
 
 		 340 aa  285  7e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  44.85 
 
 		 336 aa  285  9e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  43.4 
 
 		 342 aa  285  9e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  47.8 
 
 		 345 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4777  rod shape-determining protein MreB  44.98 
 
 		 353 aa  285  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529713  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  44.01 
 
 		 359 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  43.4 
 
 		 342 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  43.92 
 
 		 347 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  44.14 
 
 		 344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  43.95 
 
 		 346 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0300  rod shape-determining protein MreB  43.45 
 
 		 345 aa  282  5.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  42.86 
 
 		 343 aa  282  6.000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  43.98 
 
 		 343 aa  282  7.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  45.12 
 
 		 342 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5925  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  44.57 
 
 		 341 aa  281  9e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  45.07 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1461  rod shape-determining protein MreB  44.12 
 
 		 347 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000397491  unclonable  0.000000242005 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  43.32 
 
 		 347 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4170  rod shape-determining protein MreB  45.35 
 
 		 349 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000201977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1917  rod shape-determining protein MreB  41.76 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.695972  hitchhiker  0.000105138 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0149  rod shape-determining protein MreB  45.18 
 
 		 350 aa  281  2e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.126698  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1388  rod shape-determining protein MreB  44.68 
 
 		 343 aa  280  3e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0866  MreB/Mrl family cell shape determining protein  44.11 
 
 		 335 aa  280  3e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0105  rod shape-determining protein MreB  44.81 
 
 		 350 aa  279  4e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  42.81 
 
 		 343 aa  276  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  42.18 
 
 		 347 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  43.92 
 
 		 344 aa  276  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  44.91 
 
 		 354 aa  276  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  42.12 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0808  rod shape-determining protein MreB  43.31 
 
 		 340 aa  276  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_002620  TC0082  rod shape-determining protein MreB  45.24 
 
 		 366 aa  275  6e-73  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3391  rod shape-determining protein MreB  45.48 
 
 		 352 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.112256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  41.89 
 
 		 347 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  41.89 
 
 		 347 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01791  rod shape-determining protein MreB  44.81 
 
 		 350 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  41.09 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  44.85 
 
 		 344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  42.51 
 
 		 338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4130  rod shape-determining protein MreB  45.34 
 
 		 335 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1150  rod shape-determining protein MreB  41.96 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564796 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  42.14 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  42.14 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  42.14 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  42.14 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  42.14 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  42.14 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  42.14 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  44.65 
 
 		 344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1715  rod shape-determining protein MreB  44.11 
 
 		 350 aa  272  7e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18141  rod shape-determining protein MreB  44.38 
 
 		 424 aa  272  7e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.208246  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  43.03 
 
 		 346 aa  272  7e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0348  rod shape-determining protein MreB  43.28 
 
 		 336 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0865019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  42.14 
 
 		 339 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0330  rod shape-determining protein MreB  43.28 
 
 		 336 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000934452  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18321  rod shape-determining protein MreB  44.11 
 
 		 350 aa  272  8.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  42.81 
 
 		 346 aa  271  9e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2749  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  42.55 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  42.64 
 
 		 347 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17481  rod shape-determining protein MreB  43.32 
 
 		 360 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  41.84 
 
 		 339 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>