More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1917 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1917  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 340 aa  684    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.695972  hitchhiker  0.000105138 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4060  rod shape-determining protein MreB  62.65 
 
 		 340 aa  441  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.203248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1993  rod shape-determining protein MreB  58.82 
 
 		 340 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.874884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  59.52 
 
 		 343 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  57.35 
 
 		 344 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  56.55 
 
 		 343 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  57.35 
 
 		 344 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  57.35 
 
 		 344 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  57.65 
 
 		 344 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  55.26 
 
 		 346 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  57.35 
 
 		 344 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  57.06 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  58.16 
 
 		 344 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  56.27 
 
 		 347 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  56.76 
 
 		 344 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  55.49 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  55.36 
 
 		 343 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  54.81 
 
 		 347 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  54.81 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  54.28 
 
 		 346 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  55.22 
 
 		 343 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  55.69 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  55.22 
 
 		 343 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  53.43 
 
 		 340 aa  386  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  52.2 
 
 		 346 aa  381  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  54.81 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  54.81 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  54.81 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  53.8 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  53.64 
 
 		 346 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1555  rod shape-determining protein MreB  57.35 
 
 		 341 aa  378  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.442769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  52.73 
 
 		 339 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  55.16 
 
 		 347 aa  378  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  54.3 
 
 		 343 aa  381  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  54.14 
 
 		 346 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  52.1 
 
 		 342 aa  378  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  54.23 
 
 		 346 aa  375  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  53.15 
 
 		 343 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  53.47 
 
 		 348 aa  375  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  53.13 
 
 		 344 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1406  rod shape-determining protein MreB  58.82 
 
 		 340 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.869118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  53.35 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  52.99 
 
 		 343 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  53.87 
 
 		 344 aa  371  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  53.66 
 
 		 342 aa  371  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0344  rod shape-determining protein MreB  58.53 
 
 		 340 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0112472 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  53.06 
 
 		 348 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  53.04 
 
 		 347 aa  368  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  53.53 
 
 		 344 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  53.5 
 
 		 336 aa  371  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  53.04 
 
 		 347 aa  368  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  50.75 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  53.66 
 
 		 342 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  53.45 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  51.34 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1172  rod shape-determining protein MreB  53.39 
 
 		 341 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.245096  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  54.33 
 
 		 368 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0330  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  52.89 
 
 		 348 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  54.77 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  55.45 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  55.45 
 
 		 348 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  52.62 
 
 		 348 aa  366  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  53.5 
 
 		 340 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1150  rod shape-determining protein MreB  54.46 
 
 		 345 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564796 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  54.08 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  53.22 
 
 		 346 aa  364  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  52.11 
 
 		 339 aa  363  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  51.65 
 
 		 339 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1461  rod shape-determining protein MreB  52.87 
 
 		 347 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000397491  unclonable  0.000000242005 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  54.68 
 
 		 346 aa  361  9e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12650  rod shape-determining protein MreB  53.69 
 
 		 345 aa  360  1e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  52.23 
 
 		 350 aa  360  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0100  rod shape-determining protein MreB  52.23 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  54.12 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  54.12 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0320  rod shape-determining protein MreB  55.88 
 
 		 352 aa  360  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  53.18 
 
 		 348 aa  359  3e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  53.82 
 
 		 347 aa  359  4e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0866  MreB/Mrl family cell shape determining protein  52.74 
 
 		 335 aa  359  4e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  53.53 
 
 		 347 aa  359  4e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  51.52 
 
 		 339 aa  358  6e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  51.34 
 
 		 343 aa  358  6e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  53.82 
 
 		 347 aa  358  7e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  53.82 
 
 		 347 aa  358  7e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  52.34 
 
 		 347 aa  358  8e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  51.52 
 
 		 339 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  51.52 
 
 		 339 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  51.52 
 
 		 339 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  51.52 
 
 		 339 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  51.52 
 
 		 339 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  51.52 
 
 		 339 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  51.52 
 
 		 339 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  51.52 
 
 		 339 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  51.52 
 
 		 339 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1388  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 		 343 aa  357  9.999999999999999e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  53.53 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  53.53 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  53.53 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  53.53 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  51.52 
 
 		 338 aa  356  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>