More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12354 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_12354  predicted protein  100 
 
 
77 aa  142  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.148057  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35513  predicted protein  82.61 
 
 
234 aa  107  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122727  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12355  predicted protein  81.69 
 
 
128 aa  107  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.424994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  60.81 
 
 
119 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2723  50S ribosomal protein L7/L12  58.57 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2409  50S ribosomal protein L7/L12  58.57 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267042  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  62.86 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02191  50S ribosomal protein L7/L12  55.71 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.605695  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1803  50S ribosomal protein L12P  62.69 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0570  50S ribosomal protein L7/L12  58.57 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000202265  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0392  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  58.57 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  58.57 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  58.57 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  58.57 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0563  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000998366  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02771  50S ribosomal protein L7/L12  54.29 
 
 
131 aa  67  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0831676  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0577  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000019471  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  55.71 
 
 
122 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
122 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  51.43 
 
 
126 aa  67  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
123 aa  66.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90602  60S ribosomal protein L7/L12  47.83 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  58.57 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1700  50S ribosomal protein L7/L12  61.19 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357459  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  51.47 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3476  50S ribosomal protein L7/L12  58.21 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145567  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27801  hypothetical protein  51.43 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  58.57 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  65.45 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0311  ribosomal protein L7/L12  56.94 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.181788  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  56.94 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  58.57 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  65.45 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1568  50S ribosomal protein L7/L12  52.86 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  65.45 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0203  50S ribosomal protein L7/L12  52.86 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02211  50S ribosomal protein L7/L12  52.86 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0030  50S ribosomal protein L7/L12  55.71 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0666406  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  56.94 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  58.57 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02191  50S ribosomal protein L7/L12  52.86 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3840  50S ribosomal protein L7/L12  63.64 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00160785  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  58.57 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1823  50S ribosomal protein L7/L12  55.71 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  54.29 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  58.57 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  58.57 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  57.14 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  55.71 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  65.45 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  61.43 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0597  50S ribosomal protein L7/L12  55.71 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0210666  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0262  50S ribosomal protein L12P  51.43 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.314795  normal  0.113093 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1416  50S ribosomal protein L12P  54.29 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000264913  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02301  50S ribosomal protein L7/L12  52.86 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  55.71 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  48.57 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  50.75 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  55.71 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4016  50S ribosomal protein L7/L12  65.45 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.797485  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4385  50S ribosomal protein L7/L12  65.45 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  55.71 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  52.86 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  55.88 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  63.64 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1323  50S ribosomal protein L7/L12  54.29 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.160578 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  54.29 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  55.71 
 
 
125 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  54.29 
 
 
126 aa  62.8  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1144  ribosomal protein L7/L12  55.71 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000177036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  55.71 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0413  50S ribosomal protein L12P  55.71 
 
 
124 aa  62.8  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291542  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  57.75 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0318  50S ribosomal protein L7/L12  52.86 
 
 
126 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132009  hitchhiker  0.00085028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  50.67 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  47.56 
 
 
125 aa  62  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  55.71 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  52.86 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  55.71 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  56.72 
 
 
123 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2468  50S ribosomal protein L7/L12  51.43 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2037  50S ribosomal protein L7/L12  59.7 
 
 
125 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0646478  normal  0.703058 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01080  ribosomal protein L7/L12  52.86 
 
 
123 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381028  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3690  50S ribosomal protein L7/L12  52.86 
 
 
120 aa  61.6  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100711  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1386  50S ribosomal protein L7/L12  52.86 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000070815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>