More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2445 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2445  rod shape-determining protein Mbl  100 
 
 
345 aa  683    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2155  rod shape-determining protein Mbl  98.26 
 
 
345 aa  675    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  65.05 
 
 
339 aa  433  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  62.46 
 
 
342 aa  428  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  63.91 
 
 
344 aa  423  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0109  rod shape-determining protein Mbl  61.92 
 
 
343 aa  408  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0242  rod shape-determining protein MreB  60.31 
 
 
329 aa  393  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2374  rod shape-determining protein Mbl  57.36 
 
 
342 aa  388  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0449993  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  57.81 
 
 
345 aa  383  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  56.44 
 
 
345 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  54.63 
 
 
346 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  55.59 
 
 
340 aa  379  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  55.59 
 
 
340 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2749  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  57.63 
 
 
339 aa  378  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5077  rod shape-determining protein Mbl  56.97 
 
 
333 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000326742  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3144  rod shape-determining protein Mbl  58.93 
 
 
344 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5404  rod shape-determining protein Mbl  55.73 
 
 
333 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000385561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5128  rod shape-determining protein Mbl  56.04 
 
 
333 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000379199  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4962  rod shape-determining protein Mbl  56.04 
 
 
333 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.96321e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4974  rod shape-determining protein Mbl  56.04 
 
 
333 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000021016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5455  rod shape-determining protein Mbl  55.73 
 
 
333 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5520  rod shape-determining protein Mbl  56.04 
 
 
333 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3394  rod shape-determining protein Mbl  56.21 
 
 
333 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3282  rod shape-determining protein Mbl  56.21 
 
 
333 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000125947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4763  rod shape-determining protein Mbl  60.06 
 
 
328 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000280779  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1149  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  55.56 
 
 
344 aa  373  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000405935  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5400  rod shape-determining protein Mbl  55.73 
 
 
333 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000418455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5550  rod shape-determining protein Mbl  55.73 
 
 
333 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000581144  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5369  rod shape-determining protein Mbl  56.04 
 
 
333 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.813722 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  55.29 
 
 
343 aa  371  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3798  rod shape-determining protein Mbl  55.73 
 
 
333 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000087539  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2133  rod shape-determining protein Mbl  55.08 
 
 
343 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  55.86 
 
 
343 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 
343 aa  368  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  55.97 
 
 
339 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2835  rod shape-determining protein Mbl  53.7 
 
 
345 aa  365  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 
343 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  56.92 
 
 
344 aa  364  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 
339 aa  363  3e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 
339 aa  363  3e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 
339 aa  363  3e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 
339 aa  363  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 
339 aa  363  3e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 
339 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  53.47 
 
 
343 aa  363  3e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 
339 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 
339 aa  362  4e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 
339 aa  362  4e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  56.74 
 
 
340 aa  362  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 
339 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  56.44 
 
 
340 aa  362  5.0000000000000005e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  55.21 
 
 
338 aa  360  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  52.78 
 
 
342 aa  361  1e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  56.13 
 
 
344 aa  360  2e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  52.78 
 
 
342 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  52.84 
 
 
347 aa  358  7e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  52.71 
 
 
347 aa  358  8e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  51.84 
 
 
343 aa  358  9e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  52.92 
 
 
349 aa  358  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  53.94 
 
 
338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  54.29 
 
 
346 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  53.21 
 
 
347 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  55.73 
 
 
344 aa  356  2.9999999999999997e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  53.21 
 
 
347 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  51.53 
 
 
343 aa  355  5e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1461  rod shape-determining protein MreB  52.12 
 
 
347 aa  355  8.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000397491  unclonable  0.000000242005 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  53.37 
 
 
346 aa  354  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  55.49 
 
 
339 aa  354  1e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  53.21 
 
 
347 aa  354  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  50.92 
 
 
350 aa  354  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  52.54 
 
 
347 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  52.1 
 
 
346 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  53.68 
 
 
346 aa  352  4e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  51.51 
 
 
343 aa  352  5.9999999999999994e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  52.12 
 
 
354 aa  352  8e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1529  rod shape-determining protein MreB  52.24 
 
 
342 aa  351  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0844761  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0866  MreB/Mrl family cell shape determining protein  52.78 
 
 
335 aa  351  1e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  51.96 
 
 
345 aa  349  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  51.96 
 
 
345 aa  349  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0838  rod shape-determining protein MreB  51.96 
 
 
345 aa  349  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00330287  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0933  rod shape-determining protein MreB  52.45 
 
 
345 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.283099  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  52.45 
 
 
345 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0940  rod shape-determining protein MreB  52.45 
 
 
345 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0973  rod shape-determining protein MreB  52.45 
 
 
345 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118066  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  51.94 
 
 
347 aa  348  8e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2728  rod shape-determining protein MreB  51.64 
 
 
347 aa  348  8e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000992624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0856  rod shape-determining protein MreB  52.76 
 
 
345 aa  347  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  53.52 
 
 
336 aa  347  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  53.85 
 
 
348 aa  347  1e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  52.6 
 
 
342 aa  347  2e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1388  rod shape-determining protein MreB  52.02 
 
 
343 aa  347  2e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  51.84 
 
 
344 aa  347  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1150  rod shape-determining protein MreB  50.77 
 
 
345 aa  347  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564796 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0300  rod shape-determining protein MreB  52.45 
 
 
345 aa  345  5e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  51.34 
 
 
344 aa  345  5e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5095  rod shape-determining protein MreB  50.45 
 
 
345 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58150  rod shape-determining protein MreB  50.45 
 
 
345 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.138961  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0100  rod shape-determining protein MreB  51.22 
 
 
347 aa  344  1e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1215  rod shape-determining protein MreB  54.55 
 
 
333 aa  344  1e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.020325  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4170  rod shape-determining protein MreB  51.34 
 
 
349 aa  344  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000201977  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>