More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1235 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1235  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 329 aa  660    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0471  rod shape-determining protein MreB  67.99 
 
 		 330 aa  467  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000843079  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0260  rod shape-determining protein MreB  67.38 
 
 		 330 aa  455  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3282  rod shape-determining protein Mbl  63.53 
 
 		 333 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000125947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5455  rod shape-determining protein Mbl  64.31 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5400  rod shape-determining protein Mbl  64.31 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000418455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5404  rod shape-determining protein Mbl  64.31 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000385561  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3798  rod shape-determining protein Mbl  64.51 
 
 		 333 aa  421  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000087539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5128  rod shape-determining protein Mbl  63.83 
 
 		 333 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000379199  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4962  rod shape-determining protein Mbl  64.51 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.96321e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4974  rod shape-determining protein Mbl  64.51 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000021016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5369  rod shape-determining protein Mbl  63.83 
 
 		 333 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.813722 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5520  rod shape-determining protein Mbl  63.83 
 
 		 333 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5077  rod shape-determining protein Mbl  63.53 
 
 		 333 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000326742  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5550  rod shape-determining protein Mbl  64.31 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000581144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3394  rod shape-determining protein Mbl  62.77 
 
 		 333 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  53.35 
 
 		 346 aa  378  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2749  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  56.79 
 
 		 339 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0668  rod shape-determining protein MreB  56.14 
 
 		 374 aa  367  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.94771  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  55.49 
 
 		 339 aa  363  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  53.82 
 
 		 343 aa  362  4e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2835  rod shape-determining protein Mbl  55.45 
 
 		 345 aa  362  7.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  52 
 
 		 343 aa  360  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  52.28 
 
 		 343 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  54.33 
 
 		 346 aa  357  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  53.33 
 
 		 344 aa  357  9.999999999999999e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  53.54 
 
 		 345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  52.89 
 
 		 343 aa  355  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  51.98 
 
 		 338 aa  354  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  54.55 
 
 		 345 aa  354  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  52.13 
 
 		 340 aa  353  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  52.13 
 
 		 340 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  53.23 
 
 		 340 aa  352  4e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  53.17 
 
 		 347 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  52.15 
 
 		 339 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  52.15 
 
 		 339 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2133  rod shape-determining protein Mbl  52.52 
 
 		 343 aa  352  7e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  52.15 
 
 		 339 aa  351  8e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  52.15 
 
 		 339 aa  351  8e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  52.15 
 
 		 339 aa  351  8e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  52.15 
 
 		 339 aa  351  8e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  52.15 
 
 		 339 aa  351  8e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  52.15 
 
 		 339 aa  351  8e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  52.15 
 
 		 339 aa  351  8e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  52.47 
 
 		 340 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  52.15 
 
 		 339 aa  350  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  52.6 
 
 		 342 aa  350  2e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1215  rod shape-determining protein MreB  53.94 
 
 		 333 aa  350  2e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.020325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  51.39 
 
 		 339 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  50.3 
 
 		 344 aa  349  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  51.53 
 
 		 338 aa  349  3e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  49.39 
 
 		 342 aa  349  3e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  51.38 
 
 		 344 aa  349  4e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  52.6 
 
 		 342 aa  349  5e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0109  rod shape-determining protein Mbl  51.54 
 
 		 343 aa  348  9e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  52.27 
 
 		 347 aa  347  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  48.48 
 
 		 343 aa  347  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  50.61 
 
 		 350 aa  347  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  54.27 
 
 		 347 aa  347  2e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  51.38 
 
 		 346 aa  346  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  48.48 
 
 		 343 aa  346  3e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  51.68 
 
 		 346 aa  345  4e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  50.45 
 
 		 347 aa  346  4e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  51.68 
 
 		 346 aa  345  5e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  52.63 
 
 		 344 aa  345  5e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  51.54 
 
 		 342 aa  345  8e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  52.78 
 
 		 343 aa  344  1e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  51.81 
 
 		 347 aa  344  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  52.91 
 
 		 343 aa  343  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1874  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  50.61 
 
 		 336 aa  342  4e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  50.76 
 
 		 344 aa  342  5.999999999999999e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  52.01 
 
 		 336 aa  340  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  51.06 
 
 		 347 aa  340  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  50.76 
 
 		 346 aa  340  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  51.53 
 
 		 344 aa  339  2.9999999999999998e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1529  rod shape-determining protein MreB  50.76 
 
 		 342 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0844761  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  50.76 
 
 		 342 aa  338  7e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  48.78 
 
 		 343 aa  338  9e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  52.29 
 
 		 344 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  50.9 
 
 		 347 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  51.99 
 
 		 344 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  51.36 
 
 		 346 aa  337  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  50.62 
 
 		 354 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  50.9 
 
 		 347 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  51.99 
 
 		 344 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  51.99 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  50.62 
 
 		 349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  48.17 
 
 		 368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  51.68 
 
 		 344 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  51.2 
 
 		 345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  51.38 
 
 		 344 aa  335  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2374  rod shape-determining protein Mbl  50.77 
 
 		 342 aa  335  5e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0449993  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  51.38 
 
 		 344 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0983  rod shape-determining protein MreB  50.62 
 
 		 336 aa  334  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.408355 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1149  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  50.77 
 
 		 344 aa  333  2e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000405935  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1465  rod shape-determining protein MreB  49.39 
 
 		 345 aa  334  2e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28948  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 348 aa  332  4e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0483  rod shape-determining protein MreB  49.09 
 
 		 342 aa  332  4e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.025319  normal  0.0218935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  48.94 
 
 		 348 aa  332  6e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0375  rod shape-determining protein MreB  52 
 
 		 336 aa  331  8e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>