More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1406 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1406  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 340 aa  677    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.869118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0344  rod shape-determining protein MreB  87.06 
 
 		 340 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0112472 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1993  rod shape-determining protein MreB  79.41 
 
 		 340 aa  559  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.874884  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1172  rod shape-determining protein MreB  64.6 
 
 		 341 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.245096  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1555  rod shape-determining protein MreB  70.29 
 
 		 341 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.442769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0665  rod shape-determining protein MreB  71.76 
 
 		 341 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000200896  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1917  rod shape-determining protein MreB  58.82 
 
 		 340 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.695972  hitchhiker  0.000105138 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  56.73 
 
 		 346 aa  384  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  56.93 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  56.93 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  55.98 
 
 		 346 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  55.39 
 
 		 347 aa  378  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  57.06 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  56.05 
 
 		 347 aa  378  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  56.34 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  56.47 
 
 		 344 aa  374  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  56.34 
 
 		 347 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  56.34 
 
 		 347 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  56.18 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  56.18 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  56.21 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  56.18 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  54.84 
 
 		 343 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  55.69 
 
 		 348 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  55.29 
 
 		 343 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  56.18 
 
 		 344 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  55.75 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  54.46 
 
 		 343 aa  368  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  56.18 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  56.47 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  55.03 
 
 		 354 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  52.24 
 
 		 340 aa  365  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  53.73 
 
 		 340 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  53.27 
 
 		 343 aa  363  3e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  54.52 
 
 		 346 aa  363  3e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  55.62 
 
 		 342 aa  362  5.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  51.94 
 
 		 343 aa  362  7.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  52.35 
 
 		 346 aa  360  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  55.32 
 
 		 342 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  51.95 
 
 		 342 aa  360  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  55.08 
 
 		 349 aa  359  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  51.64 
 
 		 343 aa  359  3e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  54.33 
 
 		 348 aa  359  4e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  54.98 
 
 		 347 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  51.48 
 
 		 343 aa  358  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  53.27 
 
 		 350 aa  357  1.9999999999999998e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  53.87 
 
 		 348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  54.98 
 
 		 348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  53.29 
 
 		 343 aa  356  2.9999999999999997e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  54.62 
 
 		 346 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  54.03 
 
 		 347 aa  356  3.9999999999999996e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  54.03 
 
 		 347 aa  356  3.9999999999999996e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  52.69 
 
 		 368 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  52.98 
 
 		 343 aa  355  5e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  53.06 
 
 		 345 aa  355  6.999999999999999e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  53.73 
 
 		 340 aa  354  8.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  52.25 
 
 		 336 aa  354  1e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  54.55 
 
 		 347 aa  354  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1150  rod shape-determining protein MreB  53.01 
 
 		 345 aa  354  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  56.02 
 
 		 345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0933  rod shape-determining protein MreB  56.02 
 
 		 345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.283099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0973  rod shape-determining protein MreB  56.02 
 
 		 345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118066  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0940  rod shape-determining protein MreB  56.02 
 
 		 345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  56.02 
 
 		 345 aa  352  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  56.02 
 
 		 345 aa  352  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0838  rod shape-determining protein MreB  56.02 
 
 		 345 aa  352  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00330287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  52.25 
 
 		 339 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  53.39 
 
 		 347 aa  352  7e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  54.46 
 
 		 349 aa  351  8e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  51.96 
 
 		 339 aa  351  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  50.15 
 
 		 344 aa  350  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0856  rod shape-determining protein MreB  55.72 
 
 		 345 aa  350  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  52.25 
 
 		 340 aa  350  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  51.2 
 
 		 343 aa  349  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  54.94 
 
 		 348 aa  349  4e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  53.17 
 
 		 338 aa  348  6e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  52.66 
 
 		 344 aa  348  6e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12650  rod shape-determining protein MreB  55.12 
 
 		 345 aa  348  7e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0260  rod shape-determining protein MreB  54.47 
 
 		 347 aa  348  1e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.516664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  53.57 
 
 		 349 aa  347  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5095  rod shape-determining protein MreB  55.12 
 
 		 345 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58150  rod shape-determining protein MreB  55.12 
 
 		 345 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.138961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0375  rod shape-determining protein MreB  53.29 
 
 		 336 aa  347  2e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0515  rod shape-determining protein MreB  54.76 
 
 		 352 aa  347  2e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  55.72 
 
 		 345 aa  347  2e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  55.72 
 
 		 345 aa  347  2e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1648  rod shape-determining protein MreB  54.76 
 
 		 352 aa  347  2e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.03031e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1874  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  52.84 
 
 		 336 aa  347  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  54.49 
 
 		 347 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  53.6 
 
 		 346 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  54.49 
 
 		 347 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00264  rod shape-determining protein MreB  54.63 
 
 		 347 aa  346  3e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000119217  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  53.27 
 
 		 349 aa  346  4e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  51.34 
 
 		 339 aa  346  4e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2820  rod shape-determining protein MreB  56.69 
 
 		 346 aa  345  4e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  51.34 
 
 		 339 aa  346  4e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  51.32 
 
 		 359 aa  345  5e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  53.59 
 
 		 347 aa  345  5e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  52.96 
 
 		 346 aa  345  5e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  54.03 
 
 		 347 aa  345  5e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>