More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0023 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0023  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
133 aa  250  4.0000000000000004e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212102  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  45.11 
 
 
129 aa  93.6  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
125 aa  87.8  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  47.66 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0168  50S ribosomal protein L7/L12  49.5 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.640563  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1017  50S ribosomal protein L7/L12  47.24 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221809 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0953  50S ribosomal protein L7/L12  50.5 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1761  50S ribosomal protein L7/L12  47.66 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1737  50S ribosomal protein L7/L12  47.66 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27801  hypothetical protein  44.44 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  41.48 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2555  50S ribosomal protein L7/L12  43.65 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113587  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0631  50S ribosomal protein L7/L12  45.67 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.141708  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  45.74 
 
 
124 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  45.74 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  50.41 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0262  50S ribosomal protein L12P  45.52 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.314795  normal  0.113093 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  39.06 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4010  50S ribosomal protein L7/L12  44.44 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0094315  hitchhiker  0.00000000352658 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  50.76 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  45.04 
 
 
125 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3476  50S ribosomal protein L7/L12  51.2 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145567  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  47.62 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  45.74 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  48.87 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  39.84 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  49.24 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  46.77 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  46.09 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  49.6 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1635  50S ribosomal protein L7/L12  45.67 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1253  50S ribosomal protein L7/L12  47.58 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  44.88 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  48.82 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  47.11 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  51.2 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  51.2 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  44.88 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  47.2 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  48.8 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  52 
 
 
125 aa  67  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  45.11 
 
 
125 aa  67  0.00000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  46.09 
 
 
126 aa  66.6  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  51.2 
 
 
126 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1548  ribosomal protein L7/L12  44.19 
 
 
127 aa  66.6  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4017  ribosomal protein L7/L12  40 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712821  normal  0.474419 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  34.38 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  34.38 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  45.45 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  46.09 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  51.2 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0790  50S ribosomal protein L7/L12  47.93 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.188773 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  50.4 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  48.8 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0442  ribosomal protein L7/L12  40.31 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0311  ribosomal protein L7/L12  48.76 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181788  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  50.4 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  43.31 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  45.45 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0699  50S ribosomal protein L7/L12  44.35 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  44.53 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02771  50S ribosomal protein L7/L12  46.62 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0831676  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  47.73 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  50.4 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  44.53 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5100  50S ribosomal protein L7/L12  47.58 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.125465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  41.09 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0318  50S ribosomal protein L7/L12  45.6 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132009  hitchhiker  0.00085028 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  45.86 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  45.6 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  42.74 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  45.83 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  48.8 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  45.65 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  44.53 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  44.53 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  46.4 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  42.62 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  40.94 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  46.28 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1568  50S ribosomal protein L7/L12  45.86 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2422  50S ribosomal protein L7/L12  42.97 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.401365  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  47.62 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  49.6 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1042  ribosomal protein L7/L12  48.25 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.343  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  47.2 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  47.62 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  45.16 
 
 
123 aa  62.8  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4532  50S ribosomal protein L7/L12  44.54 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  44.53 
 
 
127 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0990  50S ribosomal protein L7/L12  46.77 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00236758  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3840  50S ribosomal protein L7/L12  48.8 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00160785  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  60.27 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  45.11 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  46.77 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  45.11 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0209  ribosomal protein L7/L12  40.16 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000161356  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6636  ribosomal protein L7/L12  46.34 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>