More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1957 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1957  ribosomal protein L7/L12  100 
 
 
128 aa  236  5.999999999999999e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  57.81 
 
 
123 aa  113  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  52.76 
 
 
128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  57.03 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  57.03 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  49.22 
 
 
121 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00694  50S ribosomal protein L7/L12  57.03 
 
 
125 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000575262  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  48.44 
 
 
121 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 
125 aa  104  4e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  46.92 
 
 
121 aa  104  4e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  53.17 
 
 
129 aa  103  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  48.44 
 
 
122 aa  101  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  48.44 
 
 
122 aa  101  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  46.51 
 
 
129 aa  101  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
121 aa  100  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 
125 aa  100  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  57.81 
 
 
124 aa  100  8e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 
124 aa  99.4  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 
125 aa  99.8  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 
125 aa  99.4  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  57.03 
 
 
124 aa  99.4  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 
126 aa  98.2  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 
125 aa  98.2  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  49.22 
 
 
125 aa  97.8  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  51.56 
 
 
125 aa  97.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 
123 aa  97.8  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0508  50S ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 
125 aa  97.8  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000524403  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0527  50S ribosomal protein L7/L12  58.59 
 
 
125 aa  97.1  8e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.359343  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0311  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 
123 aa  97.1  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0425822  normal  0.0243223 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1457  50S ribosomal protein L7/L12  58.59 
 
 
125 aa  96.3  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000553031  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 
123 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  53.54 
 
 
128 aa  94.7  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  54.92 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0480  ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 
121 aa  95.1  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0478  50S ribosomal protein L7/L12  55.81 
 
 
128 aa  94.4  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0463  50S ribosomal protein L7/L12  55.81 
 
 
128 aa  94.4  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.228162  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  52.34 
 
 
122 aa  94  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 
125 aa  94  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 
124 aa  93.6  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0204  ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
121 aa  93.6  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2675  ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 
126 aa  93.6  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000113086  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0631  50S ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 
128 aa  92.8  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.141708  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 
125 aa  92.8  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2037  50S ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 
125 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0646478  normal  0.703058 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3346  50S ribosomal protein L7/L12  53.49 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.80361  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0287  ribosomal protein L7/L12  50.78 
 
 
123 aa  91.3  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0365313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0209  ribosomal protein L7/L12  49.22 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000161356  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0392  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1017  50S ribosomal protein L7/L12  55.45 
 
 
131 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221809 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1548  ribosomal protein L7/L12  51.18 
 
 
127 aa  90.9  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  52.34 
 
 
124 aa  90.9  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  56.59 
 
 
128 aa  90.9  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  50.78 
 
 
125 aa  90.5  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1737  50S ribosomal protein L7/L12  48.48 
 
 
132 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1761  50S ribosomal protein L7/L12  48.48 
 
 
132 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0639  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
122 aa  89.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.500427  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0597  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 
123 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0210666  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3886  ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
121 aa  89  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.449029  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  52.34 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0162  50S ribosomal protein L7/L12  48.44 
 
 
122 aa  89  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000100689  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 
128 aa  89  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03862  50S ribosomal protein L7/L12  49.22 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000247439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4009  ribosomal protein L7/L12  49.22 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000814927  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4434  50S ribosomal protein L7/L12  49.22 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00187873  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03815  hypothetical protein  49.22 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000273173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  53.97 
 
 
127 aa  88.2  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1175  50S ribosomal protein L7/L12  58.93 
 
 
126 aa  88.6  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000154127  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4219  50S ribosomal protein L7/L12  49.22 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137425  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4474  50S ribosomal protein L7/L12  49.22 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000613838  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4527  50S ribosomal protein L7/L12  49.22 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000174413  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4039  50S ribosomal protein L7/L12  49.22 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00670642  hitchhiker  0.000881188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0150  ribosomal protein L7/L12  46.88 
 
 
122 aa  88.6  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000840717  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5451  50S ribosomal protein L7/L12  49.22 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000730473  hitchhiker  0.0030051 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0196  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
121 aa  88.6  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000850088  normal  0.220465 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1820  ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 
133 aa  87.8  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  54.76 
 
 
126 aa  88.2  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  52.71 
 
 
128 aa  88.2  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0925  50S ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 
126 aa  87.8  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  52.71 
 
 
122 aa  87.8  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  48.76 
 
 
125 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4010  50S ribosomal protein L7/L12  49.15 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0094315  hitchhiker  0.00000000352658 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4394  50S ribosomal protein L7/L12  49.22 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000226611  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4484  50S ribosomal protein L7/L12  49.22 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000110879 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4770  ribosomal protein L7/L12  46.09 
 
 
119 aa  85.9  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  53.72 
 
 
123 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4481  50S ribosomal protein L7/L12  49.22 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102709 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  51.56 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0923  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000276114  hitchhiker  0.0000101769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0748  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0407206  normal  0.893825 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0413  50S ribosomal protein L12P  49.22 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291542  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4558  50S ribosomal protein L7/L12  49.22 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.347891  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0172  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.107771  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4362  50S ribosomal protein L7/L12  49.22 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.993642  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  52.38 
 
 
123 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  51.22 
 
 
126 aa  84.7  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  51.56 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4698  50S ribosomal protein L7/L12  46.09 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000163845  hitchhiker  0.00000529046 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3336  50S ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000195051 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4064  50S ribosomal protein L7/L12  47.66 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00112087  hitchhiker  0.00864262 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2107  50S ribosomal protein L7/L12  52.34 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000324258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>