More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_35513 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_35513  predicted protein  100 
 
 		 234 aa  473  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122727  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12354  predicted protein  79.49 
 
 		 77 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.148057  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12355  predicted protein  75 
 
 		 128 aa  102  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.424994  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02191  50S ribosomal protein L7/L12  56.72 
 
 		 132 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.605695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1803  50S ribosomal protein L12P  58.21 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  56.72 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  54.05 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0570  50S ribosomal protein L7/L12  58.21 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000202265  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0030  50S ribosomal protein L7/L12  53.73 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0666406  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  56.72 
 
 		 124 aa  65.1  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  55.22 
 
 		 124 aa  64.3  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1700  50S ribosomal protein L7/L12  58.21 
 
 		 125 aa  64.3  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  58.46 
 
 		 125 aa  64.3  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  57.35 
 
 		 126 aa  63.9  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  55.22 
 
 		 128 aa  64.3  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  58.21 
 
 		 126 aa  63.9  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02771  50S ribosomal protein L7/L12  53.73 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0831676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27801  hypothetical protein  52.24 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  56.72 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5960  50S ribosomal protein L7/L12  65.45 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  61.82 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  56.72 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  55.88 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90602  60S ribosomal protein L7/L12  46.27 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0392  50S ribosomal protein L7/L12  53.73 
 
 		 124 aa  62  0.000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  47.76 
 
 		 126 aa  62  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  55.22 
 
 		 125 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 123 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 124 aa  62  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 124 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 125 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  55.22 
 
 		 125 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  52.78 
 
 		 119 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  55.22 
 
 		 125 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1568  50S ribosomal protein L7/L12  52.24 
 
 		 131 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0318  50S ribosomal protein L7/L12  53.73 
 
 		 126 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132009  hitchhiker  0.00085028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  58.18 
 
 		 126 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  55.22 
 
 		 125 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  52.24 
 
 		 126 aa  61.2  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  49.38 
 
 		 128 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3840  50S ribosomal protein L7/L12  58.18 
 
 		 125 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00160785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3690  50S ribosomal protein L7/L12  52.24 
 
 		 120 aa  61.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100711  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_8310  PRPL12; Chloroplast ribosomal protein L12; Chloroplast large ribosomal subunit protein L12  64.06 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.481378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2668  ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 129 aa  60.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.555743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0314  50S ribosomal protein L7/L12  52.63 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000853139  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4385  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 125 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4016  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 125 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.797485  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  55.22 
 
 		 121 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  55.22 
 
 		 121 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1386  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 121 aa  60.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000070815  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1416  50S ribosomal protein L12P  52.94 
 
 		 121 aa  60.8  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000264913  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  53.73 
 
 		 124 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  52.24 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0577  50S ribosomal protein L7/L12  53.73 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000019471  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3476  50S ribosomal protein L7/L12  52.24 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145567  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0563  50S ribosomal protein L7/L12  53.73 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000998366  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  56.36 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2468  50S ribosomal protein L7/L12  50.75 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0203  50S ribosomal protein L7/L12  49.25 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  56.36 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0597  50S ribosomal protein L7/L12  53.73 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0210666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  53.73 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02211  50S ribosomal protein L7/L12  49.25 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0266  50S ribosomal protein L7/L12  55.22 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02191  50S ribosomal protein L7/L12  49.25 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  52.24 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  55.88 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  55.38 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1668  50S ribosomal protein L7/L12  58.18 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  58.18 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02301  50S ribosomal protein L7/L12  49.25 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  55.38 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  52.24 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5115  ribosomal protein L7/L12  53.73 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.730152 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  50.75 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  34.29 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29840  LSU ribosomal protein L12P  60 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  56.14 
 
 		 129 aa  57.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0990  50S ribosomal protein L7/L12  53.85 
 
 		 124 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00236758  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1957  ribosomal protein L7/L12  47.76 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20970  50S ribosomal protein L7/L12  56.36 
 
 		 129 aa  57.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  55.22 
 
 		 124 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0227  ribosomal protein L7/L12  60 
 
 		 126 aa  58.2  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17260  LSU ribosomal protein L12P  60 
 
 		 129 aa  58.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  46.27 
 
 		 125 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  34.51 
 
 		 124 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23950  LSU ribosomal protein L12P  60 
 
 		 129 aa  58.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  58.18 
 
 		 126 aa  58.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1144  ribosomal protein L7/L12  57.89 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000177036  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  53.62 
 
 		 125 aa  57  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0442  ribosomal protein L7/L12  47.76 
 
 		 130 aa  57.4  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  37.9 
 
 		 125 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  54.41 
 
 		 127 aa  57.4  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  58.18 
 
 		 126 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0480  ribosomal protein L7/L12  55.71 
 
 		 121 aa  57  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  46.91 
 
 		 123 aa  57.4  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1823  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 124 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>