More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_37328 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_37328  predicted protein  100 
 
 
207 aa  436  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49787  predicted protein  94.12 
 
 
153 aa  307  9e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293303  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48444  predicted protein  93.46 
 
 
153 aa  306  1.0000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46387  predicted protein  95.92 
 
 
623 aa  304  5.0000000000000004e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.7871  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29016  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  76.04 
 
 
1073 aa  300  7.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.234207  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50392  predicted protein  91.5 
 
 
153 aa  300  7.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.622555  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38407  predicted protein  70.67 
 
 
219 aa  220  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.508108  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79721  alpha-ketoglutarate dehydrogenase  45.55 
 
 
1015 aa  177  1e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0668593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1928  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  50.31 
 
 
996 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65661  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1646  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  50.31 
 
 
996 aa  176  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.44941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1584  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  50.31 
 
 
1009 aa  176  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49109  predicted protein  47.68 
 
 
994 aa  175  4e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.808055  normal  0.27646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0922  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  49.69 
 
 
995 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.178538 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05571  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring) (Eurofung)  44.58 
 
 
1048 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.532364 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01730  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring), putative  47.53 
 
 
1055 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256683  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2164  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  51.61 
 
 
986 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.668093  normal  0.0814418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0395  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  48.17 
 
 
985 aa  171  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.25918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0191  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.95 
 
 
991 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3398  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  48.78 
 
 
994 aa  170  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0184  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47.56 
 
 
985 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1126  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  51.3 
 
 
985 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108055  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0278  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.95 
 
 
985 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0156  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  51.95 
 
 
984 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0544  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.95 
 
 
985 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.898698  normal  0.505126 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0542  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.39 
 
 
989 aa  167  9e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1180  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  48.03 
 
 
950 aa  166  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2609  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  49.03 
 
 
941 aa  165  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855464 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2940  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45.28 
 
 
907 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000647014  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0111  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  49.04 
 
 
961 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4190  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  44.44 
 
 
920 aa  162  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133168  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19420  alpha-ketoglutarate decarboxylase  50 
 
 
1317 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.673379  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4122  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47.88 
 
 
998 aa  162  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2941  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47.02 
 
 
998 aa  161  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196108  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1623  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  46.41 
 
 
949 aa  161  7e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0025  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  49.08 
 
 
999 aa  161  7e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0578  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47.68 
 
 
905 aa  161  8.000000000000001e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0231  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  48.21 
 
 
987 aa  160  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29770  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.65 
 
 
943 aa  160  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1852  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  49.36 
 
 
1004 aa  160  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1923  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  49.36 
 
 
1004 aa  160  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2395  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.71 
 
 
981 aa  160  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0106518 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1732  alpha-ketoglutarate decarboxylase  43.04 
 
 
1277 aa  160  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.925141  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3681  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.95 
 
 
994 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.979305 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1260  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.16 
 
 
898 aa  159  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3362  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45.22 
 
 
946 aa  159  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.044527 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1298  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.53 
 
 
970 aa  159  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.488801  normal  0.570221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1454  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.84 
 
 
1083 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0102  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47.13 
 
 
961 aa  159  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0933  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47.24 
 
 
1001 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1219  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  45.57 
 
 
1250 aa  158  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.56639  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1952  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.79 
 
 
937 aa  158  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2199  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  44.44 
 
 
943 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2370  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  42.41 
 
 
1220 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.604296  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4994  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  41.62 
 
 
952 aa  156  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5752  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.1 
 
 
920 aa  156  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.18577  normal  0.0679634 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1384  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.71 
 
 
935 aa  156  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.761242  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2009  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.44 
 
 
943 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3512  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.52 
 
 
943 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679616 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0422  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.34 
 
 
985 aa  156  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18450  alpha-ketoglutarate decarboxylase  44.16 
 
 
1303 aa  156  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0618505  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2968  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.71 
 
 
935 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2881  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.71 
 
 
935 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2449  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45.64 
 
 
894 aa  156  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2504  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45.51 
 
 
1018 aa  155  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1217  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.68 
 
 
943 aa  155  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.718447  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1154  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.4 
 
 
945 aa  155  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3760  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.05 
 
 
943 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0361197  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1614  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.86 
 
 
943 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3492  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1086  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.37 
 
 
945 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0889  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47.5 
 
 
963 aa  155  6e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.315483  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4649  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.51 
 
 
954 aa  154  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.355037 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0803  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.46 
 
 
963 aa  154  7e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1665  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  39.05 
 
 
943 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.856909  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1213  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.23 
 
 
987 aa  154  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326546  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07730  alpha-ketoglutarate decarboxylase  42.68 
 
 
1236 aa  154  9e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0739181  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3970  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45.12 
 
 
994 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5027  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  45.34 
 
 
932 aa  154  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139273  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00685  alpha-ketoglutarate decarboxylase  40.21 
 
 
933 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2910  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  40.21 
 
 
933 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.644532  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1484  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.64 
 
 
954 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0724097 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00674  hypothetical protein  40.21 
 
 
933 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0738  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.21 
 
 
933 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2503  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.27 
 
 
943 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858572  normal  0.126982 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1430  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.64 
 
 
954 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0645  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.21 
 
 
933 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0818  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.21 
 
 
933 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.919234  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1274  alpha-ketoglutarate decarboxylase  44.3 
 
 
1294 aa  153  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306408  normal  0.246793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0773  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.21 
 
 
933 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0752  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.21 
 
 
933 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1028  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.64 
 
 
954 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3607  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.15 
 
 
1006 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0522268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1390  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.64 
 
 
954 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1508  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.64 
 
 
954 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2930  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.21 
 
 
933 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1267  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.64 
 
 
937 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.209751  normal  0.0974265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4189  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  38.57 
 
 
943 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2556  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.24 
 
 
954 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2228  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.74 
 
 
940 aa  153  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.424063  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0829  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.02 
 
 
940 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.196353  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1747  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.64 
 
 
954 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>