More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0464 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0464  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 335 aa  649    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0920  rod shape-determining protein MreB  73.43 
 
 		 336 aa  503  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1207  rod shape-determining protein MreB  65.37 
 
 		 336 aa  443  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000344928  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1248  rod shape-determining protein MreB  65.37 
 
 		 336 aa  443  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0105666  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0335  rod shape-determining protein MreB  55.82 
 
 		 334 aa  364  1e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  52.69 
 
 		 343 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  53.47 
 
 		 340 aa  352  4e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  53.47 
 
 		 343 aa  348  6e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  53.75 
 
 		 344 aa  348  1e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  50.75 
 
 		 343 aa  343  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  50.76 
 
 		 342 aa  342  4e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  53.17 
 
 		 340 aa  342  5e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  53.5 
 
 		 339 aa  341  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  52.55 
 
 		 343 aa  341  1e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0061  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  55.05 
 
 		 337 aa  341  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  52.6 
 
 		 336 aa  340  2.9999999999999998e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  52.4 
 
 		 347 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  53.31 
 
 		 343 aa  338  5e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3282  rod shape-determining protein Mbl  51.54 
 
 		 333 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000125947  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0109  rod shape-determining protein Mbl  52.76 
 
 		 343 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  52.37 
 
 		 345 aa  338  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  54.41 
 
 		 348 aa  338  9.999999999999999e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1149  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  51.06 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000405935  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  50.31 
 
 		 345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  51.96 
 
 		 340 aa  336  3.9999999999999995e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2835  rod shape-determining protein Mbl  51.09 
 
 		 345 aa  335  5e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  52.58 
 
 		 344 aa  333  3e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  51.36 
 
 		 343 aa  332  7.000000000000001e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  50.76 
 
 		 346 aa  331  8e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3394  rod shape-determining protein Mbl  50.62 
 
 		 333 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  49.09 
 
 		 342 aa  331  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  51.38 
 
 		 343 aa  330  2e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  50.6 
 
 		 342 aa  330  2e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1248  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  51.85 
 
 		 345 aa  330  3e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0506008  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  51.06 
 
 		 343 aa  330  3e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  51.67 
 
 		 338 aa  329  4e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  51.2 
 
 		 344 aa  328  6e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  49.55 
 
 		 344 aa  328  6e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  51.2 
 
 		 344 aa  328  6e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  50.46 
 
 		 344 aa  328  7e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  51.2 
 
 		 344 aa  328  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  50.31 
 
 		 348 aa  328  9e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  50.31 
 
 		 347 aa  328  9e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  50.46 
 
 		 347 aa  328  9e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  50.46 
 
 		 347 aa  328  9e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  48.48 
 
 		 350 aa  328  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  52.4 
 
 		 340 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  49.25 
 
 		 354 aa  327  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  50.74 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  51.34 
 
 		 339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  52.1 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  50.74 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  50.6 
 
 		 344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12650  rod shape-determining protein MreB  50.31 
 
 		 345 aa  327  3e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0049  rod shape-determining protein MreB  50.91 
 
 		 347 aa  326  3e-88  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.483131  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  48.96 
 
 		 347 aa  326  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1005  rod shape-determining protein MreB  49.69 
 
 		 347 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  51.2 
 
 		 347 aa  325  5e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  50.92 
 
 		 345 aa  325  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  50.6 
 
 		 344 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  50.92 
 
 		 345 aa  325  5e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0838  rod shape-determining protein MreB  50.92 
 
 		 345 aa  325  5e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00330287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  52.89 
 
 		 339 aa  325  5e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 		 348 aa  325  6e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  50.6 
 
 		 344 aa  325  6e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  50.61 
 
 		 347 aa  325  6e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  50.61 
 
 		 347 aa  325  6e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000533641  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2133  rod shape-determining protein Mbl  49.37 
 
 		 343 aa  325  7e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0933  rod shape-determining protein MreB  50.61 
 
 		 345 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.283099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0940  rod shape-determining protein MreB  50.61 
 
 		 345 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0973  rod shape-determining protein MreB  50.61 
 
 		 345 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118066  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  50.61 
 
 		 345 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  51.81 
 
 		 339 aa  324  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5404  rod shape-determining protein Mbl  49.25 
 
 		 333 aa  324  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000385561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  51.81 
 
 		 339 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5128  rod shape-determining protein Mbl  50 
 
 		 333 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000379199  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  51.81 
 
 		 339 aa  324  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4962  rod shape-determining protein Mbl  50 
 
 		 333 aa  324  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.96321e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  51.81 
 
 		 339 aa  324  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4974  rod shape-determining protein Mbl  50 
 
 		 333 aa  324  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000021016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5369  rod shape-determining protein Mbl  50 
 
 		 333 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.813722 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  51.81 
 
 		 339 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5520  rod shape-determining protein Mbl  50 
 
 		 333 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5455  rod shape-determining protein Mbl  49.25 
 
 		 333 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 347 aa  324  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  51.81 
 
 		 339 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  49.39 
 
 		 347 aa  324  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  51.81 
 
 		 339 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  51.88 
 
 		 344 aa  323  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 347 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  51.81 
 
 		 339 aa  323  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3798  rod shape-determining protein Mbl  50 
 
 		 333 aa  324  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000087539  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  51.81 
 
 		 339 aa  323  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 368 aa  323  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4763  rod shape-determining protein Mbl  52.94 
 
 		 328 aa  323  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000280779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  51.81 
 
 		 339 aa  323  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5550  rod shape-determining protein Mbl  49.69 
 
 		 333 aa  323  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000581144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 345 aa  323  3e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>