More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0335 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0335  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
334 aa  663    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0920  rod shape-determining protein MreB  53.73 
 
 
336 aa  354  1e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1248  rod shape-determining protein MreB  51.06 
 
 
336 aa  349  3e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0105666  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1207  rod shape-determining protein MreB  51.06 
 
 
336 aa  349  3e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000344928  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0464  rod shape-determining protein MreB  55.14 
 
 
335 aa  347  1e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0330  rod shape-determining protein MreB  48.8 
 
 
336 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000934452  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0348  rod shape-determining protein MreB  48.8 
 
 
336 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0865019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  47.6 
 
 
343 aa  335  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  49.55 
 
 
344 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  48.48 
 
 
343 aa  334  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  49.69 
 
 
339 aa  333  4e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  50.76 
 
 
348 aa  333  4e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  49.7 
 
 
343 aa  332  6e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  47.88 
 
 
343 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  47.72 
 
 
344 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  48.48 
 
 
340 aa  327  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0375  rod shape-determining protein MreB  49.24 
 
 
336 aa  327  1.0000000000000001e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0109  rod shape-determining protein Mbl  48.17 
 
 
343 aa  326  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  47.9 
 
 
344 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  46.97 
 
 
346 aa  323  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  47.9 
 
 
344 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  47.9 
 
 
344 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 
339 aa  323  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  48.18 
 
 
340 aa  323  4e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0187  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  49.4 
 
 
344 aa  322  8e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00128251  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  47.18 
 
 
344 aa  321  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1694  rod shape-determining protein MreB  49.4 
 
 
346 aa  320  9.999999999999999e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  47.31 
 
 
347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  47.18 
 
 
344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1149  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  46.36 
 
 
344 aa  320  3e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000405935  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  47.01 
 
 
347 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0325  rod shape-determining protein MreB  49.1 
 
 
346 aa  319  3.9999999999999996e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208455  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0303  rod shape-determining protein MreB  49.1 
 
 
346 aa  319  3.9999999999999996e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  47.31 
 
 
347 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  47.27 
 
 
344 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  48.32 
 
 
340 aa  317  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  47.27 
 
 
344 aa  317  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2445  rod shape-determining protein Mbl  48.47 
 
 
345 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  47.27 
 
 
344 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3394  rod shape-determining protein Mbl  48.05 
 
 
333 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  45.59 
 
 
345 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  45.76 
 
 
350 aa  316  3e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3282  rod shape-determining protein Mbl  48.47 
 
 
333 aa  316  3e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000125947  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2155  rod shape-determining protein Mbl  47.85 
 
 
345 aa  316  4e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  46.15 
 
 
342 aa  315  5e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  46.08 
 
 
348 aa  315  9e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5455  rod shape-determining protein Mbl  47.88 
 
 
333 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5404  rod shape-determining protein Mbl  47.88 
 
 
333 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000385561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5550  rod shape-determining protein Mbl  47.88 
 
 
333 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000581144  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5400  rod shape-determining protein Mbl  47.88 
 
 
333 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000418455  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1397  rod shape-determining protein MreB  48.64 
 
 
345 aa  314  9.999999999999999e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  45.9 
 
 
343 aa  314  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  47.18 
 
 
347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4962  rod shape-determining protein Mbl  47.88 
 
 
333 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.96321e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4974  rod shape-determining protein Mbl  47.88 
 
 
333 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000021016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  45.99 
 
 
347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  45.99 
 
 
347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  46.95 
 
 
345 aa  314  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  46.41 
 
 
347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  47.96 
 
 
344 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5077  rod shape-determining protein Mbl  47.58 
 
 
333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000326742  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5128  rod shape-determining protein Mbl  47.58 
 
 
333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000379199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12650  rod shape-determining protein MreB  46.65 
 
 
345 aa  313  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  45.48 
 
 
348 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5520  rod shape-determining protein Mbl  47.58 
 
 
333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1465  rod shape-determining protein MreB  47.48 
 
 
345 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5369  rod shape-determining protein Mbl  47.58 
 
 
333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.813722 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  47.71 
 
 
343 aa  313  3.9999999999999997e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  45.87 
 
 
338 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  45.7 
 
 
347 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1937  rod shape-determining protein MreB  47.08 
 
 
347 aa  311  6.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000814712  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3798  rod shape-determining protein Mbl  47.58 
 
 
333 aa  311  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000087539  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0242  rod shape-determining protein MreB  46.75 
 
 
329 aa  310  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312684  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  46.04 
 
 
344 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5095  rod shape-determining protein MreB  46.77 
 
 
345 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58150  rod shape-determining protein MreB  46.77 
 
 
345 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.138961  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  45.24 
 
 
345 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  45.81 
 
 
347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  44.88 
 
 
347 aa  309  4e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  44.88 
 
 
347 aa  309  4e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  42.73 
 
 
342 aa  309  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  48.04 
 
 
342 aa  308  8e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  47.24 
 
 
336 aa  308  8e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  45.62 
 
 
347 aa  308  9e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0061  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  47.08 
 
 
337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2835  rod shape-determining protein Mbl  46.48 
 
 
345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1993  rod shape-determining protein MreB  45.15 
 
 
340 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.874884  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1420  rod shape-determining protein MreB  45.9 
 
 
339 aa  307  1.0000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  44.44 
 
 
354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  48.04 
 
 
342 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  45.32 
 
 
347 aa  307  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  44.55 
 
 
343 aa  307  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  45.32 
 
 
347 aa  307  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  45.32 
 
 
347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  46.46 
 
 
345 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  46.46 
 
 
345 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0838  rod shape-determining protein MreB  46.46 
 
 
345 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00330287  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  44.55 
 
 
343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  45.9 
 
 
339 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2374  rod shape-determining protein Mbl  44.79 
 
 
342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0449993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>