More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1670 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
358 aa  704    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  97.21 
 
 
358 aa  687    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  86.49 
 
 
359 aa  600  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4777  rod shape-determining protein MreB  79.53 
 
 
353 aa  546  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529713  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1629  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  75 
 
 
355 aa  480  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  63.39 
 
 
343 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  61.74 
 
 
340 aa  424  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  59.22 
 
 
350 aa  420  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  60.81 
 
 
340 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  62.54 
 
 
343 aa  418  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  61.56 
 
 
343 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  60.7 
 
 
347 aa  411  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  60.59 
 
 
346 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  59.54 
 
 
342 aa  412  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  61.7 
 
 
343 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  60.18 
 
 
343 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  60.18 
 
 
343 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  61.38 
 
 
349 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  62.73 
 
 
344 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  60 
 
 
339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  62.94 
 
 
338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  59.83 
 
 
344 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  57.86 
 
 
354 aa  402  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  63.06 
 
 
344 aa  402  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  59.03 
 
 
368 aa  403  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  59.23 
 
 
347 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  59.63 
 
 
343 aa  399  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  60.06 
 
 
342 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  58.16 
 
 
344 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  58.75 
 
 
344 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  58.46 
 
 
344 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1529  rod shape-determining protein MreB  61.76 
 
 
342 aa  398  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0844761  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  57.35 
 
 
342 aa  398  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  57.64 
 
 
342 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  58.16 
 
 
344 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  58.06 
 
 
340 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  58.75 
 
 
344 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  58.75 
 
 
344 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  58.93 
 
 
347 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  58.93 
 
 
347 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  58.46 
 
 
344 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  57.78 
 
 
343 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  58.93 
 
 
347 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  59.59 
 
 
344 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  56.59 
 
 
343 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  58.63 
 
 
347 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  58.63 
 
 
344 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  58.5 
 
 
339 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  61.33 
 
 
340 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  57.39 
 
 
343 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  58.7 
 
 
348 aa  393  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  61.78 
 
 
346 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  56.97 
 
 
346 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  57.14 
 
 
347 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  58.48 
 
 
339 aa  385  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  58.48 
 
 
339 aa  385  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  58.16 
 
 
345 aa  385  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  58.48 
 
 
338 aa  385  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  56.76 
 
 
344 aa  385  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1388  rod shape-determining protein MreB  56.16 
 
 
343 aa  384  1e-106  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  58.18 
 
 
339 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  58.18 
 
 
339 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  58.18 
 
 
339 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  58.18 
 
 
339 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  58.18 
 
 
339 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  57.36 
 
 
336 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  58.18 
 
 
339 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  58.18 
 
 
339 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  58.18 
 
 
339 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0670  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  59.21 
 
 
347 aa  382  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  55.93 
 
 
348 aa  383  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  54.9 
 
 
346 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  57.53 
 
 
347 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  57.61 
 
 
347 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  57.4 
 
 
343 aa  381  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  57.53 
 
 
348 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  56.27 
 
 
347 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  58.79 
 
 
347 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000533641  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  58.79 
 
 
347 aa  376  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0300  rod shape-determining protein MreB  58.31 
 
 
345 aa  375  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  55.79 
 
 
346 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  56.08 
 
 
347 aa  378  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  53.74 
 
 
345 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  57.91 
 
 
347 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  57.91 
 
 
347 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  57.91 
 
 
347 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  57.91 
 
 
347 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  57.91 
 
 
347 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  57.91 
 
 
347 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  57.91 
 
 
347 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  57.91 
 
 
347 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  57.91 
 
 
347 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  55.79 
 
 
346 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0049  rod shape-determining protein MreB  57.01 
 
 
347 aa  371  1e-102  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.483131  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  57.61 
 
 
347 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  57.91 
 
 
347 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  57.91 
 
 
347 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  57.91 
 
 
347 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  57.91 
 
 
347 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  57.91 
 
 
347 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>