More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2238 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2238  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 351 aa  700    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1970  rod shape-determining protein MreB  53.45 
 
 		 372 aa  386  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000114357  normal  0.892505 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1111  rod shape-determining protein MreB  51.9 
 
 		 344 aa  366  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0800  rod shape-determining protein MreB  52.44 
 
 		 342 aa  360  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1290  rod shape-determining protein MreB  51.29 
 
 		 342 aa  357  9.999999999999999e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69839  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0512  rod shape-determining protein MreB  51.86 
 
 		 342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.370229  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0848  rod shape-determining protein MreB  50.72 
 
 		 351 aa  351  8.999999999999999e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000008182  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0553  rod shape-determining protein MreB  51 
 
 		 345 aa  350  2e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.212626 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0691  rod shape-determining protein MreB  51.94 
 
 		 342 aa  346  3e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.444485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1820  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 		 342 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1921  rod shape-determining protein MreB  46.4 
 
 		 340 aa  315  5e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00289876  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1874  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  45.32 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0249  rod shape-determining protein MreB  42.49 
 
 		 343 aa  264  2e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  41.54 
 
 		 343 aa  259  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3832  rod shape-determining protein MreB  41.54 
 
 		 341 aa  259  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.11388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5925  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  42.18 
 
 		 341 aa  258  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3308  rod shape-determining protein MreB  41.3 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0785141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  40.18 
 
 		 343 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  39.23 
 
 		 340 aa  252  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  38.81 
 
 		 346 aa  251  9.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1917  rod shape-determining protein MreB  39.27 
 
 		 340 aa  250  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.695972  hitchhiker  0.000105138 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  40.6 
 
 		 339 aa  250  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  39.88 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  40.59 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0330  rod shape-determining protein MreB  39.26 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000934452  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  40.97 
 
 		 347 aa  247  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0348  rod shape-determining protein MreB  39.26 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0865019  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  40.86 
 
 		 347 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  41.54 
 
 		 340 aa  246  4e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  38.69 
 
 		 343 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  38.69 
 
 		 343 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  37.54 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  39.71 
 
 		 348 aa  243  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  40.69 
 
 		 347 aa  242  6e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  39.66 
 
 		 347 aa  242  7.999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  40.06 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  38.19 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1352  rod shape-determining protein MreB  40.91 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.261173  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  37.61 
 
 		 342 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  35.42 
 
 		 342 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4170  rod shape-determining protein MreB  38.04 
 
 		 349 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000201977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  38.3 
 
 		 344 aa  239  6.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0325  rod shape-determining protein MreB  40.37 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208455  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  38.53 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0808  rod shape-determining protein MreB  39.76 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0303  rod shape-determining protein MreB  40.37 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  37.2 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  37.9 
 
 		 358 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1694  rod shape-determining protein MreB  40.37 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  37.35 
 
 		 368 aa  238  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  40.83 
 
 		 347 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  36.69 
 
 		 344 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0194  rod shape-determining protein MreB  41.5 
 
 		 340 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  38.48 
 
 		 346 aa  237  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_002620  TC0082  rod shape-determining protein MreB  37.46 
 
 		 366 aa  236  4e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4777  rod shape-determining protein MreB  37.58 
 
 		 353 aa  236  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529713  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4130  rod shape-determining protein MreB  38.51 
 
 		 335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  37.17 
 
 		 343 aa  236  6e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  40.66 
 
 		 344 aa  235  7e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  40.66 
 
 		 344 aa  235  7e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  34.82 
 
 		 344 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  39.88 
 
 		 344 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1461  rod shape-determining protein MreB  36.75 
 
 		 347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000397491  unclonable  0.000000242005 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  38.35 
 
 		 345 aa  235  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0187  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  40.67 
 
 		 344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00128251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  39.58 
 
 		 347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  39.58 
 
 		 347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0868  rod shape-determining protein MreB  39.57 
 
 		 345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  39.02 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  38.02 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1993  rod shape-determining protein MreB  38.07 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.874884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  37.88 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  38.87 
 
 		 346 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  38.66 
 
 		 354 aa  233  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  34.52 
 
 		 344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  38.55 
 
 		 343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0317  rod shape-determining protein MreB  39.26 
 
 		 345 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.594365  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  41.27 
 
 		 344 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  41.27 
 
 		 344 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  41.27 
 
 		 344 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  37.76 
 
 		 339 aa  232  6e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  38.02 
 
 		 346 aa  232  6e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1248  rod shape-determining protein MreB  37.91 
 
 		 336 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0105666  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1207  rod shape-determining protein MreB  37.91 
 
 		 336 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000344928  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  38.02 
 
 		 346 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2125  rod shape-determining protein MreB  38.96 
 
 		 345 aa  232  9e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.55936  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  37.13 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0300  rod shape-determining protein MreB  37.5 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1397  rod shape-determining protein MreB  39.26 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  37.13 
 
 		 342 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3391  rod shape-determining protein MreB  38.58 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.112256 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  40.06 
 
 		 344 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  39.22 
 
 		 345 aa  231  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  36.83 
 
 		 342 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  37.46 
 
 		 340 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  39.17 
 
 		 346 aa  230  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1458  rod shape-determining protein MreB  38.58 
 
 		 336 aa  229  7e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0320  rod shape-determining protein MreB  38.82 
 
 		 352 aa  229  7e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  34.91 
 
 		 343 aa  229  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00565  putative rod-shape determining protein  38.76 
 
 		 342 aa  229  8e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.444637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>