More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1458 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1458  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 336 aa  676    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00565  putative rod-shape determining protein  88.1 
 
 		 342 aa  610  9.999999999999999e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.444637  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1407  rod shape-determining protein MreB  83.63 
 
 		 342 aa  588  1e-167  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.321094  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0808  rod shape-determining protein MreB  67.37 
 
 		 340 aa  471  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0194  rod shape-determining protein MreB  64.97 
 
 		 340 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5925  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  63.88 
 
 		 341 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3308  rod shape-determining protein MreB  62.69 
 
 		 342 aa  448  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0785141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3832  rod shape-determining protein MreB  65.07 
 
 		 341 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.11388 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0249  rod shape-determining protein MreB  61.01 
 
 		 343 aa  429  1e-119  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1396  rod shape-determining protein MreB  56.33 
 
 		 339 aa  384  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0333198 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1874  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  53.75 
 
 		 336 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0848  rod shape-determining protein MreB  53.12 
 
 		 351 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000008182  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1290  rod shape-determining protein MreB  53.29 
 
 		 342 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69839  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  51.34 
 
 		 343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  48.8 
 
 		 342 aa  333  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  51.34 
 
 		 344 aa  333  4e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0512  rod shape-determining protein MreB  52.23 
 
 		 342 aa  332  8e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.370229  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0800  rod shape-determining protein MreB  52.52 
 
 		 342 aa  331  9e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0553  rod shape-determining protein MreB  52.38 
 
 		 345 aa  331  1e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.212626 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0691  rod shape-determining protein MreB  50.74 
 
 		 342 aa  329  3e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.444485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  50.44 
 
 		 343 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  48.51 
 
 		 346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  51.2 
 
 		 340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  50 
 
 		 345 aa  326  4.0000000000000003e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1820  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 		 342 aa  324  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  51.65 
 
 		 343 aa  323  2e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  49.4 
 
 		 343 aa  323  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  49.13 
 
 		 348 aa  321  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  51.33 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  48.96 
 
 		 346 aa  317  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  51.34 
 
 		 343 aa  316  3e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  49.11 
 
 		 340 aa  316  3e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  50.29 
 
 		 346 aa  315  6e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 		 347 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  50.74 
 
 		 347 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  50.61 
 
 		 342 aa  312  5.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  48.19 
 
 		 349 aa  312  5.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  46.43 
 
 		 343 aa  312  5.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  46.73 
 
 		 343 aa  311  7.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  50.44 
 
 		 347 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  49.55 
 
 		 348 aa  310  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  48.07 
 
 		 346 aa  310  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  50.31 
 
 		 342 aa  310  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  47.6 
 
 		 368 aa  310  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  47.43 
 
 		 345 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  49.11 
 
 		 340 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  49.26 
 
 		 347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  49.1 
 
 		 339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  48.95 
 
 		 340 aa  309  4e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  47.48 
 
 		 342 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  46.73 
 
 		 344 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  47.43 
 
 		 350 aa  308  8e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  45.7 
 
 		 344 aa  308  9e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  47.62 
 
 		 343 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0109  rod shape-determining protein Mbl  48.78 
 
 		 343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  49.56 
 
 		 347 aa  306  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  49.56 
 
 		 347 aa  306  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1694  rod shape-determining protein MreB  47.65 
 
 		 346 aa  306  4.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  49.41 
 
 		 344 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  46.61 
 
 		 346 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  48.81 
 
 		 339 aa  305  5.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  49.41 
 
 		 344 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  47.2 
 
 		 346 aa  305  6e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  49.12 
 
 		 344 aa  305  7e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1149  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  48.18 
 
 		 344 aa  305  7e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000405935  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  48.37 
 
 		 347 aa  305  9.000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0325  rod shape-determining protein MreB  47.35 
 
 		 346 aa  304  1.0000000000000001e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208455  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  48.79 
 
 		 344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  48.06 
 
 		 348 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0303  rod shape-determining protein MreB  47.35 
 
 		 346 aa  304  1.0000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 344 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2835  rod shape-determining protein Mbl  47.59 
 
 		 345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  49.26 
 
 		 347 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2374  rod shape-determining protein Mbl  47.11 
 
 		 342 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0449993  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  47.63 
 
 		 343 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 358 aa  303  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  47.73 
 
 		 347 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  47.73 
 
 		 347 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  49.1 
 
 		 336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2133  rod shape-determining protein Mbl  47.52 
 
 		 343 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  49.12 
 
 		 344 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  48.33 
 
 		 344 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  46.48 
 
 		 344 aa  302  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  48.82 
 
 		 344 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  48.07 
 
 		 342 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1352  rod shape-determining protein MreB  47.63 
 
 		 343 aa  302  5.000000000000001e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.261173  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  49.12 
 
 		 344 aa  302  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1397  rod shape-determining protein MreB  48.2 
 
 		 345 aa  302  6.000000000000001e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1235  rod shape-determining protein MreB  47.56 
 
 		 329 aa  302  6.000000000000001e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5235  rod shape-determining protein MreB  49.4 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.979505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  49.4 
 
 		 338 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  46.9 
 
 		 346 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  46.29 
 
 		 346 aa  301  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1215  rod shape-determining protein MreB  47.71 
 
 		 333 aa  301  1e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.020325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4763  rod shape-determining protein Mbl  47.52 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000280779  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18321  rod shape-determining protein MreB  49.25 
 
 		 350 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1715  rod shape-determining protein MreB  49.25 
 
 		 350 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  47.73 
 
 		 348 aa  300  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  49.12 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0366  rod shape-determining protein MreB  49.12 
 
 		 347 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>