47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3039 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3039  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 414 aa  835    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.77025 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2645  Tetratricopeptide domain protein  55.42 
 
 		 526 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.528519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3471  Tetratricopeptide domain protein  58.82 
 
 		 526 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2580  TPR repeat-containing protein  41.89 
 
 		 408 aa  272  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.151765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4690  TPR repeat-containing protein  38.54 
 
 		 407 aa  252  7e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.040929  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1403  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 442 aa  225  9e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0926  hypothetical protein  27.13 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  22.58 
 
 		 782 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  26.53 
 
 		 985 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 1060 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.15 
 
 		 991 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  21.85 
 
 		 957 aa  59.7  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  21.24 
 
 		 1238 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1025 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  24.22 
 
 		 2145 aa  56.2  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.79 
 
 		 609 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 1162 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.75 
 
 		 1162 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 438 aa  54.7  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  25.81 
 
 		 809 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  25.96 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 		 1313 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  20.92 
 
 		 788 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  23.01 
 
 		 1550 aa  50.8  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  26.07 
 
 		 694 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  21.31 
 
 		 659 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  25.33 
 
 		 768 aa  50.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.46 
 
 		 636 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  22.67 
 
 		 828 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  22.82 
 
 		 689 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  21.55 
 
 		 1266 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.96 
 
 		 852 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  24.75 
 
 		 2327 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 923 aa  46.6  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  21.43 
 
 		 1914 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  34.31 
 
 		 645 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  23.81 
 
 		 357 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  24.05 
 
 		 1009 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4076  histidine kinase  31.75 
 
 		 667 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249378  normal  0.142572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 872 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  21.25 
 
 		 1714 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  23.34 
 
 		 343 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 850 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  23.17 
 
 		 740 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  20.99 
 
 		 725 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  21.49 
 
 		 745 aa  43.5  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  19.09 
 
 		 1101 aa  43.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>