More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0670 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0670  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  100 
 
 		 347 aa  688    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  61.49 
 
 		 343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  61.86 
 
 		 350 aa  406  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  61.49 
 
 		 343 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  60.43 
 
 		 340 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  61.49 
 
 		 349 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  59.63 
 
 		 343 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  59.02 
 
 		 343 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  60.37 
 
 		 368 aa  396  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  58.08 
 
 		 346 aa  392  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  59.52 
 
 		 346 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06070  rod shape-determining protein MreB  64.48 
 
 		 349 aa  392  1e-108  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000340922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  58.36 
 
 		 347 aa  388  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  58.94 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  58.24 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  59.51 
 
 		 343 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  60.37 
 
 		 343 aa  389  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  58.24 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  60.68 
 
 		 344 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  59.32 
 
 		 342 aa  391  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  60.25 
 
 		 343 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  59.82 
 
 		 343 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  58.38 
 
 		 344 aa  385  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  58.04 
 
 		 346 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  60.19 
 
 		 342 aa  382  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  59.21 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  57.31 
 
 		 346 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  57.14 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  57.06 
 
 		 346 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  58.51 
 
 		 340 aa  383  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  59.21 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1529  rod shape-determining protein MreB  60.66 
 
 		 342 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0844761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  58.48 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  59.13 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1257  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  59.37 
 
 		 351 aa  380  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.574418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  57.35 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  58.13 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  59.63 
 
 		 343 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  58.75 
 
 		 344 aa  375  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  57.49 
 
 		 339 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  58.08 
 
 		 346 aa  375  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  57.53 
 
 		 343 aa  375  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  57.53 
 
 		 343 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14240  rod shape-determining protein MreB  60.42 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.799337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  55.95 
 
 		 342 aa  371  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  55.95 
 
 		 342 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  56.13 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  56.97 
 
 		 340 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  58.07 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  56.59 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  56.13 
 
 		 339 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  56.13 
 
 		 338 aa  371  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  56.13 
 
 		 339 aa  371  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  58.2 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  56.13 
 
 		 339 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  56.13 
 
 		 339 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  56.13 
 
 		 339 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  56.13 
 
 		 339 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  56.88 
 
 		 340 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  56.13 
 
 		 339 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0187  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  55.39 
 
 		 344 aa  371  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00128251  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1694  rod shape-determining protein MreB  54.87 
 
 		 346 aa  368  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  56.59 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  56.59 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  58.18 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  56.13 
 
 		 339 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  56.13 
 
 		 339 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  56.42 
 
 		 348 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0325  rod shape-determining protein MreB  54.57 
 
 		 346 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208455  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  55.39 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  57.59 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  57.89 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0303  rod shape-determining protein MreB  54.57 
 
 		 346 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  57.59 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  55.96 
 
 		 339 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  56.66 
 
 		 344 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0317  rod shape-determining protein MreB  54.44 
 
 		 345 aa  363  3e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.594365  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  53.73 
 
 		 346 aa  361  9e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0868  rod shape-determining protein MreB  54.49 
 
 		 345 aa  361  1e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  54.63 
 
 		 347 aa  360  1e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  55.79 
 
 		 336 aa  361  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1397  rod shape-determining protein MreB  53.85 
 
 		 345 aa  360  2e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  55.11 
 
 		 344 aa  360  2e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  53.82 
 
 		 344 aa  360  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1465  rod shape-determining protein MreB  54.49 
 
 		 345 aa  359  4e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  55.35 
 
 		 345 aa  358  8e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4777  rod shape-determining protein MreB  56.7 
 
 		 353 aa  357  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529713  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2125  rod shape-determining protein MreB  53.89 
 
 		 345 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.55936  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  54.34 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  54.13 
 
 		 354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  54.19 
 
 		 348 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  54.68 
 
 		 347 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1388  rod shape-determining protein MreB  52.52 
 
 		 343 aa  355  5e-97  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  54.22 
 
 		 347 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1352  rod shape-determining protein MreB  52.69 
 
 		 343 aa  355  8.999999999999999e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.261173  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  52.32 
 
 		 342 aa  353  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  53.4 
 
 		 339 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  53.82 
 
 		 345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  53.82 
 
 		 345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  59.09 
 
 		 346 aa  352  5e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.433633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>