More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_8310 on replicon NC_009369
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009369  OSTLU_8310  PRPL12; Chloroplast ribosomal protein L12; Chloroplast large ribosomal subunit protein L12  100 
 
 
138 aa  257  4e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.481378  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02057  50S ribosomal protein L12 (AFU_orthologue; AFUA_4G09750)  45.32 
 
 
184 aa  89.4  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.09499  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12355  predicted protein  50 
 
 
128 aa  89.4  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.424994  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  42.31 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35513  predicted protein  65.08 
 
 
234 aa  77  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122727  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12354  predicted protein  66.67 
 
 
77 aa  76.6  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.148057  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0023  50S ribosomal protein L7/L12  41.67 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212102  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90602  60S ribosomal protein L7/L12  38.41 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  43.18 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0168  50S ribosomal protein L7/L12  39.05 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.640563  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02771  50S ribosomal protein L7/L12  61.19 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0831676  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  40.46 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  38.46 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1568  50S ribosomal protein L7/L12  59.7 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  40.31 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  47.69 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0953  50S ribosomal protein L7/L12  40 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  44.96 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02191  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.605695  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  61.97 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  42.42 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  61.97 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  37.69 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  42.64 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  44.36 
 
 
125 aa  63.5  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  57.35 
 
 
125 aa  62  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  42.64 
 
 
126 aa  62  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  41.86 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  42.11 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  40.6 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  43.94 
 
 
126 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0570  50S ribosomal protein L7/L12  60.87 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000202265  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  42.42 
 
 
124 aa  61.6  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  41.18 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0442  ribosomal protein L7/L12  40.88 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  40.46 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  54.35 
 
 
124 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  61.19 
 
 
119 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  33.06 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1548  ribosomal protein L7/L12  58.93 
 
 
127 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  41.67 
 
 
126 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  37.98 
 
 
129 aa  61.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  36.92 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  39.39 
 
 
124 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  40.91 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0392  50S ribosomal protein L7/L12  59.42 
 
 
124 aa  60.5  0.000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  58.82 
 
 
121 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  58.82 
 
 
121 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  40.88 
 
 
127 aa  60.1  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  42.31 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  38.76 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  44.19 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  42.64 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  41.86 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  40.88 
 
 
129 aa  59.3  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  36.89 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0318  50S ribosomal protein L7/L12  54.41 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132009  hitchhiker  0.00085028 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2422  50S ribosomal protein L7/L12  57.97 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.401365  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  56.06 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0577  50S ribosomal protein L7/L12  54.93 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000019471  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0203  50S ribosomal protein L7/L12  59.32 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0266  50S ribosomal protein L7/L12  44.19 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0563  50S ribosomal protein L7/L12  54.93 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000998366  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  44.44 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3840  50S ribosomal protein L7/L12  58.82 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00160785  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02191  50S ribosomal protein L7/L12  59.32 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1803  50S ribosomal protein L12P  43.38 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  54.93 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02211  50S ribosomal protein L7/L12  59.32 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  66.04 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27801  hypothetical protein  40.58 
 
 
179 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  35.11 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  35.11 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  34.62 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  34.62 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3690  50S ribosomal protein L7/L12  54.29 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100711  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  41.67 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  42.96 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1823  50S ribosomal protein L7/L12  60.87 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2197  50S ribosomal protein L7/L12  36.89 
 
 
122 aa  57.8  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000379347  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  54.93 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  60.29 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2107  50S ribosomal protein L7/L12  36.89 
 
 
122 aa  57.8  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000324258  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  39.84 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4385  50S ribosomal protein L7/L12  58.82 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  43.41 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4016  50S ribosomal protein L7/L12  58.82 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.797485  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  38.46 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  58.21 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02301  50S ribosomal protein L7/L12  59.32 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  40.91 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  51.47 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  40.6 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  59.7 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1017  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221809 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  41.61 
 
 
128 aa  57.8  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
126 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1635  50S ribosomal protein L7/L12  38.93 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1820  ribosomal protein L7/L12  59.65 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>