More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_90602 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_90602  60S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
171 aa  325  2.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.287043 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02057  50S ribosomal protein L12 (AFU_orthologue; AFUA_4G09750)  53.67 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.09499  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00040  mitochondrion protein, putative  51.82 
 
 
146 aa  86.3  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0979015  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27801  hypothetical protein  42.31 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  41.35 
 
 
128 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02771  50S ribosomal protein L7/L12  43.86 
 
 
131 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0831676  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  42.19 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1568  50S ribosomal protein L7/L12  42.98 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12355  predicted protein  38.84 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.424994  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  44.53 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  46.09 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  46.09 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  41.73 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  42.4 
 
 
124 aa  72  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  42.11 
 
 
125 aa  72  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  46.88 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  45.31 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02191  50S ribosomal protein L7/L12  51.43 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.605695  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  45.31 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  42.97 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  39.53 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0203  50S ribosomal protein L7/L12  41.82 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  42.97 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  43.75 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  46.09 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  43.75 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02211  50S ribosomal protein L7/L12  51.39 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02301  50S ribosomal protein L7/L12  51.39 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02191  50S ribosomal protein L7/L12  51.39 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  42.19 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0639  50S ribosomal protein L7/L12  41.27 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.500427  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  42.97 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0442  ribosomal protein L7/L12  39.23 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12354  predicted protein  48.57 
 
 
77 aa  67.4  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.148057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  42.97 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  43.75 
 
 
126 aa  67  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  43.75 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  43.75 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  40.31 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3840  50S ribosomal protein L7/L12  43.75 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00160785  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  41.41 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_8310  PRPL12; Chloroplast ribosomal protein L12; Chloroplast large ribosomal subunit protein L12  38.74 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.481378  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0392  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  41.41 
 
 
125 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  38.17 
 
 
126 aa  63.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  41.41 
 
 
125 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0266  50S ribosomal protein L7/L12  40.8 
 
 
126 aa  63.2  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2675  ribosomal protein L7/L12  43.75 
 
 
126 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000113086  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1737  50S ribosomal protein L7/L12  41.6 
 
 
132 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  43.08 
 
 
129 aa  63.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1761  50S ribosomal protein L7/L12  41.6 
 
 
132 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0570  50S ribosomal protein L7/L12  52.78 
 
 
123 aa  62.8  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000202265  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  42.97 
 
 
123 aa  62.8  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  40.8 
 
 
129 aa  62  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  41.6 
 
 
127 aa  61.6  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2468  50S ribosomal protein L7/L12  47.14 
 
 
129 aa  61.6  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0318  50S ribosomal protein L7/L12  39.84 
 
 
126 aa  61.6  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132009  hitchhiker  0.00085028 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  32.8 
 
 
121 aa  61.6  0.000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3447  ribosomal protein L7/L12  36 
 
 
121 aa  61.2  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00096763  hitchhiker  0.00626302 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  50 
 
 
126 aa  61.2  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35513  predicted protein  46.27 
 
 
234 aa  61.2  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122727  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2153  50S ribosomal protein L7/L12  44.29 
 
 
128 aa  61.2  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3476  50S ribosomal protein L7/L12  39.84 
 
 
126 aa  60.8  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145567  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  32.8 
 
 
121 aa  60.5  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf211  50S ribosomal protein L7/L12  49.3 
 
 
123 aa  60.5  0.00000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0567  50S ribosomal protein L7/L12  39.2 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0262  50S ribosomal protein L12P  38.76 
 
 
133 aa  60.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.314795  normal  0.113093 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  37.5 
 
 
125 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  40.62 
 
 
127 aa  59.7  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  41.27 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3690  50S ribosomal protein L7/L12  52.86 
 
 
120 aa  59.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100711  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4385  50S ribosomal protein L7/L12  42.97 
 
 
125 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  41.6 
 
 
125 aa  59.7  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  34.4 
 
 
121 aa  59.7  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
126 aa  59.7  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  41.41 
 
 
125 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  41.27 
 
 
124 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4010  50S ribosomal protein L7/L12  46.58 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0094315  hitchhiker  0.00000000352658 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4016  50S ribosomal protein L7/L12  42.97 
 
 
125 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.797485  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  40.16 
 
 
125 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0023  50S ribosomal protein L7/L12  40 
 
 
133 aa  59.3  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212102  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0631  50S ribosomal protein L7/L12  40.31 
 
 
128 aa  59.3  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.141708  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1700  50S ribosomal protein L7/L12  38.28 
 
 
125 aa  58.9  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357459  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  36.92 
 
 
123 aa  59.3  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  36.8 
 
 
126 aa  58.2  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  36.8 
 
 
126 aa  58.2  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  41.6 
 
 
125 aa  58.5  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1175  50S ribosomal protein L7/L12  40.62 
 
 
126 aa  57.8  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000154127  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0597  50S ribosomal protein L7/L12  48.57 
 
 
123 aa  57.8  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0210666  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1700  50S ribosomal protein L7/L12  42.97 
 
 
125 aa  57.8  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.906348  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0204  ribosomal protein L7/L12  48.61 
 
 
121 aa  57.8  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0352  50S ribosomal protein L7/L12  42.97 
 
 
125 aa  57.8  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0338  50S ribosomal protein L7/L12  42.97 
 
 
125 aa  57.8  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.826751 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  49.3 
 
 
122 aa  57  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  37.04 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  39.67 
 
 
126 aa  57.4  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  36.8 
 
 
128 aa  57  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0209  ribosomal protein L7/L12  47.22 
 
 
121 aa  57  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000161356  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1017  50S ribosomal protein L7/L12  47.22 
 
 
131 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  35.61 
 
 
124 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>