More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3465 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 342 aa  687    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  77.22 
 
 		 343 aa  558  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  76.63 
 
 		 343 aa  553  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  75.95 
 
 		 368 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  75.37 
 
 		 343 aa  531  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  74.93 
 
 		 344 aa  529  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  74.85 
 
 		 344 aa  526  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  71.94 
 
 		 343 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  70.21 
 
 		 349 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  68.93 
 
 		 344 aa  486  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  69.23 
 
 		 342 aa  475  1e-133  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  69 
 
 		 350 aa  468  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  63.69 
 
 		 340 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  62.57 
 
 		 343 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  62.76 
 
 		 343 aa  451  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  62.02 
 
 		 340 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  60.7 
 
 		 343 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  60.76 
 
 		 346 aa  441  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  60.83 
 
 		 343 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  62.1 
 
 		 344 aa  434  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  61.49 
 
 		 344 aa  434  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1529  rod shape-determining protein MreB  62.76 
 
 		 342 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0844761  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  59.18 
 
 		 342 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  59.18 
 
 		 342 aa  433  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  60.3 
 
 		 346 aa  428  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  60.3 
 
 		 344 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  60.53 
 
 		 344 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  60.3 
 
 		 344 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  60.9 
 
 		 344 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  60.53 
 
 		 344 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  60.3 
 
 		 344 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  59.82 
 
 		 347 aa  424  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  59.41 
 
 		 343 aa  425  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  59.23 
 
 		 347 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  59.82 
 
 		 347 aa  422  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  60.98 
 
 		 339 aa  421  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  58.33 
 
 		 340 aa  421  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  59.52 
 
 		 347 aa  423  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  59.23 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  59.23 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  62.24 
 
 		 344 aa  420  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  60.42 
 
 		 343 aa  417  9.999999999999999e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  58.56 
 
 		 344 aa  417  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  57.91 
 
 		 346 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  58.43 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  58.38 
 
 		 343 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  57.91 
 
 		 346 aa  411  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  54.95 
 
 		 354 aa  412  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  59.54 
 
 		 358 aa  412  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  58.7 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  59.18 
 
 		 346 aa  408  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  57.93 
 
 		 345 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  58.63 
 
 		 348 aa  408  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  57.23 
 
 		 346 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  58.38 
 
 		 358 aa  404  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1150  rod shape-determining protein MreB  58.58 
 
 		 345 aa  406  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564796 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  59.82 
 
 		 338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  61.28 
 
 		 339 aa  401  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  61.28 
 
 		 339 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  61.28 
 
 		 339 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  59.39 
 
 		 339 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  61.28 
 
 		 339 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  61.28 
 
 		 339 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  58.53 
 
 		 346 aa  403  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  61.28 
 
 		 339 aa  401  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  61.28 
 
 		 339 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  58.33 
 
 		 347 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  61.28 
 
 		 339 aa  401  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  61.28 
 
 		 339 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0300  rod shape-determining protein MreB  59.64 
 
 		 345 aa  403  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  56.89 
 
 		 342 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  55.49 
 
 		 345 aa  401  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  55.76 
 
 		 344 aa  403  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  58.26 
 
 		 346 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  58.01 
 
 		 346 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  60.98 
 
 		 338 aa  401  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  54.46 
 
 		 342 aa  402  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  61.28 
 
 		 339 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  58.51 
 
 		 336 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2749  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  56.92 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0866  MreB/Mrl family cell shape determining protein  56.59 
 
 		 335 aa  395  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0187  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  55.56 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00128251  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1461  rod shape-determining protein MreB  56.72 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000397491  unclonable  0.000000242005 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  58.84 
 
 		 340 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1388  rod shape-determining protein MreB  55.12 
 
 		 343 aa  395  1e-109  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  54.31 
 
 		 348 aa  393  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  54.93 
 
 		 339 aa  393  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3282  rod shape-determining protein Mbl  54.97 
 
 		 333 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000125947  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0109  rod shape-determining protein Mbl  53.96 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0670  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  59.32 
 
 		 347 aa  391  1e-108  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2835  rod shape-determining protein Mbl  55.96 
 
 		 345 aa  392  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  56.55 
 
 		 347 aa  392  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  58.26 
 
 		 344 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  58.51 
 
 		 348 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  58.51 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  56.59 
 
 		 359 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4170  rod shape-determining protein MreB  58.94 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000201977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  55.72 
 
 		 347 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4777  rod shape-determining protein MreB  54.79 
 
 		 353 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3394  rod shape-determining protein Mbl  54.77 
 
 		 333 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>