More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2619 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  100 
 
 		 344 aa  682    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  85.38 
 
 		 342 aa  592  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  74.33 
 
 		 339 aa  496  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0109  rod shape-determining protein Mbl  69.94 
 
 		 343 aa  483  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0242  rod shape-determining protein MreB  71.38 
 
 		 329 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312684  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  66.67 
 
 		 345 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  62.57 
 
 		 345 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2133  rod shape-determining protein Mbl  62.5 
 
 		 343 aa  444  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  62.69 
 
 		 339 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  61.21 
 
 		 343 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  61.28 
 
 		 340 aa  430  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3144  rod shape-determining protein Mbl  64.09 
 
 		 344 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2155  rod shape-determining protein Mbl  64.83 
 
 		 345 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  62.69 
 
 		 344 aa  426  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  60.3 
 
 		 343 aa  423  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  61.28 
 
 		 343 aa  422  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  61.33 
 
 		 344 aa  422  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  60.36 
 
 		 340 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2835  rod shape-determining protein Mbl  59.04 
 
 		 345 aa  423  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2445  rod shape-determining protein Mbl  63.91 
 
 		 345 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2374  rod shape-determining protein Mbl  60.42 
 
 		 342 aa  423  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0449993  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1149  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  59.64 
 
 		 344 aa  418  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000405935  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  60.61 
 
 		 343 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  59.09 
 
 		 346 aa  415  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3394  rod shape-determining protein Mbl  59.94 
 
 		 333 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4763  rod shape-determining protein Mbl  62.92 
 
 		 328 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000280779  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2749  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  59.94 
 
 		 339 aa  409  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  59.09 
 
 		 343 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3282  rod shape-determining protein Mbl  59.82 
 
 		 333 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000125947  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  58.46 
 
 		 347 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  57.96 
 
 		 344 aa  404  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  58.56 
 
 		 344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  58.26 
 
 		 344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  58.26 
 
 		 344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  58.26 
 
 		 344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  57.96 
 
 		 344 aa  404  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  57.82 
 
 		 342 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  57.82 
 
 		 342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  58.73 
 
 		 347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  58.73 
 
 		 347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  57.23 
 
 		 350 aa  406  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  58.16 
 
 		 347 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  56.16 
 
 		 346 aa  403  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3798  rod shape-determining protein Mbl  58.79 
 
 		 333 aa  403  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000087539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  57.94 
 
 		 338 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  57.96 
 
 		 344 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  55.76 
 
 		 342 aa  403  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5404  rod shape-determining protein Mbl  58.18 
 
 		 333 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000385561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5550  rod shape-determining protein Mbl  57.88 
 
 		 333 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000581144  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5128  rod shape-determining protein Mbl  57.88 
 
 		 333 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000379199  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4962  rod shape-determining protein Mbl  58.18 
 
 		 333 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.96321e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4974  rod shape-determining protein Mbl  58.18 
 
 		 333 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000021016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  57.57 
 
 		 347 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5520  rod shape-determining protein Mbl  57.88 
 
 		 333 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0300  rod shape-determining protein MreB  57.49 
 
 		 345 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5400  rod shape-determining protein Mbl  57.88 
 
 		 333 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000418455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5369  rod shape-determining protein Mbl  57.88 
 
 		 333 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.813722 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5455  rod shape-determining protein Mbl  58.18 
 
 		 333 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  58.48 
 
 		 340 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1461  rod shape-determining protein MreB  57.99 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000397491  unclonable  0.000000242005 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5077  rod shape-determining protein Mbl  57.58 
 
 		 333 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000326742  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1734  rod shape-determining protein MreB  56.63 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000550029  normal  0.180064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  58.13 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  56.67 
 
 		 343 aa  397  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2769  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  60.54 
 
 		 348 aa  397  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.966477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  56.67 
 
 		 343 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1150  rod shape-determining protein MreB  57.1 
 
 		 345 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564796 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  56.5 
 
 		 342 aa  395  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  57.4 
 
 		 336 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  54.9 
 
 		 346 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  55.33 
 
 		 346 aa  391  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  56.97 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1529  rod shape-determining protein MreB  56.89 
 
 		 342 aa  392  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0844761  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  56.46 
 
 		 344 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  56.67 
 
 		 340 aa  391  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  58.18 
 
 		 339 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0866  MreB/Mrl family cell shape determining protein  58.13 
 
 		 335 aa  392  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  54.98 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  57.1 
 
 		 349 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  56.02 
 
 		 339 aa  388  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  56.02 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  56.02 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  56.02 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  56.02 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  56.02 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  54.44 
 
 		 346 aa  388  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  56.02 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  55.45 
 
 		 343 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  56.02 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  57.1 
 
 		 349 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  57.27 
 
 		 346 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  56.97 
 
 		 347 aa  388  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  56.8 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  56.02 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  56.06 
 
 		 347 aa  388  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  56.02 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  56.02 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  56.53 
 
 		 344 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  55.79 
 
 		 347 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  54.98 
 
 		 348 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>