More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2255 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2255  histidine kinase  100 
 
 		 474 aa  956    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000178089 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1337  histidine kinase  34.65 
 
 		 460 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.229526  hitchhiker  0.000353264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1309  histidine kinase  34.65 
 
 		 460 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0954  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 677 aa  140  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 1516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4457  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 674 aa  113  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4649  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 533 aa  107  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.88 
 
 		 730 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 373 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0355  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  28.88 
 
 		 742 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3394  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 728 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.99137  normal  0.249099 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 389 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 389 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  25.71 
 
 		 1172 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 816 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1261 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 		 760 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 884 aa  100  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3525  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.57 
 
 		 1197 aa  100  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 1010 aa  99.8  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 916 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  28.22 
 
 		 765 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 457 aa  98.2  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 625 aa  98.2  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5118  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 		 837 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3379  histidine kinase  29.13 
 
 		 626 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2724  histidine kinase  29.13 
 
 		 626 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 494 aa  97.4  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 643 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 589 aa  97.1  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  30.4 
 
 		 1125 aa  97.1  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 387 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7070  histidine kinase  27.62 
 
 		 456 aa  96.7  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  29.05 
 
 		 648 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  27.8 
 
 		 462 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5361  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 		 897 aa  96.3  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0303077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 752 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 639 aa  96.3  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22580  signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 		 576 aa  96.3  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4387  sensor histidine kinase  31.3 
 
 		 500 aa  95.5  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 979 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1893  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 644 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.15 
 
 		 627 aa  95.5  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 		 827 aa  95.5  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  31.56 
 
 		 1137 aa  95.9  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  31.69 
 
 		 835 aa  94.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.31 
 
 		 498 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 421 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5513  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 1124 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168644  normal  0.269782 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.63 
 
 		 776 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 646 aa  94  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 614 aa  94  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 634 aa  94  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 589 aa  93.6  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.306932  normal  0.158909 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 386 aa  93.6  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 701 aa  93.6  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 583 aa  93.2  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 		 1162 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  30.25 
 
 		 1152 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 725 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.63 
 
 		 1195 aa  93.2  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1039  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 1259 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 1043 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.08 
 
 		 1128 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 		 957 aa  92  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1415  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 514 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  28.25 
 
 		 455 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  28.25 
 
 		 455 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 		 541 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32039  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 499 aa  92  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.31 
 
 		 776 aa  92.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  26.47 
 
 		 1303 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1305  sensor histidine kinase  32.91 
 
 		 514 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179745  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3573  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.16 
 
 		 650 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  31.38 
 
 		 1156 aa  91.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 		 1163 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 		 1203 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 608 aa  91.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  29.83 
 
 		 918 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 		 801 aa  91.3  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09493  two-component system sensor histidine kinase  29.46 
 
 		 511 aa  91.3  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.905001  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0493  histidine kinase  31.25 
 
 		 467 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  29.53 
 
 		 1170 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.52 
 
 		 882 aa  91.3  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 		 571 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.24 
 
 		 914 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 		 373 aa  90.9  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1979  sensory box histidine kinase/response regulator  29.25 
 
 		 771 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 		 1287 aa  90.9  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 		 408 aa  90.5  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  27.35 
 
 		 463 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1000  sensory box histidine kinase/response regulator  29.25 
 
 		 771 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3690  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 		 833 aa  90.5  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.782884 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1289  sensory box histidine kinase/response regulator  29.25 
 
 		 772 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2264  sensory box histidine kinase/response regulator  29.25 
 
 		 771 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.87596  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 639 aa  90.5  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2375  histidine kinase  27.13 
 
 		 806 aa  90.5  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.824997  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 637 aa  90.5  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>