More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_5527 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_5527  predicted protein  100 
 
 
170 aa  353  8.999999999999999e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.305433  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0684  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.41 
 
 
256 aa  120  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 
246 aa  120  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000610826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 
262 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0764  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 
245 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3582  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 
245 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000838255  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0809  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 
245 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.044471  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 
245 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000721466  hitchhiker  0.00000000959721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0777  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 
245 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160248  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3240  enoyl-CoA hydratase  38.51 
 
 
245 aa  117  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596711  hitchhiker  0.0000100182 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0540  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.82 
 
 
245 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0616524  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0749  enoyl-CoA hydratase  38.51 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.102863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0721  enoyl-CoA hydratase  38.51 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000678732  hitchhiker  0.00168791 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3908  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.93 
 
 
245 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.6 
 
 
246 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4199  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 
245 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0335602  hitchhiker  0.000324097 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1462  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.5 
 
 
253 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3229  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.36 
 
 
245 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547446  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.87 
 
 
258 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0855864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56250  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.87 
 
 
257 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2745  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.5 
 
 
258 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0562194  normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4035  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 
256 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4899  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.25 
 
 
257 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3932  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
274 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1343  enoyl-CoA hydratase  36.16 
 
 
264 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0476  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
254 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0577  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 
258 aa  104  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0598  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 
258 aa  104  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 
264 aa  103  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.75 
 
 
261 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0581  enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 
256 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4083  enoyl-CoA hydratase  37.06 
 
 
257 aa  101  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543803  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3473  enoyl-CoA hydratase  37.06 
 
 
261 aa  101  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0427069  normal  0.591102 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3262  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.29 
 
 
257 aa  101  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4526  enoyl-CoA hydratase  32.54 
 
 
258 aa  100  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3326  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6045  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
255 aa  100  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4299  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.47 
 
 
253 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0388  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
254 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5771  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
258 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.88 
 
 
270 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1155  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.47 
 
 
279 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2106  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
255 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2840  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.63 
 
 
252 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.339924  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2745  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
255 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0301258  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2718  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
255 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.189949  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01078  conserved hypothetical protein  32.95 
 
 
267 aa  97.8  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47981  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1027  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.04 
 
 
264 aa  97.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1056  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.91 
 
 
245 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0389  enoyl-CoA hydratase  31.76 
 
 
258 aa  97.4  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00593018 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0367  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
254 aa  97.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0352  enoyl-CoA hydratase  33.53 
 
 
254 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2371  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.09 
 
 
254 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60618  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0820  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 
254 aa  96.3  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1575  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
250 aa  96.7  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00524815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.91 
 
 
253 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.234346  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3336  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
245 aa  95.9  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.212368  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02193  enoyl-CoA hydratase  35.33 
 
 
254 aa  96.3  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.114495  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4449  enoyl-CoA hydratase  36.31 
 
 
249 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1846  enoyl-CoA hydratase  31.95 
 
 
263 aa  95.5  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2485  enoyl-CoA hydratase  36.08 
 
 
253 aa  95.5  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3630  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.71 
 
 
259 aa  95.9  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.71 
 
 
259 aa  95.9  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287025  decreased coverage  0.00358317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0450  enoyl-CoA hydratase  31.18 
 
 
258 aa  95.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.96 
 
 
260 aa  94.4  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.88 
 
 
245 aa  94  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  32.37 
 
 
262 aa  94  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0664  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 
256 aa  94  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.556097  normal  0.974332 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  35.03 
 
 
261 aa  93.6  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3512  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 
254 aa  94  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.18 
 
 
270 aa  93.6  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1899  enoyl-CoA hydratase  35.93 
 
 
258 aa  92.8  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.53 
 
 
255 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2861  enoyl-CoA hydratase  31.74 
 
 
257 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.742849  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4089  enoyl-CoA hydratase  32.54 
 
 
251 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3732  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.14 
 
 
248 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.407726  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  34.5 
 
 
259 aa  92.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2031  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.14 
 
 
248 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1500  enoyl-CoA hydratase  33.9 
 
 
285 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4029  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 
254 aa  92  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  35.26 
 
 
266 aa  90.9  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  34.68 
 
 
257 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3828  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.48 
 
 
260 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.768102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2378  enoyl-CoA hydratase  36.75 
 
 
257 aa  90.5  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.0124738 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1523  enoyl-CoA hydratase  34.27 
 
 
285 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.61089  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1500  enoyl-CoA hydratase  34.27 
 
 
285 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  30.06 
 
 
263 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.35 
 
 
259 aa  89.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2587  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.69 
 
 
255 aa  89.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000356951  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4299  enoyl-CoA hydratase  30.59 
 
 
272 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621755  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  34.15 
 
 
260 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.37 
 
 
264 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.61 
 
 
260 aa  89.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.42 
 
 
252 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.593041  normal  0.157117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3325  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.42 
 
 
250 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4145  enoyl-CoA hydratase  30.59 
 
 
272 aa  89  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4070  enoyl-CoA hydratase  30.59 
 
 
272 aa  89  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  30.81 
 
 
283 aa  88.2  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1748  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
260 aa  88.6  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.828974  normal  0.0355231 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 
260 aa  87.8  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.14 
 
 
255 aa  87.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>