More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1555 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1555  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 341 aa  671    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.442769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1993  rod shape-determining protein MreB  70.88 
 
 		 340 aa  500  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.874884  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0665  rod shape-determining protein MreB  72.73 
 
 		 341 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000200896  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1406  rod shape-determining protein MreB  70.92 
 
 		 340 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.869118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0344  rod shape-determining protein MreB  71.22 
 
 		 340 aa  454  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0112472 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1172  rod shape-determining protein MreB  60.41 
 
 		 341 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.245096  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1917  rod shape-determining protein MreB  57.35 
 
 		 340 aa  408  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.695972  hitchhiker  0.000105138 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  55.26 
 
 		 344 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  54.65 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  54.95 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  53.66 
 
 		 354 aa  365  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  56.46 
 
 		 346 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  54.65 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  53.45 
 
 		 342 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  54.95 
 
 		 347 aa  364  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  56.29 
 
 		 344 aa  364  1e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  54.95 
 
 		 347 aa  364  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  54.44 
 
 		 350 aa  363  3e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  56.06 
 
 		 346 aa  361  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  55.89 
 
 		 346 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 344 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  52.52 
 
 		 343 aa  360  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  54.05 
 
 		 347 aa  359  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  54.05 
 
 		 347 aa  358  6e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  54.65 
 
 		 344 aa  358  7e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  54.05 
 
 		 347 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  54.05 
 
 		 347 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 344 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  54.19 
 
 		 343 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  54.08 
 
 		 343 aa  357  1.9999999999999998e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1150  rod shape-determining protein MreB  52.84 
 
 		 345 aa  356  3.9999999999999996e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564796 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  53.27 
 
 		 345 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  56.19 
 
 		 346 aa  355  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  53.23 
 
 		 343 aa  355  5e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  52.84 
 
 		 344 aa  355  5e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 		 346 aa  355  6.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  52.94 
 
 		 343 aa  355  6.999999999999999e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  53.87 
 
 		 340 aa  355  8.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  52.85 
 
 		 348 aa  352  7e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1461  rod shape-determining protein MreB  53.5 
 
 		 347 aa  350  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000397491  unclonable  0.000000242005 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0375  rod shape-determining protein MreB  53.52 
 
 		 336 aa  349  4e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  51.35 
 
 		 359 aa  348  8e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0866  MreB/Mrl family cell shape determining protein  53.05 
 
 		 335 aa  347  1e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0187  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  50.9 
 
 		 344 aa  348  1e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00128251  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4060  rod shape-determining protein MreB  52.52 
 
 		 340 aa  347  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.203248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  51.38 
 
 		 340 aa  347  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  53.52 
 
 		 336 aa  347  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  52.24 
 
 		 348 aa  346  3e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  54.52 
 
 		 347 aa  345  4e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  53.08 
 
 		 346 aa  346  4e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  52.82 
 
 		 358 aa  345  4e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  55.08 
 
 		 349 aa  345  5e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  54.52 
 
 		 348 aa  345  5e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  53.64 
 
 		 346 aa  345  5e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  51.2 
 
 		 343 aa  345  7e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0300  rod shape-determining protein MreB  53.71 
 
 		 345 aa  344  1e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1388  rod shape-determining protein MreB  52.27 
 
 		 343 aa  344  1e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0149  rod shape-determining protein MreB  53.53 
 
 		 350 aa  343  2e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.126698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  51.21 
 
 		 342 aa  343  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 		 343 aa  343  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  54.37 
 
 		 344 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  51.64 
 
 		 348 aa  342  4e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  51.85 
 
 		 343 aa  342  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 		 339 aa  342  5e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1694  rod shape-determining protein MreB  50.75 
 
 		 346 aa  342  5e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  50.91 
 
 		 342 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  52.19 
 
 		 348 aa  342  5.999999999999999e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  52.11 
 
 		 358 aa  341  8e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4777  rod shape-determining protein MreB  52.15 
 
 		 353 aa  341  9e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529713  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0325  rod shape-determining protein MreB  50.45 
 
 		 346 aa  341  1e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208455  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1734  rod shape-determining protein MreB  51.5 
 
 		 344 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000550029  normal  0.180064 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0303  rod shape-determining protein MreB  50.45 
 
 		 346 aa  341  1e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0105  rod shape-determining protein MreB  53.24 
 
 		 350 aa  341  1e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  49.55 
 
 		 343 aa  341  1e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3391  rod shape-determining protein MreB  52.52 
 
 		 352 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.112256 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4170  rod shape-determining protein MreB  53.43 
 
 		 349 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000201977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  51.81 
 
 		 347 aa  340  2e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  51.81 
 
 		 347 aa  340  2e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1874  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  52.57 
 
 		 336 aa  340  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  52.91 
 
 		 344 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1465  rod shape-determining protein MreB  49.42 
 
 		 345 aa  339  4e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28948  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0330  rod shape-determining protein MreB  52.81 
 
 		 336 aa  339  5e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000934452  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0348  rod shape-determining protein MreB  52.81 
 
 		 336 aa  339  5e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0865019  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58150  rod shape-determining protein MreB  52.96 
 
 		 345 aa  339  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.138961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5095  rod shape-determining protein MreB  52.96 
 
 		 345 aa  339  5e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  51.23 
 
 		 368 aa  338  7e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17481  rod shape-determining protein MreB  52.51 
 
 		 360 aa  338  8e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0515  rod shape-determining protein MreB  54.33 
 
 		 352 aa  338  9.999999999999999e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  50.45 
 
 		 344 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1648  rod shape-determining protein MreB  54.33 
 
 		 352 aa  338  9.999999999999999e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.03031e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0933  rod shape-determining protein MreB  53.61 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.283099  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  53.61 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1397  rod shape-determining protein MreB  51.8 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  53.61 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  52.49 
 
 		 347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  52.94 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0940  rod shape-determining protein MreB  53.61 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0856  rod shape-determining protein MreB  52.82 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  53.61 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>