More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1407 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1407  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 342 aa  692    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.321094  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00565  putative rod-shape determining protein  82.16 
 
 		 342 aa  596  1e-169  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.444637  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1458  rod shape-determining protein MreB  83.63 
 
 		 336 aa  588  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0808  rod shape-determining protein MreB  66.18 
 
 		 340 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0194  rod shape-determining protein MreB  63.39 
 
 		 340 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5925  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  61 
 
 		 341 aa  442  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3832  rod shape-determining protein MreB  61 
 
 		 341 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.11388 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3308  rod shape-determining protein MreB  60.23 
 
 		 342 aa  444  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0785141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0249  rod shape-determining protein MreB  57.31 
 
 		 343 aa  435  1e-121  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1396  rod shape-determining protein MreB  55.59 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0333198 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1874  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  52.34 
 
 		 336 aa  355  5e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0848  rod shape-determining protein MreB  52.19 
 
 		 351 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000008182  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1290  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 342 aa  330  2e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69839  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  51.18 
 
 		 343 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  49.11 
 
 		 342 aa  330  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0553  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 345 aa  328  8e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.212626 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0512  rod shape-determining protein MreB  49.71 
 
 		 342 aa  325  7e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.370229  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0691  rod shape-determining protein MreB  49.56 
 
 		 342 aa  325  1e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.444485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0800  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 		 342 aa  323  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  48.4 
 
 		 343 aa  322  4e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1820  rod shape-determining protein MreB  49.27 
 
 		 342 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  47.08 
 
 		 343 aa  318  7.999999999999999e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  48.07 
 
 		 343 aa  318  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  48.25 
 
 		 340 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  48.26 
 
 		 345 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  45.19 
 
 		 346 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  45.72 
 
 		 343 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  49.1 
 
 		 340 aa  312  3.9999999999999997e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  45.72 
 
 		 343 aa  311  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  47.63 
 
 		 339 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  47.52 
 
 		 342 aa  310  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  46.61 
 
 		 340 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  47.72 
 
 		 345 aa  309  5e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  47.49 
 
 		 342 aa  308  6.999999999999999e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  47.8 
 
 		 347 aa  308  9e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  45.75 
 
 		 346 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  48.36 
 
 		 339 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  47.66 
 
 		 348 aa  305  6e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  46.63 
 
 		 347 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  44.77 
 
 		 350 aa  304  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  48.22 
 
 		 336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  46.8 
 
 		 358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2374  rod shape-determining protein Mbl  46.53 
 
 		 342 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0449993  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  47.11 
 
 		 359 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  48.06 
 
 		 338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  46.26 
 
 		 348 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  48.69 
 
 		 346 aa  303  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  46.51 
 
 		 358 aa  303  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  44.48 
 
 		 344 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  47.56 
 
 		 347 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  47.51 
 
 		 344 aa  301  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  47.49 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  46.18 
 
 		 340 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  47.49 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1917  rod shape-determining protein MreB  45.59 
 
 		 340 aa  301  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.695972  hitchhiker  0.000105138 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  45.81 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0445  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  46.33 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0596021 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  45.16 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  46.94 
 
 		 343 aa  300  2e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  47.2 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  46.33 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  46.57 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  45.13 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  46.63 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  46.57 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  46.63 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  46.63 
 
 		 347 aa  299  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  46.65 
 
 		 345 aa  299  5e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  46.39 
 
 		 349 aa  298  7e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  44.44 
 
 		 346 aa  298  8e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3282  rod shape-determining protein Mbl  46.22 
 
 		 333 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000125947  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  46.36 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  44.77 
 
 		 343 aa  298  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  47.01 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  45.72 
 
 		 339 aa  296  4e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  45.72 
 
 		 339 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  45.72 
 
 		 339 aa  296  4e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  45.72 
 
 		 339 aa  296  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  45.64 
 
 		 347 aa  296  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1694  rod shape-determining protein MreB  43.73 
 
 		 346 aa  296  4e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3798  rod shape-determining protein Mbl  44.67 
 
 		 333 aa  296  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000087539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  45.72 
 
 		 339 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  45.72 
 
 		 339 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  46.57 
 
 		 342 aa  296  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  45.64 
 
 		 347 aa  296  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  45.72 
 
 		 339 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  44.67 
 
 		 346 aa  296  5e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  46.88 
 
 		 342 aa  295  6e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4763  rod shape-determining protein Mbl  46.58 
 
 		 328 aa  295  6e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000280779  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  45.56 
 
 		 348 aa  295  7e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  45.72 
 
 		 339 aa  295  8e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  45.72 
 
 		 339 aa  295  8e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  45.72 
 
 		 339 aa  295  8e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0325  rod shape-determining protein MreB  43.82 
 
 		 346 aa  295  1e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4974  rod shape-determining protein Mbl  44.58 
 
 		 333 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000021016  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5520  rod shape-determining protein Mbl  44.38 
 
 		 333 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5369  rod shape-determining protein Mbl  44.38 
 
 		 333 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.813722 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1734  rod shape-determining protein MreB  44.57 
 
 		 344 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000550029  normal  0.180064 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0303  rod shape-determining protein MreB  43.82 
 
 		 346 aa  295  1e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>