More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_51340 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_51340  transcriptional regulator MvfR  100 
 
 		 332 aa  684    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000816328 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1149  LysR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.229306  normal  0.0812943 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3337  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1422  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.295916  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0421  LysR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 291 aa  97.4  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3798  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3183  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 295 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3184  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 295 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3327  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 295 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2976  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1185  transcriptional regulator, LysR family  25.93 
 
 		 295 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3742  putative transcriptional regulator  25.78 
 
 		 292 aa  89  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0195  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1044  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  28.46 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1825  transcriptional regulator, LysR family protein  26.37 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.401328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2966  LysR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 300 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.812249 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1164  transcriptional regulator, LysR family  28.16 
 
 		 302 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1535  transcriptional regulator, LysR family  25.88 
 
 		 299 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2823  LysR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 299 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2841  LysR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 299 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0545664  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0402  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1724  LysR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0169  transcriptional regulator, LysR family  28.38 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3588  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1136  LysR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0302  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0355  transcriptional regulator, LysR family  25.91 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5842  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328842  hitchhiker  0.000251126 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1683  LysR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4315  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5095  transcriptional regulator, LysR family  28.16 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1881  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.407477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4052  LysR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3488  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0702962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3740  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3257  transcriptional regulator, LysR family  27.78 
 
 		 288 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000024832  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3021  transcriptional regulator, LysR family  27.05 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914893  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7223  LysR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2250  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.75776  normal  0.514799 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0155  transcriptional regulator, LysR family  28.74 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003833  putative transcriptional regulator  26.56 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0216  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1907  LysR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1037  LysR substrate-binding  27.35 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.170285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1689  LysR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0567  LysR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3727  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.837668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2672  LysR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1392  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1614  LysR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0510  LysR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143381  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4156  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1724  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0489  LysR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.013623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0137  LysR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5227  LysR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4696  LysR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.580635  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01849  transcriptional regulator  25.41 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4433  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.942011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2728  LysR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0845  transcriptional regulator, MarR family  24.45 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1712  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0612  LysR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.341398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1349  LysR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000462626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001477  transcriptional regulator  25.96 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.223325  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0537  LysR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.84391  normal  0.0745135 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2797  LysR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0984136  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3204  transcriptional regulator, LysR family  28.3 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.340375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1392  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2935  LysR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4390  LysR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 293 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0392  LysR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05418  transcriptional regulator  25.78 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3381  LysR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0469  LysR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.166611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0632  LysR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2266  LysR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.363264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0449  LysR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2881  LysR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2891  LysR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.578642  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0161  putative transcriptional regulator  24.51 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0599648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0349  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0211  LysR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3018  LysR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402662  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5348  LysR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0816999  normal  0.420046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4338  LysR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6222  LysR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.98213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4978  LysR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.403345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4922  LysR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1342  LysR family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00332672  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4291  transcriptional regulator, LysR family  28.16 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.70034 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0402  LysR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 292 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0779916  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3235  LysR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5494  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1242  LysR family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.310475 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1381  LysR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1130  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.88 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0423  LysR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2808  LysR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2058  LysR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.154037  normal  0.839188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>