More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_63463 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_63463  predicted protein  100 
 
 
274 aa  557  1e-158  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0831257 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10841  peroxisomal D3,D2-enoyl-CoA isomerase (AFU_orthologue; AFUA_6G04040)  36.73 
 
 
361 aa  181  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.026831  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01078  conserved hypothetical protein  36.33 
 
 
267 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47981  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.88 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1343  enoyl-CoA hydratase  28.19 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0540  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.95 
 
 
245 aa  89  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0616524  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3828  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.61 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.768102 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0598  enoyl-CoA hydratase  28.81 
 
 
258 aa  88.6  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0577  enoyl-CoA hydratase  28.81 
 
 
258 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.11 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.98 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02716  conserved hypothetical protein  28.52 
 
 
271 aa  87.4  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724816  normal  0.149174 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1155  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.29 
 
 
279 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2371  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.22 
 
 
254 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60618  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4035  enoyl-CoA hydratase  31.05 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02193  enoyl-CoA hydratase  29 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.114495  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.74 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.234346  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.11 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0673  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  27.24 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4083  enoyl-CoA hydratase  28.57 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543803  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0820  enoyl-CoA hydratase  29.52 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.37 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1899  enoyl-CoA hydratase  26.64 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  24.9 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4526  enoyl-CoA hydratase  29.41 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3326  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2745  enoyl-CoA hydratase  31.75 
 
 
255 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0301258  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2106  enoyl-CoA hydratase  31.75 
 
 
255 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  25.4 
 
 
256 aa  79  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2718  enoyl-CoA hydratase  31.75 
 
 
255 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.189949  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2745  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.46 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0562194  normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3932  enoyl-CoA hydratase  27.05 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1027  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.14 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_5527  predicted protein  30.3 
 
 
170 aa  77.8  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.305433  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3908  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.12 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4199  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.88 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0335602  hitchhiker  0.000324097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0414  enoyl-CoA hydratase  29.49 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0435111  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5771  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.91 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2587  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.56 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000356951  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  29.38 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  25.91 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.13 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0855864 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0809  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.58 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.044471  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.58 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000721466  hitchhiker  0.00000000959721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0777  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.58 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3582  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.58 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000838255  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0684  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.6 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4185  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.81 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3473  enoyl-CoA hydratase  29.84 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0427069  normal  0.591102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2705  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.54 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  26.44 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0764  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.61 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3240  enoyl-CoA hydratase  32.77 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596711  hitchhiker  0.0000100182 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0749  enoyl-CoA hydratase  32.77 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.102863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0721  enoyl-CoA hydratase  32.77 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000678732  hitchhiker  0.00168791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6922  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.95 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  26.67 
 
 
263 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1462  enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.58 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.97 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000610826 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  25.74 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  27.34 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  31.31 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4299  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.29 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3818  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.55 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0388  enoyl-CoA hydratase  29.21 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3892  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.55 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594401  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2840  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.8 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.339924  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.47 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  25.64 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0649  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.97 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4289  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.97 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186398  normal  0.756398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2485  enoyl-CoA hydratase  25.66 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05916  enoyl-CoA hydratase (Eurofung)  31.32 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295699  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3804  enoyl-CoA hydratase  31.02 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726553  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0581  enoyl-CoA hydratase  32.64 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4253  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.32 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.27 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2861  enoyl-CoA hydratase  28 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.742849  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  27.78 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.22 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.24 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6045  enoyl-CoA hydratase  31.05 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
258 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4150  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.1 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135617  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3512  enoyl-CoA hydratase  25.85 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.34 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.8 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  26.2 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.49 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.51 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  30.41 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1488  enoyl-CoA hydratase  29.1 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4579  enoyl-CoA hydratase  28.28 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781565  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  29.84 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3902  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.96 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.37 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  23.05 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  28.57 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>