27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3471 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2645  Tetratricopeptide domain protein  99.43 
 
 		 526 aa  1029    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.528519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3471  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 526 aa  1035    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3039  Tetratricopeptide domain protein  55.42 
 
 		 414 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.77025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2580  TPR repeat-containing protein  39.12 
 
 		 408 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.151765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1403  TPR repeat-containing protein  39.18 
 
 		 442 aa  242  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4690  TPR repeat-containing protein  38.4 
 
 		 407 aa  241  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.040929  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0926  hypothetical protein  27.02 
 
 		 419 aa  80.1  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  21.08 
 
 		 782 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 		 1162 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.12 
 
 		 1162 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 1025 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 923 aa  57.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  24.42 
 
 		 2145 aa  57  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4722  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 560 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.57 
 
 		 609 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  26.43 
 
 		 828 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  26.24 
 
 		 809 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.62 
 
 		 991 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  36.27 
 
 		 484 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  22.4 
 
 		 1060 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  27.36 
 
 		 444 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1258  cell wall anchor domain-containing protein  25.44 
 
 		 745 aa  47  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  22.11 
 
 		 343 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  28.37 
 
 		 1550 aa  46.2  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  21.01 
 
 		 985 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 		 1313 aa  45.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  24.81 
 
 		 340 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>