More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1172 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1172  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 341 aa  684    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.245096  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0344  rod shape-determining protein MreB  66.47 
 
 		 340 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0112472 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1993  rod shape-determining protein MreB  62.31 
 
 		 340 aa  442  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.874884  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1406  rod shape-determining protein MreB  64.6 
 
 		 340 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.869118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1555  rod shape-determining protein MreB  60.41 
 
 		 341 aa  397  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.442769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0665  rod shape-determining protein MreB  61 
 
 		 341 aa  393  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000200896  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1917  rod shape-determining protein MreB  53.39 
 
 		 340 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.695972  hitchhiker  0.000105138 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  51.93 
 
 		 343 aa  363  3e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  50.59 
 
 		 346 aa  359  4e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  51.46 
 
 		 346 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  48.66 
 
 		 340 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  51.5 
 
 		 343 aa  354  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  50.75 
 
 		 340 aa  354  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  52.21 
 
 		 346 aa  348  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  52.38 
 
 		 346 aa  348  6e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  50.9 
 
 		 368 aa  348  9e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  49.42 
 
 		 343 aa  348  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  50.9 
 
 		 343 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  51.02 
 
 		 346 aa  346  4e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  50.75 
 
 		 340 aa  345  4e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  52.65 
 
 		 344 aa  345  5e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  49.11 
 
 		 354 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  48.06 
 
 		 343 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  51.81 
 
 		 344 aa  342  4e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  48.35 
 
 		 342 aa  342  4e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  51.79 
 
 		 344 aa  342  7e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  51.62 
 
 		 347 aa  341  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  52.06 
 
 		 344 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  47.46 
 
 		 343 aa  341  1e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  51.76 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  51.47 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  51.76 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  51.47 
 
 		 344 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  51.18 
 
 		 344 aa  338  7e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 343 aa  338  7e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  49.56 
 
 		 346 aa  338  8e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  51.33 
 
 		 347 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  50.74 
 
 		 347 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  47.63 
 
 		 343 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  51.03 
 
 		 347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  50.44 
 
 		 347 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  50.44 
 
 		 347 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  49.56 
 
 		 348 aa  334  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0082  rod shape-determining protein MreB  49.39 
 
 		 366 aa  334  2e-90  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 		 345 aa  333  2e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 		 347 aa  332  4e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  48.66 
 
 		 350 aa  332  5e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  48.05 
 
 		 344 aa  330  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  48.07 
 
 		 343 aa  330  2e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0348  rod shape-determining protein MreB  50.92 
 
 		 336 aa  330  2e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0865019  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  51.39 
 
 		 336 aa  330  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 		 338 aa  330  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0330  rod shape-determining protein MreB  50.92 
 
 		 336 aa  330  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000934452  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  49.25 
 
 		 344 aa  330  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  47.31 
 
 		 343 aa  329  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0492  rod shape-determining protein MreB  49.28 
 
 		 346 aa  328  6e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152747  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  49.28 
 
 		 348 aa  328  8e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  49.28 
 
 		 347 aa  328  9e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  49.25 
 
 		 343 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  49.39 
 
 		 349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  47.15 
 
 		 339 aa  326  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0325  rod shape-determining protein MreB  46.85 
 
 		 346 aa  325  5e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208455  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0303  rod shape-determining protein MreB  46.85 
 
 		 346 aa  325  5e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  49.69 
 
 		 340 aa  325  5e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  47.76 
 
 		 342 aa  325  7e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  47.87 
 
 		 342 aa  325  7e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1694  rod shape-determining protein MreB  46.85 
 
 		 346 aa  325  8.000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  48.05 
 
 		 339 aa  325  9e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  49.23 
 
 		 339 aa  325  9e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  48.05 
 
 		 339 aa  325  9e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  49.26 
 
 		 347 aa  324  1e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  47.69 
 
 		 346 aa  324  1e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  48.05 
 
 		 339 aa  323  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  48.05 
 
 		 339 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  48.05 
 
 		 339 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  48.05 
 
 		 339 aa  323  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  48.05 
 
 		 339 aa  323  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  48.05 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  48.05 
 
 		 339 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  48.05 
 
 		 339 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0187  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  47.29 
 
 		 344 aa  323  2e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00128251  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  47.56 
 
 		 342 aa  323  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1388  rod shape-determining protein MreB  47.94 
 
 		 343 aa  323  3e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  48.05 
 
 		 339 aa  323  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  50.3 
 
 		 344 aa  322  4e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4060  rod shape-determining protein MreB  48.96 
 
 		 340 aa  322  4e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.203248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0100  rod shape-determining protein MreB  49.14 
 
 		 347 aa  322  6e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  47.21 
 
 		 359 aa  321  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0109  rod shape-determining protein Mbl  48.75 
 
 		 343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2125  rod shape-determining protein MreB  46.99 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.55936  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  48.66 
 
 		 348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  48.95 
 
 		 347 aa  319  3.9999999999999996e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0375  rod shape-determining protein MreB  47.9 
 
 		 336 aa  319  3.9999999999999996e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  48.95 
 
 		 347 aa  319  3.9999999999999996e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1150  rod shape-determining protein MreB  48.66 
 
 		 345 aa  319  5e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564796 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1874  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  48.36 
 
 		 336 aa  318  6e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  48.36 
 
 		 348 aa  318  6e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1397  rod shape-determining protein MreB  46.99 
 
 		 345 aa  318  7e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2128  rod shape-determining protein MreB  47.83 
 
 		 348 aa  318  7e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  47.81 
 
 		 348 aa  318  7e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>