More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5925 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5925  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  100 
 
 		 341 aa  684    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3832  rod shape-determining protein MreB  87.68 
 
 		 341 aa  617  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.11388 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3308  rod shape-determining protein MreB  81.23 
 
 		 342 aa  568  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0785141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0808  rod shape-determining protein MreB  69.91 
 
 		 340 aa  511  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0249  rod shape-determining protein MreB  72.89 
 
 		 343 aa  510  1e-143  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0194  rod shape-determining protein MreB  70.45 
 
 		 340 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00565  putative rod-shape determining protein  63.64 
 
 		 342 aa  455  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.444637  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1458  rod shape-determining protein MreB  63.88 
 
 		 336 aa  450  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1407  rod shape-determining protein MreB  61 
 
 		 342 aa  442  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.321094  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1396  rod shape-determining protein MreB  58.7 
 
 		 339 aa  402  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0333198 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1874  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  57.77 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0553  rod shape-determining protein MreB  56.73 
 
 		 345 aa  366  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.212626 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0512  rod shape-determining protein MreB  55.26 
 
 		 342 aa  358  6e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.370229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1290  rod shape-determining protein MreB  54.25 
 
 		 342 aa  355  5.999999999999999e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69839  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0800  rod shape-determining protein MreB  54.09 
 
 		 342 aa  354  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0848  rod shape-determining protein MreB  53.8 
 
 		 351 aa  353  2e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000008182  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0691  rod shape-determining protein MreB  53.37 
 
 		 342 aa  348  7e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.444485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1820  rod shape-determining protein MreB  53.08 
 
 		 342 aa  346  4e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  49.11 
 
 		 342 aa  340  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 346 aa  338  5.9999999999999996e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  51.17 
 
 		 342 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  51.02 
 
 		 343 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  50.58 
 
 		 348 aa  333  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  51.03 
 
 		 340 aa  333  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  51.6 
 
 		 347 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  50.88 
 
 		 346 aa  332  4e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  51.76 
 
 		 345 aa  332  5e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  49.42 
 
 		 344 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 		 343 aa  330  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  50.59 
 
 		 346 aa  330  2e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  49.71 
 
 		 346 aa  330  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  49.55 
 
 		 342 aa  330  3e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  49.56 
 
 		 343 aa  329  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  49.56 
 
 		 343 aa  328  6e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  49.26 
 
 		 342 aa  328  9e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  51.6 
 
 		 347 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  51.6 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 346 aa  326  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 		 346 aa  326  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  51.92 
 
 		 354 aa  326  4.0000000000000003e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  50.72 
 
 		 347 aa  325  5e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  49.11 
 
 		 368 aa  324  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  52.08 
 
 		 336 aa  323  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  47.63 
 
 		 344 aa  323  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  48.98 
 
 		 343 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  50.58 
 
 		 346 aa  323  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  47.93 
 
 		 343 aa  322  4e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  51.02 
 
 		 347 aa  322  5e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  51.02 
 
 		 347 aa  322  5e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 		 344 aa  322  7e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  51.6 
 
 		 347 aa  322  8e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  49.26 
 
 		 347 aa  321  9.000000000000001e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  49.26 
 
 		 340 aa  321  9.000000000000001e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  49.26 
 
 		 347 aa  321  9.000000000000001e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1734  rod shape-determining protein MreB  47.06 
 
 		 344 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000550029  normal  0.180064 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  50.58 
 
 		 346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  51.2 
 
 		 342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  49.28 
 
 		 358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  50.72 
 
 		 348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  50.6 
 
 		 340 aa  320  3e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  49.28 
 
 		 358 aa  319  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  50.58 
 
 		 347 aa  318  7e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1461  rod shape-determining protein MreB  49.12 
 
 		 347 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000397491  unclonable  0.000000242005 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  49.42 
 
 		 343 aa  317  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  50.74 
 
 		 343 aa  317  1e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  48.38 
 
 		 348 aa  317  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  48.25 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  47.81 
 
 		 350 aa  317  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  47.97 
 
 		 347 aa  316  3e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  47.97 
 
 		 347 aa  316  3e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000533641  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2374  rod shape-determining protein Mbl  46.36 
 
 		 342 aa  316  3e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0449993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  49.1 
 
 		 344 aa  315  6e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2133  rod shape-determining protein Mbl  47.89 
 
 		 343 aa  315  7e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  47.58 
 
 		 345 aa  315  7e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3391  rod shape-determining protein MreB  48.8 
 
 		 352 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.112256 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  47.02 
 
 		 345 aa  315  8e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_002620  TC0082  rod shape-determining protein MreB  49.55 
 
 		 366 aa  315  9e-85  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2834  rod shape-determining protein MreB  47.67 
 
 		 347 aa  315  9e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000019673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  51.18 
 
 		 344 aa  315  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  46.61 
 
 		 343 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  47.32 
 
 		 344 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  47.35 
 
 		 343 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1149  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  48.31 
 
 		 344 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000405935  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  49.56 
 
 		 359 aa  315  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  46.96 
 
 		 347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  47.16 
 
 		 339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  50.59 
 
 		 344 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  50.59 
 
 		 344 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  50.29 
 
 		 344 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2128  rod shape-determining protein MreB  49.42 
 
 		 348 aa  314  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  48.38 
 
 		 348 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  51.47 
 
 		 344 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  48.54 
 
 		 346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  50.59 
 
 		 344 aa  312  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0492  rod shape-determining protein MreB  48.97 
 
 		 346 aa  312  3.9999999999999997e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152747  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  48.8 
 
 		 339 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  48.06 
 
 		 345 aa  312  5.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  48.06 
 
 		 345 aa  312  5.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 344 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1917  rod shape-determining protein MreB  46.18 
 
 		 340 aa  312  5.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.695972  hitchhiker  0.000105138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>