More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12355 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_12355  predicted protein  100 
 
 
128 aa  245  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.424994  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12354  predicted protein  79.22 
 
 
77 aa  107  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.148057  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35513  predicted protein  76.81 
 
 
234 aa  99.4  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122727  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  43.31 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  41.09 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  37.8 
 
 
124 aa  73.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  43.31 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  48.33 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  43.2 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  44.63 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_8310  PRPL12; Chloroplast ribosomal protein L12; Chloroplast large ribosomal subunit protein L12  49.23 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.481378  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  37.4 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2668  ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.555743  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  57.75 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  56.94 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  60 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  59.7 
 
 
123 aa  67  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0446  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
121 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690504  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0476  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
121 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  58.33 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0479  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
121 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00592833  hitchhiker  0.00479203 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1803  50S ribosomal protein L12P  58.33 
 
 
123 aa  67  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4757  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
121 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0149649  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  59.15 
 
 
125 aa  67  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  58.21 
 
 
119 aa  67  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  35.88 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  56.94 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  57.75 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  50.54 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  35.2 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0392  50S ribosomal protein L7/L12  54.17 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  58.21 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  39.84 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  39.02 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  54.17 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2037  50S ribosomal protein L7/L12  58.33 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0646478  normal  0.703058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5087  50S ribosomal protein L7/L12  54.17 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167617  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  35.61 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0266  50S ribosomal protein L7/L12  43.85 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  54.17 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  56.94 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  56.94 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  56.94 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3840  50S ribosomal protein L7/L12  54.17 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00160785  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27801  hypothetical protein  43.33 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  36.67 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  36.67 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  54.17 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  54.17 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0563  50S ribosomal protein L7/L12  53.52 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000998366  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0262  50S ribosomal protein L12P  36.8 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.314795  normal  0.113093 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0577  50S ribosomal protein L7/L12  53.52 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000019471  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0570  50S ribosomal protein L7/L12  56.94 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000202265  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  36.96 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0442  ribosomal protein L7/L12  53.42 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  52.11 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3450  50S ribosomal protein L7/L12  40.16 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0256667  normal  0.0368357 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  55.88 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  52.78 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  54.05 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  54.05 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20970  50S ribosomal protein L7/L12  54.17 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  52.78 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  43.31 
 
 
125 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4385  50S ribosomal protein L7/L12  54.17 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90602  60S ribosomal protein L7/L12  35.77 
 
 
171 aa  63.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4016  50S ribosomal protein L7/L12  54.17 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.797485  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  40.94 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  42.28 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  52.78 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1668  50S ribosomal protein L7/L12  55.22 
 
 
126 aa  62.8  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5960  50S ribosomal protein L7/L12  58.21 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0227  ribosomal protein L7/L12  56.72 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  54.17 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3917  50S ribosomal protein L7/L12  54.17 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  52.78 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0848  50S ribosomal protein L7/L12  38.58 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  56.16 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  35.71 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  54.17 
 
 
123 aa  62  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  55.22 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0318  50S ribosomal protein L7/L12  38.58 
 
 
126 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132009  hitchhiker  0.00085028 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  54.93 
 
 
122 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29840  LSU ribosomal protein L12P  55.22 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17260  LSU ribosomal protein L12P  55.22 
 
 
129 aa  61.2  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  51.39 
 
 
126 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  51.39 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  38.58 
 
 
126 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1700  50S ribosomal protein L7/L12  52.78 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357459  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  38.41 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0751  ribosomal protein L7/L12  58.82 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.69161  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  41.46 
 
 
125 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0699  50S ribosomal protein L7/L12  56.72 
 
 
131 aa  61.6  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  54.17 
 
 
124 aa  60.8  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02191  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.605695  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  52.78 
 
 
126 aa  60.8  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  32.28 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02771  50S ribosomal protein L7/L12  52.24 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0831676  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  55.22 
 
 
128 aa  60.8  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  55.22 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>