More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1529 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1529  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 342 aa  674    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0844761  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  68.66 
 
 		 350 aa  457  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  66.77 
 
 		 343 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  66.47 
 
 		 343 aa  456  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  65.1 
 
 		 368 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  65.09 
 
 		 340 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  66.27 
 
 		 349 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  65.88 
 
 		 342 aa  436  1e-121  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  62.69 
 
 		 343 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  65.18 
 
 		 344 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  62.76 
 
 		 342 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  64.01 
 
 		 339 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  64.01 
 
 		 339 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  64.01 
 
 		 339 aa  430  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  64.01 
 
 		 339 aa  430  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  64.01 
 
 		 338 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  64.01 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  64.01 
 
 		 339 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  64.01 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  63.5 
 
 		 343 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  64.01 
 
 		 339 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  64.01 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  64.01 
 
 		 339 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  63.1 
 
 		 344 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  62.61 
 
 		 343 aa  426  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  60.65 
 
 		 343 aa  424  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  62.61 
 
 		 343 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  61.13 
 
 		 340 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  60.7 
 
 		 347 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  61.9 
 
 		 343 aa  418  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  61.38 
 
 		 339 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  61.01 
 
 		 347 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  60.71 
 
 		 346 aa  415  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  63.8 
 
 		 340 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  60.42 
 
 		 347 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  63.53 
 
 		 344 aa  412  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  58.75 
 
 		 342 aa  411  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  58.75 
 
 		 342 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  61.26 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  62.43 
 
 		 339 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  59.64 
 
 		 347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  61.13 
 
 		 344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  58.65 
 
 		 343 aa  404  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  59.64 
 
 		 347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  59.05 
 
 		 347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  60.24 
 
 		 344 aa  401  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  61.98 
 
 		 344 aa  403  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  61.76 
 
 		 358 aa  398  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  57.1 
 
 		 344 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  60.73 
 
 		 343 aa  399  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  58.7 
 
 		 343 aa  398  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  55.36 
 
 		 344 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  55.36 
 
 		 344 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  56.3 
 
 		 344 aa  394  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  55.65 
 
 		 344 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  61.22 
 
 		 358 aa  395  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  58.48 
 
 		 347 aa  396  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  58.33 
 
 		 346 aa  395  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  56.3 
 
 		 344 aa  394  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  58.43 
 
 		 346 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  56.01 
 
 		 344 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  58.43 
 
 		 346 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  57.78 
 
 		 346 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  60.12 
 
 		 359 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  58.79 
 
 		 345 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  57.96 
 
 		 345 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  56.89 
 
 		 344 aa  392  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1388  rod shape-determining protein MreB  56.34 
 
 		 343 aa  390  1e-107  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2749  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  59.16 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  56.89 
 
 		 347 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  62.1 
 
 		 346 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  58.84 
 
 		 344 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  58.38 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  58.38 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  58.38 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  58.38 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  58.38 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  58.38 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  58.19 
 
 		 346 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  58.38 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  58.38 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  58.67 
 
 		 347 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  58.38 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  59.65 
 
 		 342 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  58.38 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  58.38 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  58.38 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  58.38 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  58.38 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  57.89 
 
 		 348 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  56.68 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2374  rod shape-determining protein Mbl  56.36 
 
 		 342 aa  385  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0449993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  58.38 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  58.38 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  56.55 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  58.09 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  55.93 
 
 		 342 aa  383  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4777  rod shape-determining protein MreB  58.73 
 
 		 353 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529713  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  57.61 
 
 		 339 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  58.09 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>