15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2580 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2580  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 408 aa  813    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.151765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4690  TPR repeat-containing protein  57.11 
 
 		 407 aa  473  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.040929  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1403  TPR repeat-containing protein  37.67 
 
 		 442 aa  273  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3039  Tetratricopeptide domain protein  41.89 
 
 		 414 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.77025 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2645  Tetratricopeptide domain protein  39.12 
 
 		 526 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.528519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3471  Tetratricopeptide domain protein  38.08 
 
 		 526 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0926  hypothetical protein  29.17 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  20.32 
 
 		 782 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  22.15 
 
 		 957 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.49 
 
 		 991 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 1162 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.81 
 
 		 1162 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  20.85 
 
 		 1238 aa  47  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.91 
 
 		 609 aa  46.6  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  21.49 
 
 		 1060 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>